建立条件性基因敲除小鼠模型
在神经外胚层细胞中特异性敲除IL-12或IL-23受体,以区分两者在AD病理中的作用。
将APPPS1小鼠与Il12rb2fl/fl或Il23rfl/fl小鼠及NestinCre小鼠杂交,获得APPPS1.NestinCre.Il12rb2fl/fl和APPPS1.NestinCre.Il23rfl/fl小鼠。
Interleukin-12 signaling drives Alzheimer's disease pathology through disrupting neuronal and oligodendrocyte homeostasis
包含体外细胞培养、体内基因敲除小鼠模型、单核转录组测序、人类脑组织样本分析及脂质组学等多层级验证,并涵盖功能与机制研究。
APPPS1小鼠模型 Il12rb2条件性敲除小鼠(APPPS1.NestinCre.Il12rb2fl/fl) Il23r条件性敲除小鼠(APPPS1.NestinCre.Il23rfl/fl) 人类死后脑组织样本
确认IL-12受体(Il12rb1和Il12rb2)在神经元和少突胶质细胞中的表达,以及IL-23受体(Il23r)的缺乏 通过条件性基因敲除验证IL-12信号对AD病理的影响,并排除IL-23的参与 测量脑组织中淀粉样蛋白-β水平的变化(ELISA) 评估成熟少突胶质细胞数量及髓鞘完整性(免疫组化、电子显微镜) 评估小胶质细胞吞噬功能(体外吞噬实验)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
在神经外胚层细胞中特异性敲除IL-12或IL-23受体,以区分两者在AD病理中的作用。
将APPPS1小鼠与Il12rb2fl/fl或Il23rfl/fl小鼠及NestinCre小鼠杂交,获得APPPS1.NestinCre.Il12rb2fl/fl和APPPS1.NestinCre.Il23rfl/fl小鼠。
检测敲除IL-12或IL-23受体对脑内Aβ沉积的影响。
提取脑组织可溶性和不溶性蛋白组分,使用ELISA检测Aβ1-40和Aβ1-42水平。
无偏倚地研究IL-12信号缺失对海马细胞组成和基因表达的影响。
分离250日龄WT、APPPS1和APPPS1.Il12b−/−小鼠的海马核,进行snRNA-seq,并分析细胞类型比例、差异表达基因及轨迹。
确认IL-12和IL-23受体在特定细胞类型中的表达模式。
通过smFISH检测小鼠脑组织中Il12rb1、Il12rb2和Il23r mRNA的分布。
检查IL-12信号对成熟少突胶质细胞数量和髓鞘结构的影响。
通过免疫组化检测Olig2、CC1、MBP,并用电子显微镜分析髓鞘厚度和g-ratio。
验证IL-12直接作用于神经元和少突胶质细胞,导致髓鞘形成受损和细胞死亡。
用IL-12p70或IL-12p80处理胚胎脊髓共培养体系,评估髓鞘形成、细胞存活和凋亡。
检查IL-12信号对PV+中间神经元数量及小胶质细胞吞噬功能的影响。
通过免疫组化计数PV+神经元,并用荧光微球吞噬实验评估小胶质细胞吞噬活性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 蛋白质提取 | cOmplete Mini蛋白酶抑制剂混合物片剂 | Roche | 11836153001 |
| ELISA检测 | MultiSpot人6E10 Aβ三重复合物检测试剂盒 | Meso Scale Diagnostics | -- |
| 蛋白质定量 | QuantiPro BCA蛋白定量试剂盒 | Pierce | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Thermo Fisher Scientific | D6546-6X500ML |
| 胰岛素-转铁蛋白-硒(ITS-G) | Thermo Fisher Scientific | 41400045 | |
| 成纤维细胞生长因子-2 | -- | -- | |
| 血小板衍生生长因子-AA | -- | -- | |
| IL-12p70 | PeproTech | 210-12 | |
| IL-12p80 | PeproTech | 210-12P80H | |
| IL-23 | -- | -- | |
| 免疫组化 | Olig2抗体 | Millipore | AB9610 |
| CC1抗体 | Merck | OP80-100UG | |
| MBP抗体 | Bio-Rad | MCA409S | |
| PV抗体 | Millipore | MAB1572 | |
| Clec7a抗体 | InvivoGen | mapg-mdect | |
| Iba1抗体 | Wako | 019-19741 | |
| 4G8抗体 | Covance | SIG39320 | |
| Alexa Fluor 568山羊抗兔二抗 | Invitrogen | A11011 | |
| Alexa Fluor 488山羊抗小鼠IgG二抗 | Invitrogen | A11001 | |
| Alexa Fluor 488山羊抗小鼠IgG2b二抗 | Invitrogen | A21141 | |
| Alexa Fluor 647山羊抗兔二抗 | Invitrogen | A21244 | |
| Cy3驴抗大鼠IgG二抗 | Jackson ImmunoResearch | 712-165-153 | |
| Alexa Fluor 488山羊抗大鼠二抗 | Dianova | 112-545-003 | |
| DAPI | -- | -- | |
| smFISH | RNAscope多重荧光试剂盒v2 | Bio-Techne | 323110 |
| 蛋白酶IV | Bio-Techne | 322340 | |
| HybEZ杂交系统 | Bio-Techne | 321711 | |
| Opal 520 | PerkinElmer | FP1487001KT | |
| Opal 570 | PerkinElmer | FP1488001KT | |
| Opal 690 | PerkinElmer | FP1497001KT | |
| snRNA-seq | EZ PREP裂解缓冲液 | Sigma-Aldrich | NUC-101 |
| Chromium Next GEM单细胞3' GEM、文库和凝胶珠试剂盒v3.1 | 10x Genomics | PN-1000121 | |
| BD FACSAria III流式细胞仪 | BD | -- | |
| Keyence BZX-710显微镜 | Keyence | -- | |
| Illumina HiSeq 4000测序仪 | Illumina | -- | |
| Bulk RNA-seq | NucleoSpin miRNA和RNA纯化试剂盒 | Macherey Nagel | 740971.50 |
| 组织研磨器 | VWR | 431-0100 | |
| 23号针头 | B. Braun | 465 7667 | |
| STAR | -- | -- | |
| featureCounts | -- | -- | |
| DESeq2 | -- | -- | |
| 脂质组学 | SPLASH LIPIDOMIX标准品 | Avanti Polar Lipids | -- |
| d7-sphinganine | Avanti Polar Lipids | -- | |
| d7-sphingosine | Avanti Polar Lipids | -- | |
| dihydroceramide | Avanti Polar Lipids | -- | |
| ceramide | Avanti Polar Lipids | -- | |
| deoxydihydroceramide | Avanti Polar Lipids | -- | |
| deoxyceramide | Avanti Polar Lipids | -- | |
| glucosylceramides | Avanti Polar Lipids | -- | |
| Transcend UHPLC泵 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Q-Exactive质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Compound Discoverer 3.3.2.31 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 电子显微镜 | Leica VT1200S振动切片机 | Leica | -- |
| LEO912电子显微镜 | Zeiss | -- | |
| Uranyless染色剂 | Science Services | -- | |
| Formvar | Plano | -- | |
| ImageJ | -- | -- | |
| 细胞培养 | Fluoresbrite羧化微球 | Polysciences Europe | -- |
| qPCR | High-Capacity cDNA逆转录试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 4368813 |
| TaqMan Fast Universal Master | Thermo Fisher Scientific | 4364103 | |
| QuantStudio 6 Flex | Applied Biosystems | -- | |
| ELISA | 人IL-12p70高灵敏度ELISA试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | BMS238HS |
| 细胞因子检测 | V-Plex细胞因子Panel 1人试剂盒 | Meso Scale Diagnostics | K15959D-1 |
| 蛋白质印迹 | Actin抗体 | -- | -- |
| pSTAT4抗体 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型生成 | 小鼠品系:APPPS1、Il12b−/−、Il12rb2fl/fl、Il23rfl/fl、NestinCre;遗传背景C57BL/6J 阅读提示:Methods:Mice |
| 条件性基因敲除 | Cre介导的重组;验证Il12rb2和Il23r外显子切除效果 阅读提示:Methods:Mice;Figure 1 legend |
| Aβ测量 | 蛋白提取方法(TBS、Triton-X、SDS);ELISA试剂盒(6E10) 阅读提示:Methods:Mouse brain tissue protein extraction and quantification |
| 单核RNA测序 | 小鼠年龄(250天);海马组织;核分离缓冲液(EZ PREP);测序平台(Chromium 10x) 阅读提示:Methods:snRNA-seq |
| 少突胶质细胞定量 | 免疫组化抗体(Olig2、CC1);脑区(海马、皮层、胼胝体) 阅读提示:Methods:Immunohistochemical stainings |
| 髓鞘分析 | MBP免疫组化;电子显微镜(g-ratio测量) 阅读提示:Methods:Electron microscopy imaging |
| 小胶质细胞吞噬实验 | 小鼠年龄(90天);急性脑片制备;荧光微球浓度(8.4×10^6/孔) 阅读提示:Methods:Preparation of acute cortical brain slices |
| 体外细胞培养 | E13小鼠脊髓;IL-12p70浓度(10 ng/ml);IL-12p80浓度(5 ng/ml);处理时间(DIV12至DIV30) 阅读提示:Methods:Myelinating mouse spinal cord and primary oligodendrocyte cell cultures |
| 人类组织分析 | 人类死后脑组织来源(Charité、UF HBTB);伦理许可;qPCR和ELISA方法 阅读提示:Methods:Human postmortem CNS tissue gene and protein expression analyses |