狼疮和炎症性肠病共享一组与其他自身免疫性疾病不同的微生物组特征

目的：本研究旨在阐明自身免疫性疾病（特别是系统性红斑狼疮（SLE）和炎症性肠病（IBD））与结直肠癌（CRC）相关的微生物特征，以识别独特的生物标志物和共享的微生物机制，为特定治疗方案提供依据。方法：我们分析了六种自身免疫性疾病（SLE、IBD、多发性硬化症、重症肌无力、Graves病和强直性脊柱炎）患者队列的宏基因组数据集，并与CRC宏基因组进行对比，以描绘疾病特异性微生物谱。研究重点是从物种谱和功能基因中识别预测性生物标志物，整合蛋白质-蛋白质相互作用分析，探索关键信号通路中的效应蛋白及其靶点。结果：在不同自身免疫性疾病中发现了独特的微生物特征，SLE与IBD之间存在显著重叠，表明存在共同的微生物基础。重要的预测性生物标志物突出了这些疾病中微生物影响的多样性。蛋白质-蛋白质相互作用分析揭示了靶向糖皮质激素信号、抗原呈递和白细胞介素-12信号通路的相互作用，为可能的共同疾病机制提供了见解。实验验证证实了宿主蛋白糖皮质激素受体（NR3C1）与特定肠道细菌衍生蛋白之间的相互作用，这可能对SLE和IBD等炎症性疾病具有治疗意义。结论：我们的研究结果强调了肠道微生物组在自身免疫性疾病中的关键作用，为共享和独特的微生物特征提供了见解。该研究突出了微生物生物标志物在理解疾病机制和指导治疗策略中的潜在重要性，为基于微生物谱的新型治疗方法铺平了道路。试验注册号：NCT02394964。