同位素珠标记
验证将稳定同位素偶联的生物素化蛋白加载到链霉亲和素包被珠上的可行性,以及标记的均匀性和高负载性。
制备162Dy偶联的生物素化BSA,加载到链霉亲和素珠上,通过质谱流式检测同位素强度;扩展至38种稳定同位素,生成奇数和偶数同位素珠;并测试不同负载量的同位素组合。
High-throughput multiplexed serology via the mass-spectrometric analysis of isotopically barcoded beads
包含体外珠载体制备与验证、双条形码策略生成18480种条形码、两种血清学检测方法(双珠法和免洗法)在临床样本中的功能验证,以及与ELISA和商业试剂盒的结果对比。
链霉亲和素包被的聚苯乙烯珠 COVID-19恢复期血浆样本 COVID-19大流行前血浆样本 FIND研究队列纵向血清样本
双重条形码策略:使用159Tb-164Dy中的3种同位素生成20种目标ID条形码,使用165Ho-176Yb中的6种同位素生成924种样本ID条形码 双珠法测定中样本稀释倍数:1:300、1:3,000和1:30,000,对应样本体积100 nl、10 nl和1 nl 免洗法测定中PFA固定时间15分钟,SDS处理时间15分钟 检测抗体:金纳米颗粒偶联的抗人IgG抗体和115In偶联的抗人IgM抗体,浓度均为256 ng/l 与Abbott AdviseDx SARS-CoV-2 IgG II检测结果的相关性(R²=0.58)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证将稳定同位素偶联的生物素化蛋白加载到链霉亲和素包被珠上的可行性,以及标记的均匀性和高负载性。
制备162Dy偶联的生物素化BSA,加载到链霉亲和素珠上,通过质谱流式检测同位素强度;扩展至38种稳定同位素,生成奇数和偶数同位素珠;并测试不同负载量的同位素组合。
生成大量独特的同位素条形码组合,以同时识别分子靶标和样本。
使用159Tb至164Dy中的3种同位素生成20种目标ID条形码,使用165Ho至176Yb中的6种同位素生成924种样本ID条形码,最终组合为18,480种条形码。
验证在低样本体积下检测特异性抗体的可行性,并评估其与ELISA和流式细胞术的一致性。
将患者血浆样本与抗原加载的条形码珠孵育,洗涤后与抗人IgG磁珠孵育,通过磁分离收集未结合珠,计算基线比以估计抗体水平。
实现高通量、免洗的抗体检测,同时分析多个样本和多个抗原靶标。
抗原加载的条形码珠与血浆样本孵育后,经PFA固定和SDS变性处理,然后合并并染色,通过质谱流式检测IgG和IgM水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 珠标记 | 链霉亲和素包被的聚苯乙烯珠 | Spherotech | SVP-30-5 |
| 生物素化牛血清白蛋白 | Sigma | A8549 | |
| 抗体偶联 | Maxpar X8聚合物 | Fluidigm | 201300 |
| 三(2-羧乙基)膦 | Thermo Fisher Scientific | 77720 | |
| Nanodrop 2000分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | ND-2000 | |
| 双珠法 | 磁性抗IgG珠 | RayBiotech | 801-101-1 |
| 磁珠分选抗IgG微珠 | Miltenyi Biotec | 130-047-501 | |
| MACS LS分离柱 | Miltenyi Biotec | 130-042-401 | |
| CyTOF 2质谱流式细胞仪 | Fluidigm | -- | |
| 免洗法 | 十二烷基硫酸钠 | -- | -- |
| 金纳米颗粒偶联的抗人IgG抗体 | Nanoprobes | 2053 | |
| 115In偶联的抗人IgM抗体 | BioLegend | 314502 | |
| 验证 | 生物素化的刺突蛋白S1亚基 | Sino Biological | 40591-V27H-B |
| 刺突蛋白S1亚基 | Sino Biological | 40591-V02H | |
| 抗刺突蛋白S1抗体 | Invivogen | srbd-mab1 | |
| Alexa Fluor 647偶联的抗人IgG抗体 | Thermo Fisher Scientific | A21445 | |
| 人IgG ELISA试剂盒 | BioLegend | 447809 | |
| 核衣壳IgG ELISA试剂盒 | BioLegend | 448107 | |
| CytoFlex流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 珠标记 | 珠的直径范围(3-3.4 μm)和浓度;同位素偶联载体蛋白的浓度(2.5 μg/ml)和孵育时间(30分钟);链霉亲和素包被珠的来源(Spherotech, SVP-30-5)。 阅读提示:Methods: Bead loading with isotope-conjugated carrier proteins |
| 双重条形码生成 | 目标ID条形码的6种同位素选择(159Tb至164Dy),样本ID条形码的12种同位素选择(165Ho至176Yb);每种同位素偶联蛋白的浓度(1 μg/ml);孵育时间(30分钟)。 阅读提示:Methods: Generation of 20 barcodes for target ID; Generation of 924 barcodes for sample ID |
| 双珠法 | 样本稀释倍数(1:300、1:3,000、1:30,000);样本体积(100 nl、10 nl、1 nl);反应体积(30 μl);磁珠类型和比例(RayBiotech 801-101-1 或 Miltenyi 130-047-501,1:2比例);孵育时间(30分钟);重复数(每样本12次)。 阅读提示:Methods: Two-bead assay by mass cytometry; Figure 3e legend |
| 免洗法 | 样本稀释倍数(1:10);固定和变性条件(PFA 3.2%孵育15分钟,SDS 4%孵育15分钟);检测抗体种类及浓度(金-抗IgG 256 ng/l,115In-抗IgM 256 ng/l);孵育时间(30分钟)。 阅读提示:Methods: Wash-free assay by mass cytometry; Figure 4b,c legends |