临床试验设计
评估NR补充对COPD患者气道炎症的影响。
在40名稳定期COPD患者中开展随机、双盲、安慰剂对照的临床试验,NR组和安慰剂组各20人,干预6周,随访12周。
Effect of nicotinamide riboside on airway inflammation in COPD: a randomized, placebo-controlled trial
该研究包含随机双盲安慰剂对照临床试验、体内外细胞实验以及多组学探索性分析等多个证据层级,并进行功能验证和机制探索。
COPD患者(稳定期,非嗜酸性粒细胞性) 肺健康对照(未吸烟) 永生化人支气管上皮细胞(BEAS-2B) 原代人成纤维细胞(MRC-5、AG08498、GM22159、GM22222)
NR给药剂量:2 g/天,分两次口服,每次1g(4粒250mg胶囊),持续6周 IL-8检测样本:诱导痰上清,ELISA法,检测范围31.2-2000 pg/ml,稀释1:5 NAD+定量:全血裂解液,酶循环法,使用Hidex Sense荧光酶标仪 DNA甲基化分析:定制Illumina 250K芯片,使用EZ DNA Methylation Kit进行亚硫酸氢盐转化 统计分析模型:约束线性混合模型,调整性别和基线CAT评分,未进行多重性校正
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估NR补充对COPD患者气道炎症的影响。
在40名稳定期COPD患者中开展随机、双盲、安慰剂对照的临床试验,NR组和安慰剂组各20人,干预6周,随访12周。
获取用于检测炎症标志物、NAD+、DNA甲基化和转录组的生物样本。
采集静脉血、诱导痰和鼻刷样本,处理用于NAD+定量、细胞计数、PBMC分离和RNA提取。
评估NR对气道和全身炎症的影响。
测量痰液IL-8、IL-6、中性粒细胞弹性蛋白酶,以及血浆IL-6水平。
验证NR补充是否提高全血NAD+水平。
使用酶循环荧光法测量全血和细胞培养物中的NAD+水平。
探索NR对表观遗传衰老的影响。
使用定制Illumina 250K芯片分析PBMC DNA甲基化,计算多种表观遗传时钟。
探索NR对鼻上皮细胞基因表达的影响。
对鼻刷样本进行RNA测序,分析治疗前后的基因表达变化。
评估NR对痰液中单核细胞衰老的影响。
使用深度学习NUSP预测痰液单核细胞核形态的衰老,并分析治疗前后变化。
验证NR对细胞衰老和存活的影响。
对BEAS-2B细胞进行氧化应激实验,对原代成纤维细胞进行辐射诱导衰老实验。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| F-12培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Sigma-Aldrich | F9665 | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15140163 | |
| BEAS-2B细胞系 | ATCC | CRL-9609 | |
| MRC-5细胞系 | ATCC | CCL-171 | |
| 氧化应激实验 | 甲萘醌 | Merck | -- |
| 烟酰胺核糖苷 | Elysium Health | -- | |
| Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| DAPI | AppliChem | -- | |
| IN Cell Analyzer 2200高内涵显微镜 | GE Healthcare Life Sciences | -- | |
| 诱导痰处理 | 二硫苏糖醇 | -- | -- |
| May-Grünwald染液 | Merck | 101424 | |
| Giemsa染液 | Merck | 109204 | |
| 台盼蓝 | -- | -- | |
| 痰液成像 | Axio Scan.Z1自动玻片扫描仪 | Zeiss | -- |
| 鼻刷样本采集 | Gynobrush刷 | Heinz Herenz Hamburg | -- |
| 鼻刷样本处理 | RLT缓冲液 | Qiagen | -- |
| QIAcube自动核酸纯化仪 | Qiagen | -- | |
| PBMC分离 | LeucoSEP管 | Greiner Bio-One | -- |
| Ficoll-Paque PLUS分离液 | Cytiva | -- | |
| ACK裂解缓冲液 | Gibco | A1049201 | |
| 细胞衰老诱导 | YXLON Smart Maxishot X射线辐照仪 | YXLON | -- |
| NAD+定量 | Hidex Sense荧光酶标仪 | Hidex | -- |
| 炎症因子检测 | IL-8 ELISA试剂盒 | R&D Systems | -- |
| 中性粒细胞弹性蛋白酶ELISA试剂盒 | R&D Systems | -- | |
| S-PLEX IL-6检测试剂盒 | Meso Scale Discovery | -- | |
| DNA甲基化分析 | Maxwell RSC血液DNA提取试剂盒 | Promega | AS1400 |
| EZ DNA甲基化试剂盒 | Zymo Research | -- | |
| Quant-iT PicoGreen dsDNA定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | P7589 | |
| 定制Illumina 250K芯片 | Elysium Health | -- | |
| Maxwell RSC 48核酸纯化仪 | Promega | -- | |
| Biomek i5自动化工作站 | Beckman Coulter | -- | |
| SpectraMax Gemini分光光度计 | Molecular Devices | -- | |
| Freedom EVO自动化工作站 | Tecan Life Sciences | -- | |
| 临床试验干预 | 烟酰胺核糖苷 | Elysium Health | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床试验设计与干预 | 入组标准(年龄、吸烟史、肺功能、嗜酸性粒细胞计数)、NR给药剂量(2g/天,分两次)、治疗持续时间(6周)、随访时间(12周) 阅读提示:Methods:Study participants;Study design, randomization and intervention |
| 诱导痰处理与炎症标志物检测 | 痰液诱导方法(3%高渗盐水)、处理步骤(PBS、DTT)、IL-8和IL-6检测方法及稀释倍数、样本量及配对样本数 阅读提示:Methods:Induced sputum;IL-8, IL-6 and neutrophil elastase in sputum |
| NAD+定量 | 血液采集与处理(高氯酸保存)、检测方法(酶循环荧光法)、检测平台(Hidex Sense)、测量时间及计算方式 阅读提示:Methods:NAD+ quantification |
| DNA甲基化分析 | PBMC分离方法、DNA提取试剂盒、亚硫酸氢盐转化方法、定制芯片型号、分析软件及统计模型、样本量和质量控制指标 阅读提示:Methods:DNA methylation |
| RNA测序分析 | 样本类型(鼻刷)、RNA提取方法、测序平台、数据分析流程(比对、差异表达、GSEA)、样本量 阅读提示:Methods:RNA sequencing in nasal epithelial cells |
| 细胞衰老预测 | 痰液涂片成像方法(显微镜型号、放大倍数)、深度学习模型(NUSP)应用细节、统计分析模型 阅读提示:Methods:Senescence prediction |
| 体外细胞实验 | 细胞系和培养条件、处理浓度(甲萘醌、NR)、处理时间、检测方法(NAD+、细胞活力)、衰老诱导方法(IR、UV-C)及检测时间 阅读提示:Methods:Cell culture;Oxidative stress response;Senescence induction;Extended Data Fig. 8 |