pEBFP-N1哺乳荧光质粒

基本信息
名称：pEBFP-N1哺乳荧光质粒
别称: pEBFP-N1

启动子:	CMV
复制子:	pUC
终止子:	SV40 poly(A) signal
质粒分类:	哺乳细胞，荧光蛋白报告载体
原核抗性:	Kan
筛选标记:	G418
克隆菌株:	DH5a
培养条件:	37度
表达宿主:	哺乳细胞
诱导方式:	无须诱导，瞬时表达
5'测序引物:	CMV-F：CGCAAATGGGCGGTAGGCGTG
3'测序引物:	根据序列设计引物

质粒属性

载体宿主：	哺乳细胞
载体用途：	蛋白表达
基因种属：
基因类型：	ORF
原核抗性：	Kan
真核抗性：	Neo/G418
荧光蛋白：	蓝色

质粒简介
    pEBFP-N1 carries a blue fluorescent variant of the Aequorea victoria green fluorescent protein gene (GFP). The EBFP gene contains four amino acid substitutions. The Tyr-66 to His substitution gives EBFP fluorescence excitation and emission maxima (380 and 440 nm, respectively) similar to other blue emission variants (1–3). The other three substitutions (Phe-64 to Leu; Ser-65 to Thr; and Tyr- 145 to Phe) enhance the brightness and solubility of the protein, primarily due to improved proteinfolding properties and efficiency of chromophore formation (1, 4, 5). The Em of EBFP is 31,000 cm–1M–1 for 380-nm excitation, leading to a fluorescent signal that is 2–3-fold brighter than other blue variants of GFP and roughly equivalent to wt GFP. In addition, the rate of photobleaching of EBFP is one-half to one-third that of P4-3, a popular predecessor to EBFP (1). EBFP contains >190 silent mutations that create an open reading frame comprised almost entirely of preferred human codons (6). Furthermore, upstream sequences flanking EBFP have been converted to a Kozak consensus translation initiation site (7). These changes increase the translational efficiency of the EBFP mRNA and consequently the expression of EBFP in mammalian and plant cells.

质粒图谱


质粒序列

LOCUS       Exported                4733 bp ds-DNA     circular SYN 28-AUG-2017
DEFINITION  synthetic circular DNA
ACCESSION   .
VERSION     .
KEYWORDS    pEBFP-N1
SOURCE      synthetic DNA construct
  ORGANISM  synthetic DNA construct
REFERENCE   1  (bases 1 to 4733)
  AUTHORS   .
  TITLE     Direct Submission
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..4733
                     /organism="synthetic DNA construct"
                     /mol_type="other DNA"
     enhancer        61..364
                     /note="CMV enhancer"
                     /note="human cytomegalovirus immediate early enhancer"
     promoter        365..568
                     /note="CMV promoter"
                     /note="human cytomegalovirus (CMV) immediate early 
                     promoter"
     misc_feature    591..671
                     /note="MCS"
                     /note="multiple cloning site"
     regulatory      673..682
                     /regulatory_class="other"
                     /note="Kozak sequence"
                     /note="vertebrate consensus sequence for strong initiation 
                     of translation (Kozak, 1987)"
     CDS             679..1398
                     /codon_start=1
                     /product="enhanced blue variant of GFP"
                     /note="EBFP"
                     /note="mammalian codon-optimized"
                     /translation="MVSKGEELFTGVVPILVELDGDVNGHKFSVSGEGEGDATYGKLTL
                     KFICTTGKLPVPWPTLVTTLTHGVQCFSRYPDHMKQHDFFKSAMPEGYVQERTIFFKDD
                     GNYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYNFNSHNVYIMADKQKNGIK
                     VNFKIRHNIEDGSVQLADHYQQNTPIGDGPVLLPDNHYLSTQSALSKDPNEKRDHMVLL
                     EFVTAAGITLGMDELYK"
     polyA_signal    1521..1642
                     /note="SV40 poly(A) signal"
                     /note="SV40 polyadenylation signal"
     rep_origin      complement(1649..2104)
                     /direction=LEFT
                     /note="f1 ori"
                     /note="f1 bacteriophage origin of replication; arrow 
                     indicates direction of (+) strand synthesis"
     promoter        2131..2235
                     /gene="bla"
                     /note="AmpR promoter"
     promoter        2237..2594
                     /note="SV40 promoter"
                     /note="SV40 enhancer and early promoter"
     rep_origin      2445..2580
                     /note="SV40 ori"
                     /note="SV40 origin of replication"
     CDS             2629..3423
                     /codon_start=1
                     /gene="aph(3')-II (or nptII)"
                     /product="aminoglycoside phosphotransferase from Tn5"
                     /note="NeoR/KanR"
                     /note="confers resistance to neomycin, kanamycin, and G418 
                     (Geneticin(R))"
                     /translation="MIEQDGLHAGSPAAWVERLFGYDWAQQTIGCSDAAVFRLSAQGRP
                     VLFVKTDLSGALNELQDEAARLSWLATTGVPCAAVLDVVTEAGRDWLLLGEVPGQDLLS
                     SHLAPAEKVSIMADAMRRLHTLDPAT-CPFDHQAKHRIERARTRMEAGLVDQDDLDEEHQ
                     GLAPAELFARLKASMPDGEDLVVTHGDACLPNIMVENGRFSGFIDCGRLGVADRYQDIA
                     LATRDIAEELGGEWADRFLVLYGIAAPDSQRIAFYRLLDEFF"
     polyA_signal    3655..3702
                     /note="HSV TK poly(A) signal"
                     /note="herpes simplex virus thymidine kinase 
                     polyadenylation signal (Cole and Stacy, 1985)"
     rep_origin      4031..4619
                     /direction=RIGHT
                     /note="ori"
                     /note="high-copy-number ColE1/pMB1/pBR322/pUC origin of 
                     replication"
ORIGIN
        1 tagttattaa tagtaatcaa ttacggggtc attagttcat agcccatata tggagttccg
       61 cgttacataa cttacggtaa atggcccgcc tggctgaccg cccaacgacc cccgcccatt
      121 gacgtcaata atgacgtatg ttcccatagt aacgccaata gggactttcc attgacgtca
      181 atgggtggag tatttacggt aaactgccca cttggcagta catcaagtgt atcatatgcc
      241 aagtacgccc cctattgacg tcaatgacgg taaatggccc gcctggcatt atgcccagta
      301 catgacctta tgggactttc ctacttggca gtacatctac gtattagtca tcgctattac
      361 catggtgatg cggttttggc agtacatcaa tgggcgtgga tagcggtttg actcacgggg
      421 atttccaagt ctccacccca ttgacgtcaa tgggagtttg ttttggcacc aaaatcaacg
      481 ggactttcca aaatgtcgta acaactccgc cccattgacg caaatgggcg gtaggcgtgt
      541 acggtgggag gtctatataa gcagagctgg tttagtgaac cgtcagatcc gctagcgcta
      601 ccggactcag atctcgagct caagcttcga attctgcagt cgacggtacc gcgggcccgg
      661 gatccaccgg tcgccaccat ggtgagcaag ggcgaggagc tgttcaccgg ggtggtgccc
      721 atcctggtcg agctggacgg cgacgtaaac ggccacaagt tcagcgtgtc cggcgagggc
      781 gagggcgatg ccacctacgg caagctgacc ctgaagttca tctgcaccac cggcaagctg
      841 cccgtgccct ggcccaccct cgtgaccacc ctgacccacg gcgtgcagtg cttcagccgc
      901 taccccgacc acatgaagca gcacgacttc ttcaagtccg ccatgcccga aggctacgtc
      961 caggagcgca ccatcttctt caaggacgac ggcaactaca agacccgcgc cgaggtgaag
     1021 ttcgagggcg acaccctggt gaaccgcatc gagctgaagg gcatcgactt caaggaggac
     1081 ggcaacatcc tggggcacaa gctggagtac aacttcaaca gccacaacgt ctatatcatg
     1141 gccgacaagc agaagaacgg catcaaggtg aacttcaaga tccgccacaa catcgaggac
     1201 ggcagcgtgc agctcgccga ccactaccag cagaacaccc ccatcggcga cggccccgtg
     1261 ctgctgcccg acaaccacta cctgagcacc cagtccgccc tgagcaaaga ccccaacgag
     1321 aagcgcgatc acatggtcct gctggagttc gtgaccgccg ccgggatcac tctcggcatg
     1381 gacgagctgt acaagtaaag cggccgcgac tctagatcat aatcagccat accacatttg
     1441 tagaggtttt acttgcttta aaaaacctcc cacacctccc cctgaacctg aaacataaaa
     1501 tgaatgcaat tgttgttgtt aacttgttta ttgcagctta taatggttac aaataaagca
     1561 atagcatcac aaatttcaca aataaagcat ttttttcact gcattctagt tgtggtttgt
     1621 ccaaactcat caatgtatct taaggcgtaa attgtaagcg ttaatatttt gttaaaattc
     1681 gcgttaaatt tttgttaaat cagctcattt tttaaccaat aggccgaaat cggcaaaatc
     1741 ccttataaat caaaagaata gaccgagata gggttgagtg ttgttccagt ttggaacaag
     1801 agtccactat taaagaacgt ggactccaac gtcaaagggc gaaaaaccgt ctatcagggc
     1861 gatggcccac tacgtgaacc atcaccctaa tcaagttttt tggggtcgag gtgccgtaaa
     1921 gcactaaatc ggaaccctaa agggagcccc cgatttagag cttgacgggg aaagccggcg
     1981 aacgtggcga gaaaggaagg gaagaaagcg aaaggagcgg gcgctagggc gctggcaagt
     2041 gtagcggtca cgctgcgcgt aaccaccaca cccgccgcgc ttaatgcgcc gctacagggc
     2101 gcgtcaggtg gcacttttcg gggaaatgtg cgcggaaccc ctatttgttt atttttctaa
     2161 atacattcaa atatgtatcc gctcatgaga caataaccct gataaatgct tcaataatat
     2221 tgaaaaagga agagtcctga ggcggaaaga accagctgtg gaatgtgtgt cagttagggt
     2281 gtggaaagtc cccaggctcc ccagcaggca gaagtatgca aagcatgcat ctcaattagt
     2341 cagcaaccag gtgtggaaag tccccaggct ccccagcagg cagaagtatg caaagcatgc
     2401 atctcaatta gtcagcaacc atagtcccgc ccctaactcc gcccatcccg cccctaactc
     2461 cgcccagttc cgcccattct ccgccccatg gctgactaat tttttttatt tatgcagagg
     2521 ccgaggccgc ctcggcctct gagctattcc agaagtagtg aggaggcttt tttggaggcc
     2581 taggcttttg caaagatcga tcaagagaca ggatgaggat cgtttcgcat gattgaacaa
     2641 gatggattgc acgcaggttc tccggccgct tgggtggaga ggctattcgg ctatgactgg
     2701 gcacaacaga caatcggctg ctctgatgcc gccgtgttcc ggctgtcagc gcaggggcgc
     2761 ccggttcttt ttgtcaagac cgacctgtcc ggtgccctga atgaactgca agacgaggca
     2821 gcgcggctat cgtggctggc cacgacgggc gttccttgcg cagctgtgct cgacgttgtc
     2881 actgaagcgg gaagggactg gctgctattg ggcgaagtgc cggggcagga tctcctgtca
     2941 tctcaccttg ctcctgccga gaaagtatcc atcatggctg atgcaatgcg gcggctgcat
     3001 acgcttgatc cggctacctg cccattcgac caccaagcga aacatcgcat cgagcgagca
     3061 cgtactcgga tggaagccgg tcttgtcgat caggatgatc tggacgaaga gcatcagggg
     3121 ctcgcgccag ccgaactgtt cgccaggctc aaggcgagca tgcccgacgg cgaggatctc
     3181 gtcgtgaccc atggcgatgc ctgcttgccg aatatcatgg tggaaaatgg ccgcttttct
     3241 ggattcatcg actgtggccg gctgggtgtg gcggaccgct atcaggacat agcgttggct
     3301 acccgtgata ttgctgaaga gcttggcggc gaatgggctg accgcttcct cgtgctttac
     3361 ggtatcgccg ctcccgattc gcagcgcatc gccttctatc gccttcttga cgagttcttc
     3421 tgagcgggac tctggggttc gaaatgaccg accaagcgac gcccaacctg ccatcacgag
     3481 atttcgattc caccgccgcc ttctatgaaa ggttgggctt cggaatcgtt ttccgggacg
     3541 ccggctggat gatcctccag cgcggggatc tcatgctgga gttcttcgcc caccctaggg
     3601 ggaggctaac tgaaacacgg aaggagacaa taccggaagg aacccgcgct atgacggcaa
     3661 taaaaagaca gaataaaacg cacggtgttg ggtcgtttgt tcataaacgc ggggttcggt
     3721 cccagggctg gcactctgtc gataccccac cgagacccca ttggggccaa tacgcccgcg
     3781 tttcttcctt ttccccaccc caccccccaa gttcgggtga aggcccaggg ctcgcagcca
     3841 acgtcggggc ggcaggccct gccatagcct caggttactc atatatactt tagattgatt
     3901 taaaacttca tttttaattt aaaaggatct aggtgaagat cctttttgat aatctcatga
     3961 ccaaaatccc ttaacgtgag ttttcgttcc actgagcgtc agaccccgta gaaaagatca
     4021 aaggatcttc ttgagatcct ttttttctgc gcgtaatctg ctgcttgcaa acaaaaaaac
     4081 caccgctacc agcggtggtt tgtttgccgg atcaagagct accaactctt tttccgaagg
     4141 taactggctt cagcagagcg cagataccaa atactgtcct tctagtgtag ccgtagttag
     4201 gccaccactt caagaactct gtagcaccgc ctacatacct cgctctgcta atcctgttac
     4261 cagtggctgc tgccagtggc gataagtcgt gtcttaccgg gttggactca agacgatagt
     4321 taccggataa ggcgcagcgg tcgggctgaa cggggggttc gtgcacacag cccagcttgg
     4381 agcgaacgac ctacaccgaa ctgagatacc tacagcgtga gctatgagaa agcgccacgc
     4441 ttcccgaagg gagaaaggcg gacaggtatc cggtaagcgg cagggtcgga acaggagagc
     4501 gcacgaggga gcttccaggg ggaaacgcct ggtatcttta tagtcctgtc gggtttcgcc
     4561 acctctgact tgagcgtcga tttttgtgat gctcgtcagg ggggcggagc ctatggaaaa
     4621 acgccagcaa cgcggccttt ttacggttcc tggccttttg ctggcctttt gctcacatgt
     4681 tctttcctgc gttatcccct gattctgtgg ataaccgtat taccgccatg cat
//
质粒菌株产品操作说明书
一、扩增流程
         收到产品后，请先根据产品管壁标签来判断产品形式，并在扩增前准确查找该质粒菌株的抗性、感受态和培养温度。
         1、质粒干粉（常温运输，存于-20度，90天保质期，请务必转化挑单克隆培养，不要直接使用和测序）
              ①收到质粒干粉后请先5000rpm离心1min，再加入20μl ddH2O去离子水溶解质粒；
              ②取1支100μl 感受态于冰上解冻10min，加入2μl质粒，再冰浴30min后，42℃热激60s，不要搅动，再冰浴2min；（从第二步开始均要在超净工作台中无菌操作）
              ③加入900μl无抗的LB液体培养基，180rpm震荡37℃培养45min；
              ④6000rpm离心5min，仅留100μl上清液重悬细菌沉淀，并涂布至目标质粒抗性的LB平板上；（可使用本平台的平板涂布专用玻璃珠进行涂布，可以比传统涂布方法获得更多转化子）
              ⑤将平板正向培养1h，再倒置37℃培养14h。如果要求是30度则培养20h；
（菌落过多则将质粒稀释后再转化。没有菌落则加入10μl质粒转化。另不要直接转表达感受态，要先转克隆感受态，重提质粒后再导入表达感受态）
              ⑥挑取单菌落至LB液体培养基中，加入对应抗生素，220rpm震荡培养14h，根据实验需要和质粒提取试剂盒说明书提取质粒。
        2、甘油菌种（冰袋运输，存于-80℃，保质期90天，请务必划线挑单克隆培养）
              四区划线后挑单菌落培养，酵母菌需要先液体复苏再四区划线，再挑单菌落液体培养。
        3、穿刺菌种（冰袋运输，存于4℃，保质期7天）
              穿刺接种，液体培养后四区划线，再挑单菌落液体培养。
        4、菌落平板（冰袋运输，存于4℃，保质期7天）
              直接挑取单菌落至液体培养基中。
        5、液体质粒（冰袋运输，存于-20℃，保质期90天）
              单独提取的液体质粒收到后可直接使用。
        6、滤纸质粒（常温运输，存于-20度，90天保质期，请务必转化挑单克隆培养，不要直接使用和测序）
              收到货后将滤纸画圈部分剪下放入EP管中，加100ul无菌水将滤纸浸湿并浸泡5min，吸取5ul质粒转化，离心全涂。

二、转化图片

P3449/pENTR223-SHISA5人源基因质粒

P3450/pENTR223-PAGE4人源基因质粒

P3451/pENTR223-EMC4人源基因质粒

P3452/pENTR223-PHF20L1人源基因质粒

P3453/pENTR223-NIPSNAP2人源基因质粒

P3454/pENTR223-MRPS5人源基因质粒

P3455/pENTR223-IL1A人源基因质粒

P3456/pENTR223-MS4A12（1同义突变）人源基因质粒

P3457/pENTR223-RNF32人源基因质粒

P3458/pENTR223-ZNF501（28-816bp）人源基因质粒