尿液EV蛋白质组学发现阶段
鉴定重度子痫前期和正常血压妊娠之间差异表达的EV蛋白,筛选候选分子。
收集sPE(n=15)和NTP(n=15)尿样,分离EV并进行无偏蛋白质组学分析,通过PCA、层次聚类和倍数变化筛选差异蛋白,选择vasorin作为重点关注分子。
Decreased Extracellular Vesicle Vasorin in Severe Preeclampsia Plasma Mediates Endothelial Dysfunction
本研究包含多层次的独立证据:无偏蛋白质组学发现、人类样本(血浆、胎盘、尿液EV)验证、小鼠PE模型验证、体外功能实验(内皮细胞迁移、主动脉环血管反应)、以及RNA测序机制分析,证据层级涵盖分子、细胞、离体组织及动物模型。
人主动脉内皮细胞(HAEC) 小鼠主动脉环 小鼠sFLT-1过表达子痫前期模型 人胎盘外植体培养
尿液EV蛋白质组学队列:sPE(n=15)与NTP(n=15) 血浆EV和胎盘vasorin水平:sPE(n=47)与NTP(n=52) 小鼠PE模型:AD-sFLT-1注射剂量2.5×10^9 PFU,孕11.5天和15.5天,观察至孕18.5天 HAEC迁移实验:sPE EVs处理24小时,vasorin过表达(AD-VASN)和敲低(AD-shVASN) 血管反应实验:小鼠主动脉环,乙酰胆碱和硝普钠诱导的血管舒张
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定重度子痫前期和正常血压妊娠之间差异表达的EV蛋白,筛选候选分子。
收集sPE(n=15)和NTP(n=15)尿样,分离EV并进行无偏蛋白质组学分析,通过PCA、层次聚类和倍数变化筛选差异蛋白,选择vasorin作为重点关注分子。
验证vasorin在重度子痫前期患者血浆EV和胎盘中的表达变化。
分离sPE(n=47)和NTP(n=52)血浆EV,进行Western blot和RT-qPCR检测vasorin蛋白和mRNA水平;收集胎盘组织进行Western blot和RT-qPCR。
在sFLT-1过表达的小鼠PE模型中评估vasorin水平的变化。
孕鼠在E11.5和E15.5尾静脉注射AD-sFLT-1或对照AD-eGFP(2.5×10^9 PFU),在E15.5、E17.5、E19.5收集胎盘和血浆EV,检测vasorin水平。
评估sPE EVs对血管功能和内皮细胞迁移的影响,并验证vasorin在其中作用。
使用sPE和NTP血浆EV处理小鼠主动脉环和HAEC,检测乙酰胆碱诱导的血管舒张和伤口愈合迁移;并用AD-VASN或AD-shVASN过表达或敲低vasorin,观察效应逆转。
探究vasorin调控的基因和信号通路。
HAEC中过表达或敲低vasorin后提取RNA进行RNA-seq,鉴定差异表达基因并进行通路富集分析。
验证胎盘来源EV中vasorin含量与生理状态相关,及对HAEC迁移的影响。
从人NTP(n=6)和sPE(n=6)胎盘外植体培养上清中分离EV,检测vasorin水平和EV特征;用Plex-EV处理HAEC进行划痕实验,评估迁移影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| EV分离 | ExoQuick-TC试剂盒 | System Bioscience, Inc. | -- |
| Western blot | Halt蛋白酶抑制剂混合物 | Fisher Scientific | PI78429 |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | -- | -- |
| RNA分离 | RNeasy试剂盒 | Qiagen | -- |
| 无RNase的DNase套装 | Qiagen | -- | |
| PCR | TaqMan引物/探针套装 | Thermo Fisher Scientific | 4331182 |
| Premix Ex Taq预混液 | Takara Bio | -- | |
| EV表征 | 透射电子显微镜 | -- | -- |
| NanoSight NS300纳米颗粒分析仪 | Malvern Panalytical | -- | |
| 免疫荧光 | TSG101抗体 | Abcam | ab83 |
| vasorin抗体 | Abcam | ab156868 | |
| Alexa Fluor标记二抗 | Cell Signaling Technology | 4409 | |
| PKH67荧光染料 | Sigma | PKH67GL | |
| 细胞核染色 | DAPI染料 | Invitrogen/Thermo Fisher Scientific | -- |
| Western blot | vasorin抗体 | Cell Signaling Technology | -- |
| TSG101抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 血管紧张素原抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| β-肌动蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 山羊抗兔辣根过氧化物酶二抗 | Cell Signaling Technology | -- | |
| ChemiDoc凝胶成像系统 | Bio-Rad Laboratories | -- | |
| RNA分析 | Agilent 2100生物分析仪 | Agilent Technologies | -- |
| PCR | Rotor-Gene Q实时荧光定量PCR仪 | Qiagen | -- |
| RNA-seq | NovaseqXPlus测序仪 | Illumina | -- |
| 细胞迁移实验 | AmScope显微镜 | AmScope | -- |
| ImageJ软件 | National Institutes of Health | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者队列 | sPE组和NTP组的纳入标准、样本量(sPE n=47, NTP n=52)、排除标准、BMI匹配情况 阅读提示:Methods: Patient Population |
| 尿液EV分离 | 尿液采集体积、蛋白酶抑制剂类型、离心条件(1600g 10分钟)、EV沉淀试剂盒或超速离心方法 阅读提示:Methods: Isolation of EVs From Urine Samples;Data S1 |
| 血浆EV分离 | 全血采集时间点、抗凝剂(EDTA-K2)、离心条件(3000g 20分钟)、EV分离方法 阅读提示:Methods: Patient Population;Isolation of EVs From Urine Samples(Data S1) |
| 胎盘外植体培养 | 胎盘组织样本量(sPE n=6, NTP n=6)、外植体大小(2-3mm)、培养条件(RPMI 1640, 37°C, 5% CO2, 24小时)、EV分离(ExoQuick-TC) 阅读提示:Methods: Placental Explant Culture;Isolation of EV From Placental Explant Cultures |
| 小鼠模型 | 小鼠品系、性别、数量(n=10 males, n=30 females)、注射剂量(2.5×10^9 PFU)、注射时间(E11.5, E15.5)、注射方式(retroorbital sinus)、测量时间点(E15.5, E17.5, E19.5)、血压测量方法 阅读提示:Methods: Murine Model of Preeclampsia;Figure 3 legend |
| 血管舒张功能检测 | 主动脉环制备、孵育条件(EV处理24小时,AD-VASN/AD-shVASN处理)、肌动描记参数(去氧肾上腺素预收缩浓度、乙酰胆碱浓度梯度、SNP浓度) 阅读提示:Methods: Vascular Function Studies(如果文中未明确,需查看Data S1或图例);Figure 4 legend |
| HAEC迁移实验 | 细胞培养条件(HAEC来源、代数)、EV处理浓度和时间(24小时)、划痕方法、伤口愈合计算方式 阅读提示:Methods: Cell Migration Assay;Figure 5 legend |
| RNA-seq | 细胞处理(AD-VASN, AD-shVASN, AD-eGFP)、RNA提取方法、文库构建平台(NovoseqXPlus)、比对和差异表达分析参数(阈值fold change≥2, q<0.05) 阅读提示:Methods: RNA Isolation and Analysis;Figure 6 legend |
| Western blot | 抗体来源、稀释比例(如vasorin抗体1:5000)、内参选择(TSG101、β-Actin)、定量方法 阅读提示:Methods: Western Blot Analysis;Figure 2 legend |