靶点验证
验证c-MET在胰腺癌中的表达及其与预后的相关性,确立其作为CAR-M靶点的合理性。
通过TCGA-PAAD数据库分析c-MET表达与患者生存的关系;使用组织芯片对76例PDAC及癌旁组织进行IHC染色,评估c-MET表达水平并分析与临床病理特征的相关性。
Chimeric antigen receptor macrophages targeting c-MET(CAR-M-c-MET) inhibit pancreatic cancer progression and improve cytotoxic chemotherapeutic efficacy
包含生物信息学分析、组织微阵列IHC、体外细胞共培养功能实验、转录组测序、细胞因子阵列、原位小鼠模型和hMDM验证等多个独立证据层级。
THP-1细胞系 人单核细胞来源的巨噬细胞(hMDM) BxPC-3胰腺癌细胞系 NOD/SCID小鼠原位胰腺癌模型
c-MET表达水平:通过TCGA-PAAD数据库和免疫组化验证,BxPC-3细胞系为高表达靶细胞。 CAR构建:包含CD8α信号肽、c-MET scFv、CD8α铰链区、FcRγ信号激活域和CD19 PI3K招募域,并融合EGFP。 体外功能验证:共培养系统使用E:T比例、时间点(如5:1、10:1,0.5h-24h)及LDH、生物发光检测。 体内给药方案:原位模型术后第5天开始每周腹腔注射1×10^7个CAR THP-1细胞,持续至35天。 化疗联合方案:BxPC-3-luci+细胞先用10μM化疗药处理24h,再与CAR-THP-1共培养24h。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证c-MET在胰腺癌中的表达及其与预后的相关性,确立其作为CAR-M靶点的合理性。
通过TCGA-PAAD数据库分析c-MET表达与患者生存的关系;使用组织芯片对76例PDAC及癌旁组织进行IHC染色,评估c-MET表达水平并分析与临床病理特征的相关性。
构建靶向c-MET的CAR-M细胞,验证其特异性结合、吞噬和杀伤胰腺癌细胞的能力。
利用慢病毒转染THP-1细胞构建CAR-M-c-MET-THP1,经PMA诱导分化和IFN-γ/LPS极化;与BxPC-3-mCherry或BxPC-3-luci+共培养,通过流式、生物发光、LDH和共聚焦显微镜检测吞噬和杀伤效果。
评估CAR-M-c-MET与细胞毒性化疗药物的协同杀伤效果。
BxPC-3-luci+细胞先用化疗药物处理24小时,再加入CAR-THP-1共培养24小时,通过生物发光和LDH检测残留肿瘤细胞。
探究CAR-M-c-MET抗肿瘤作用的分子机制,包括免疫激活状态和转录组变化。
将CAR-THP-1与BxPC-3共培养48小时后分选巨噬细胞,进行RNA-seq;收集共培养上清进行细胞因子芯片;通过qPCR验证关键促炎/抗炎标志物。
验证CAR-M-c-MET在原位胰腺癌小鼠模型中的抗肿瘤效果、归巢能力和安全性。
建立BxPC-3-luci+原位胰腺癌模型,术后第5天开始每周腹腔注射CAR-THP-1或对照细胞,监测肿瘤负荷、生存期、器官转移和组织损伤,并评估细胞分布和安全性指标。
在人类原代巨噬细胞中验证CAR-M-c-MET的功效和免疫激活状态,为临床转化提供依据。
从PBMC分离CD14+单核细胞,经GM-CSF诱导分化为hMDM,使用腺病毒载体转染CAR,体外共培养检测吞噬和杀伤效率,并在原位模型中验证抗肿瘤效果和体内持久性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | C11995500BT |
| RPMI-1640培养基 | Gibco | C22400500BT | |
| 胎牛血清 | Biological Industries | 04-001-1A | |
| 青霉素-链霉素 | Biological Industries | 03-031-1B | |
| 豆蔻酸-佛波醇-乙酸酯 | Sigma-Aldrich | P8139 | |
| 细胞诱导分化 | 干扰素-γ | Novoprotein | GMP-CI57 |
| 脂多糖 | Solarbio | L8880 | |
| 细胞培养 | 巨噬细胞集落刺激因子 | PeproTech | AF-300-25 |
| 粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子 | PeproTech | 300-03 | |
| 流式细胞术 | Fc受体阻断剂 | BioLegend | 156603 |
| PE/Cy7抗his标签抗体 | Biolegend | 352620 | |
| LSRFortessa™流式细胞仪 | BD | -- | |
| HER2检测 | HER2-FITC抗体 | Invitrogen | BMS120FI |
| 慢病毒包装 | 慢病毒载体 | 上海吉凯基因 | GIEL0320172 |
| 腺病毒包装 | 腺病毒快速滴定试剂盒 | Clontech | 632250 |
| 细胞毒性检测 | LDH细胞毒性检测试剂盒 | Beyotime | C0016 |
| 共聚焦显微镜 | 共聚焦显微镜 | Nikon | AXR |
| 活细胞成像 | UltraVIEW VoX高速激光扫描共聚焦实时成像系统 | PerkinElmer | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Takara | 9108 |
| RNA-seq | RNeasy小提试剂盒 | Qiagen | -- |
| TruSeq® RNA样本制备试剂盒 | Illumina | -- | |
| Qubit® 2.0荧光计 | Life Technologies | -- | |
| Agilent 2100生物分析仪 | Agilent Technologies | -- | |
| Illumina HiSeq Xten测序仪 | Illumina | -- | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Thermo Scientific | 15596026 |
| TBGreen™ Premix ExTaq™ II | TaKaRa | -- | |
| CFX96实时荧光定量PCR检测系统 | Bio-Rad | -- | |
| 细胞因子检测 | 人细胞因子G系列G5抗体芯片 | RayBiotech | AAH-Cyt-G5 |
| 体内实验 | 基质胶 | Gibco | 354234 |
| 成像 | IVIS Lumina III小动物活体成像系统 | PerkinElmer | -- |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor 546标记的二抗 | Solarbio | K1034G-AF594 |
| 免疫组化 | c-MET抗体 | Proteintech | 25869-1-AP |
| 凋亡检测 | TUNEL细胞凋亡检测试剂盒 | Servicebio | G1507 |
| 吞噬实验 | CellTracker深红色荧光染料 | Thermo Fisher Scientific | C34565 |
| CellTracker绿色荧光染料 | Thermo Fisher Scientific | C7025 | |
| 体内持久性实验 | Dir细胞膜荧光染料 | adsin | abs45153692 |
| 免疫组化 | c-MET单克隆抗体 | Proteintech | 25869-1-AP |
| 流式细胞术 | FITC抗人c-MET抗体 | Biolegend | 11885842 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 靶点验证 | c-MET表达分析:TCGA-PAAD数据库,IHC染色评分(最佳截断值5) 阅读提示:Bioinformatic analysis和Tissue microarray analysis部分 |
| CAR-M构建 | CAR结构(CD8α信号肽、c-MET scFv、CD8α铰链、FcRγ、CD19 PI3K),慢病毒MOI=30,腺病毒MOI=3000 阅读提示:Construction of CARs and cell transfection部分 |
| 体外共培养 | E:T比例(5:1, 10:1),共培养时间(0.5-24h),BxPC-3细胞系,预极化条件(PMA 100ng/ml, IFN-γ 20ng/ml, LPS 100ng/ml) 阅读提示:In vitro co-culture experiments和Flow cytometry (FCM)部分 |
| 化疗联合 | 化疗药物浓度(10μM),预处理24h,共培养24h,药物种类(吉西他滨、5-FU、伊立替康、奥沙利铂) 阅读提示:Combination of cytotoxic chemotherapy and CAR-M-c-MET部分 |
| 体内实验 | 小鼠品系(NOD/SCID, 6-7周龄),细胞注射剂量(1×10^7/只),给药途径(腹腔注射),治疗起始(术后第5天)和频率(每周一次) 阅读提示:In vivo murine pancreatic cancer model部分 |
| hMDM验证 | PBMC来源,CD14+分选,GM-CSF浓度(10 ng/ml),诱导时间(5天),腺病毒MOI=3000,共培养E:T比例(1:3)和时间点(3-48h) 阅读提示:Peripheral blood mononuclear cells (PBMC) isolation和In vitro phagocytosis and cytotoxic assay of hMDM部分 |