通过同位素条形码珠的质谱分析进行高通量多重血清学检测

High-throughput multiplexed serology via the mass-spectrometric analysis of isotopically barcoded beads

作者信息Alexandros P Drainas, David R McIlwain, Alec Dallas, Theresa Chu, Antonio Delgado-González, Maya Baron, Maria Angulo-Ibáñez, Angelica Trejo, Yunhao Bai, John W Hickey, Guolan Lu, Scott Lu, Jesus Pineda-Ramirez, Khamal Anglin, Eugene T Richardson, John C Prostko, Edwin Frias, Venice Servellita, Noah Brazer, Charles Y Chiu, Michael J Peluso, Jeffrey N Martin, Oliver F Wirz, Tho D Pham, Scott D Boyd, J Daniel Kelly, Julien Sage, Garry P Nolan, Xavier Rovira-Clavé
PMID39939547
发布时间2025-07
DOI10.1038/s41551-025-01349-0

实验完整度

包含体外珠载体制备与验证、双条形码策略生成18480种条形码、两种血清学检测方法(双珠法和免洗法)在临床样本中的功能验证,以及与ELISA和商业试剂盒的结果对比。

主要模型

链霉亲和素包被的聚苯乙烯珠 COVID-19恢复期血浆样本 COVID-19大流行前血浆样本 FIND研究队列纵向血清样本

重点核对

双重条形码策略:使用159Tb-164Dy中的3种同位素生成20种目标ID条形码,使用165Ho-176Yb中的6种同位素生成924种样本ID条形码 双珠法测定中样本稀释倍数:1:300、1:3,000和1:30,000,对应样本体积100 nl、10 nl和1 nl 免洗法测定中PFA固定时间15分钟,SDS处理时间15分钟 检测抗体:金纳米颗粒偶联的抗人IgG抗体和115In偶联的抗人IgM抗体,浓度均为256 ng/l 与Abbott AdviseDx SARS-CoV-2 IgG II检测结果的相关性(R²=0.58)

摘要

在血清学检测中,每个样本通常单独检测,一次检测一种抗原。这既昂贵又耗时。血清学技术理想情况下应允许在小样本量中并行进行重复测量,并且应成本低、速度快。在这里,我们展示了质谱流式细胞术可用于扩展多重血清学检测,通过利用均匀加载稳定同位素组合的聚苯乙烯珠。我们生成了18,480种独特的同位素条形码珠,以在单管中同时检测924份血清样本中针对SARS-CoV-2的19种蛋白的免疫球蛋白G和M水平(总共36,960次检测,样本体积400 nl,反应体积30 μl)。作为一种快速、高通量且成本效益高的技术,质谱流式细胞术血清学检测可能有助于有效管理由传染病引起的公共卫生突发事件。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
如何利用质谱流式细胞术实现大规模、多重化的血清学检测,以克服传统ELISA和其他珠式方法的通量和条形码数量限制?
核心机制
通过将稳定同位素偶联的生物素化载体蛋白加载到链霉亲和素包被的聚苯乙烯珠上,形成均匀且高负载的稳定同位素条形码,结合双重条形码策略生成大量独特条形码,实现单管中同时检测多种抗体。
主要证据
生成18,480种独特条形码;在924个样本中同时检测19种SARS-CoV-2蛋白的IgG和IgM;双珠法在39个COVID-19阳性样本和55个大流行前样本中实现100%区分;与ELISA和Abbott试剂盒结果一致。
研究意义
该技术为高通量血清学检测提供了可扩展、低成本的方法,可能有助于传染病暴发期间的大规模抗体监测,并可能用于疫苗监测和疾病诊断。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

同位素珠标记

验证将稳定同位素偶联的生物素化蛋白加载到链霉亲和素包被珠上的可行性,以及标记的均匀性和高负载性。

制备162Dy偶联的生物素化BSA,加载到链霉亲和素珠上,通过质谱流式检测同位素强度;扩展至38种稳定同位素,生成奇数和偶数同位素珠;并测试不同负载量的同位素组合。

2

双重条形码生成

生成大量独特的同位素条形码组合,以同时识别分子靶标和样本。

使用159Tb至164Dy中的3种同位素生成20种目标ID条形码,使用165Ho至176Yb中的6种同位素生成924种样本ID条形码,最终组合为18,480种条形码。

3

双珠法抗体检测

验证在低样本体积下检测特异性抗体的可行性,并评估其与ELISA和流式细胞术的一致性。

将患者血浆样本与抗原加载的条形码珠孵育,洗涤后与抗人IgG磁珠孵育,通过磁分离收集未结合珠,计算基线比以估计抗体水平。

4

免洗法多重抗体检测

实现高通量、免洗的抗体检测,同时分析多个样本和多个抗原靶标。

抗原加载的条形码珠与血浆样本孵育后,经PFA固定和SDS变性处理,然后合并并染色,通过质谱流式检测IgG和IgM水平。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

验证样本或模型特征
数据分析与统计

产品清单

实验环节名称品牌货号
链霉亲和素包被的聚苯乙烯珠SpherotechSVP-30-5
生物素化牛血清白蛋白SigmaA8549
Maxpar X8聚合物Fluidigm201300
三(2-羧乙基)膦Thermo Fisher Scientific77720
Nanodrop 2000分光光度计Thermo Fisher ScientificND-2000
磁性抗IgG珠RayBiotech801-101-1
磁珠分选抗IgG微珠Miltenyi Biotec130-047-501
MACS LS分离柱Miltenyi Biotec130-042-401
CyTOF 2质谱流式细胞仪Fluidigm--
十二烷基硫酸钠----
金纳米颗粒偶联的抗人IgG抗体Nanoprobes2053
115In偶联的抗人IgM抗体BioLegend314502
生物素化的刺突蛋白S1亚基Sino Biological40591-V27H-B
刺突蛋白S1亚基Sino Biological40591-V02H
抗刺突蛋白S1抗体Invivogensrbd-mab1
Alexa Fluor 647偶联的抗人IgG抗体Thermo Fisher ScientificA21445
人IgG ELISA试剂盒BioLegend447809
核衣壳IgG ELISA试剂盒BioLegend448107
CytoFlex流式细胞仪Beckman Coulter--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
珠标记
珠的直径范围(3-3.4 μm)和浓度;同位素偶联载体蛋白的浓度(2.5 μg/ml)和孵育时间(30分钟);链霉亲和素包被珠的来源(Spherotech, SVP-30-5)。
阅读提示:Methods: Bead loading with isotope-conjugated carrier proteins
双重条形码生成
目标ID条形码的6种同位素选择(159Tb至164Dy),样本ID条形码的12种同位素选择(165Ho至176Yb);每种同位素偶联蛋白的浓度(1 μg/ml);孵育时间(30分钟)。
阅读提示:Methods: Generation of 20 barcodes for target ID; Generation of 924 barcodes for sample ID
双珠法
样本稀释倍数(1:300、1:3,000、1:30,000);样本体积(100 nl、10 nl、1 nl);反应体积(30 μl);磁珠类型和比例(RayBiotech 801-101-1 或 Miltenyi 130-047-501,1:2比例);孵育时间(30分钟);重复数(每样本12次)。
阅读提示:Methods: Two-bead assay by mass cytometry; Figure 3e legend
免洗法
样本稀释倍数(1:10);固定和变性条件(PFA 3.2%孵育15分钟,SDS 4%孵育15分钟);检测抗体种类及浓度(金-抗IgG 256 ng/l,115In-抗IgM 256 ng/l);孵育时间(30分钟)。
阅读提示:Methods: Wash-free assay by mass cytometry; Figure 4b,c legends