体外表征SIK3变体的激酶活性与转录活性
验证T221E突变对SIK3激酶活性的部分激活效应及其对下游转录的影响
在HEK293T细胞中表达不同的SIK3变体(野生型、SLP、T221A、T221E等),进行体外激酶实验和荧光素酶报告实验,并用免疫印迹检测磷酸化状态及14-3-3结合。
Partial activation of salt-inducible kinase 3 delays the onset of wakefulness and alleviates hypersomnia due to the lack of protein kinase A-phosphorylation site
文章包含体外生化实验(激酶活性、转录报告、免疫共沉淀)和体内模型(基因修饰小鼠EEG/EMG记录及昼夜节律转轮实验),并进行了功能验证(睡眠剥夺)和机制验证。
HEK293T细胞 Sik3T221E小鼠 Sik3T221E;Slp小鼠 C57BL/6N小鼠
T221E突变对SIK3激酶活性的影响(体外激酶实验) 基因型(Sik3T221E杂合/纯合,Sik3T221E;Slp杂合/纯合) EEG/EMG记录条件(电极植入位置、记录时长) 睡眠剥夺方案(6小时,ZT0开始) 昼夜节律跑轮实验(光-暗循环和持续黑暗的条件)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证T221E突变对SIK3激酶活性的部分激活效应及其对下游转录的影响
在HEK293T细胞中表达不同的SIK3变体(野生型、SLP、T221A、T221E等),进行体外激酶实验和荧光素酶报告实验,并用免疫印迹检测磷酸化状态及14-3-3结合。
评估Sik3T221E和Sik3T221E;Slp小鼠的睡眠时间和结构是否受影响
对基因修饰小鼠植入EEG/EMG电极,记录并分析睡眠分期、EEG功率谱、睡眠剥夺后的稳态反应。
评估T221E突变对昼夜节律周期和觉醒起始的影响
使用转轮记录小鼠在光-暗循环和持续黑暗条件下的活动,计算昼夜节律周期和觉醒起始时间。
验证T221E替换是否能反转Slp突变导致的睡眠增多
比较Sik3T221E;Slp小鼠与Sik3T221E和Sik3Slp小鼠的睡眠时间、Delta功率和稳态反应。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 基因修饰小鼠制备 | GeneArt Precision gRNA合成试剂盒 | ThermoFisher | -- |
| GeneArt Platinum Cas9核酸酶 | ThermoFisher | -- | |
| NEPA 21电穿孔仪 | NEPAGNENE | -- | |
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Wako | -- |
| 胎牛血清 | CORNING | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Wako | -- | |
| 细胞转染 | PEI Max转染试剂 | Polysciences | -- |
| Lipofectamine LTX及Plus试剂 | Thermo Fisher Scientific Inc. | -- | |
| FuGENE HD转染试剂 | Promega | -- | |
| 蛋白质检测 | anti-Flag M2磁珠 | Sigma-Aldrich | -- |
| ADP-Glo激酶检测试剂盒 | Promega | -- | |
| DDDDK标签蛋白纯化试剂盒 | MBL | -- | |
| Can Get Signal Solution 1 | TOYOBO | -- | |
| 抗DYKDDDD标签抗体 | Wako | 1E6 | |
| 抗β-微管蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 2128 | |
| 抗SIK3磷酸化T221抗体 | Eurofins | -- | |
| 抗SIK3磷酸化S551抗体 | Eurofins | -- | |
| 抗14-3-3 (pan)抗体 | Cell Signaling Technology | 8312 | |
| 抗LKB1 (D60C5)抗体 | Cell Signaling Technology | 3047 | |
| 抗GAPDH (D16H11) XP抗体 | Cell Signaling Technology | 5174 | |
| HRP标记的抗小鼠IgG抗体 | Jackson ImmunoResearch Laboratories | AB_2340066 | |
| HRP标记的抗兔IgG抗体 | Jackson ImmunoResearch Laboratories | AB_10015282 | |
| Clarity Western ECL底物 | Bio-Rad | -- | |
| FUSION Solo 6S.EDGE成像系统 | Vilber-Lourmat | -- | |
| 报告基因检测 | 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | -- |
| Infinite M Plex酶标仪 | TECAN | -- | |
| EEG/EMG记录 | 多通道放大器 | NIHON KODEN | AB-611J |
| 模数转换器 | National Instruments | PCI-6220 | |
| 带平衡臂的系绳电缆 | Instech Laboratories | -- | |
| 昼夜节律分析 | 转轮 | Med Associates | ENV-047 |
| Wheel Manager软件 | Med Associates | -- | |
| 接收装置 | Med Associates | DIG807 | |
| 统计分析 | Prism 10 | GraphPad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 基因修饰小鼠制备 | T221E和Slp等位基因的基因分型方法(dCAPS法)及引物序列 阅读提示:Methods: Generation of Sik3T221E and Sik3T221E;Slp mice |
| 体外激酶活性检测 | 激酶底物(HDAC5tide)的浓度、ATP浓度、反应时间、样本重复数 阅读提示:Methods: In vitro kinase assay |
| 荧光素酶报告实验 | 转染试剂、报告质粒、细胞密度、转染后时间 阅读提示:Methods: Luciferase reporter assay |
| 睡眠/觉醒记录 | 电极植入坐标、小鼠年龄、记录时长、睡眠剥夺时长(6小时) 阅读提示:Methods: EEG/EMG electrode implantation surgery, EEG/EMG recording and sleep/wakefulness analysis |
| 昼夜节律行为分析 | 光-暗循环和持续黑暗的持续时间、转轮记录数据的分析方法 阅读提示:Methods: Circadian behavioral analysis |