用于中枢神经系统肿瘤快速分子分型平台的前瞻性多中心验证

分子数据整合在中心神经系统（CNS）肿瘤诊断中发挥着核心作用，但当前使用的检测方法因技术复杂性、设备与试剂成本高以及周转时间长而存在局限。我们先前报道了Rapid-CNS2的开发，这是一种基于自适应采样的纳米孔测序工作流程。本研究对Rapid-CNS2进行了全面验证并进一步开发其术中应用功能。该方案现可在30分钟术中窗口期内提供实时甲基化分类与DNA拷贝数信息，并在24小时内完成全面分子谱分析，覆盖相应实体瘤诊断与治疗所需的完整信息谱。我们在多中心环境下对301份存档样本及前瞻性样本（包括18份术中测序样本）验证了Rapid-CNS2的性能。为拓展基于甲基化的CNS肿瘤分类应用范围，我们开发了MNP-Flex——一个包含184个类别的跨平台甲基化分类器。在全球验证队列超过78,000份涵盖五种不同技术的冷冻及福尔马林固定石蜡包埋样本中，MNP-Flex在临床适用阈值下实现了甲基化家族99.6%的准确率与甲基化类别99.2%的准确率。这些工具的整合有望通过广泛提供快速、可操作的分子见解（这对个性化治疗策略至关重要）来推动CNS肿瘤诊断的发展。