PDHB基因错义突变:丙酮酸脱氢酶缺乏症患者的识别及体外致病性验证

A missense mutation in PDHB gene: identification of the patient with pyruvate dehydrogenase deficiency and demonstration of pathogenicity in vitro

作者信息Ying Li, Lin Cheng, Xin Li, Jiyu Liu, Lu Yi, Tao Bo
PMID40050878
发布时间2025-03-06
DOI10.1186/s13052-025-01917-9

实验完整度

包含临床病例、基因分析及体外细胞转染实验,但未进行动物模型或患者样本的功能验证。

主要模型

293T细胞(转染野生型或突变型PDHB载体) 新生儿病例(携带PDHB纯合突变)

重点核对

PDHB突变位点:c.575G>T(p.Arg192Leu) 转染细胞类型:293T细胞 PDH活性检测时间:转染后48小时 Western blot检测PDH蛋白表达 qPCR检测PDHB mRNA表达

摘要

背景:丙酮酸脱氢酶(PDH)缺乏症是一种不常见的疾病,是原发性难治性乳酸酸中毒的原因,而PDH E1β(PDHB)亚基基因突变很少导致PDH缺乏症。我们描述了一名PDH缺乏症新生儿中的PDHB基因错义突变,并在体外验证了该突变损害PDH活性。方法:采用全外显子测序(WES)发现错义突变。我们构建了含有全长野生型(NM_000925.4)或突变型(c.575G>T)PDHB基因的重组真核表达载体phage-PDHB-wt/mut,并将载体转染至293T细胞。采用Western blot评估PDH蛋白稳定性,并测定PDH活性。结果:一名37周胎龄男婴出现难治性乳酸酸中毒、生长迟缓和神经发育异常,伴有异常脑磁共振(MR)表现,自3个月大时开始出现惊厥发作。WES分析揭示PDHB基因纯合错义突变,即外显子6中的c.575G>T(p.Arg192Leu)。生物信息学软件包括SIFT、Polyphen2、LRT和Mutation Taster预测该PDHB错义突变有害。Western blot显示,与转染phage-PDHB-wt的细胞相比,转染phage-PDHB-mut的细胞中正常PDH蛋白表达显著降低(P<0.001)。PDH活性分析显示,与转染phage-PDHB-wt的细胞相比,转染phage-PDHB-mut的细胞中PDH活性显著降低(P<0.001)。结论:PDHB基因c.575G>T(p.Arg192Leu)是一种致病性错义突变,以常染色体隐性遗传方式导致PDH缺乏症。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
PDHB基因c.575G>T(p.Arg192Leu)突变是否导致丙酮酸脱氢酶缺乏症?
核心机制
该突变导致PDH蛋白表达下降和酶活性降低,从而引起PDH缺乏。
主要证据
Western blot显示突变型转染细胞中PDH蛋白表达显著降低,PDH活性测定显示活性显著降低(P<0.001)。
研究意义
该突变被证实为致病性,呈常染色体隐性遗传,有助于临床基因检测和遗传咨询。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

临床病例表型分析

明确患者的临床表现和生化异常

收集患者临床资料,进行血气分析、有机酸分析、脑MR等。

2

全外显子测序和突变鉴定

发现致病基因突变

提取患者及家系成员DNA,进行WES,验证突变。

3

体外功能验证

验证突变对PDH蛋白表达和活性的影响

构建野生型或突变型PDHB真核表达载体,转染293T细胞,检测PDHB mRNA、蛋白和PDH活性。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

验证样本或模型特征
验证功能变化
数据分析与统计

产品清单

实验环节名称品牌货号
pEGFP-N1载体----
限制性内切酶SalI和BamHI----
293T细胞Thermo Fisher ScientificR70007
Lipofectamine 2000转染试剂Thermo Fisher Scientific11668019
TRIzol Plus RNA纯化试剂盒Invitrogen12,183,555
EvoM-MLV逆转录PCR试剂盒Accurate BiologyAG11603
TB Green Premix Ex Taq IITakaraRR820Q
ABI 7500实时荧光定量PCR系统Thermo Fisher Scientific--
细胞裂解液BeyotimeP0013
PVDF膜MilliporeIPVH00010
半干转印系统Bio-Rad--
兔单克隆抗PDH抗体CST2784
小鼠单克隆抗β-actin抗体Proteintech66,009-1-Ig
山羊多克隆抗小鼠IgG抗体ProteintechSA00001-1
山羊多克隆抗兔IgG抗体ProteintechSA00001-2
数字凝胶成像分析系统Invitrogen--
PDH活性测定试剂盒Solarbio Science & TechnologyBC0385

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
基因分析
突变位点(c.575G>T,p.Arg192Leu)及其纯合性
阅读提示:Methods中'Variation analysis'部分及Figure 3、4
载体构建
载体类型(pEGFP-N1)、插入片段(全长PDHB cDNA)、酶切位点(SalI和BamHI)
阅读提示:Methods中'Vector construction and transfection'部分
细胞转染
细胞类型(293T)、转染试剂(Lipofectamine 2000)、剂量(未明确)
阅读提示:Methods中'Vector construction and transfection'部分
表达检测
检测时间(转染后48小时)、qPCR内参(GAPDH)、Western blot抗体浓度
阅读提示:Methods中'qPCR assay'和'Western blot analysis'部分
功能验证
PDH活性测定试剂盒及操作步骤
阅读提示:Methods中'PDH activity measurement'部分