检测FAIM2在心肌肥厚模型中的表达
评估FAIM2在病理条件下是否发生表达变化,并初步提示其参与心肌肥厚。
在TAC手术小鼠心脏和苯肾上腺素处理的NRVMs中,通过RT-qPCR检测mRNA水平,Western blot检测蛋白水平,免疫组化检测组织分布。
Fas Apoptosis Inhibitory Molecule 2 Inhibits Pathological Cardiac Hypertrophy by Regulating the MAPK Signaling Pathway
包含体外心肌细胞模型、体内基因敲除小鼠和TAC模型,并进行RNA-seq及Western blot等机制验证。
新生大鼠心室肌细胞 Faim2基因敲除小鼠 TAC诱导的压力超负荷小鼠模型
FAIM2蛋白水平在TAC小鼠心脏和苯肾上腺素处理的心肌细胞中显著降低 Faim2基因敲除加重TAC诱导的心肌肥厚、纤维化和凋亡 FAIM2过表达减轻苯肾上腺素诱导的心肌细胞肥大 FAIM2敲低增强TAK1磷酸化及下游JNK1/2和p38磷酸化 TAK1抑制剂5Z-7-ox逆转FAIM2敲低诱导的肥大效应
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估FAIM2在病理条件下是否发生表达变化,并初步提示其参与心肌肥厚。
在TAC手术小鼠心脏和苯肾上腺素处理的NRVMs中,通过RT-qPCR检测mRNA水平,Western blot检测蛋白水平,免疫组化检测组织分布。
验证FAIM2在心肌细胞肥大和凋亡中的功能作用。
从SD乳鼠分离NRVMs,感染AdFaim2或AdshFaim2,经苯肾上腺素诱导肥大后,通过免疫荧光检测细胞面积,RT-qPCR检测肥大和凋亡标志物。
评估FAIM2缺失对压力超负荷诱导的心肌肥厚、纤维化和心功能的影响。
对Faim2-KO和WT小鼠进行TAC或假手术,4周后通过超声心动图评估心功能,记录体重、心重等指标,并利用HE、天狼星红染色及RT-qPCR评估肥厚、纤维化及凋亡相关基因。
鉴定FAIM2调控的潜在下游信号通路和关键分子。
提取WT和KO小鼠TAC术后心脏RNA进行RNA-seq,使用Hisat2比对、StringTie计算表达,并进行KEGG通路富集分析。
验证RNA-seq结果并确定FAIM2调控MAPK通路的具体靶点。
利用Western blot检测体外和体内模型中TAK1、JNK1/2、p38、ERK1/2及AKT的磷酸化水平。
验证FAIM2与TAK1在心肌细胞内的直接结合。
在过表达FAIM2的NRVMs中,利用抗FAIM2抗体进行内源性免疫共沉淀,检测与TAK1的相互作用,并通过Western blot检测。
验证FAIM2敲低加重心肌肥厚的效应是否依赖TAK1激活。
在苯肾上腺素处理的NRVMs中,对FAIM2敲低细胞用5Z-7-ox处理,检测细胞面积和肥大、凋亡标志基因表达变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | Faim2-Flox小鼠 | GemPharmatech LLC | T016639 |
| 动物实验麻醉 | 三溴乙醇 | Sigma | T48402 |
| 组织染色 | 苏木素染液 | Servicebio | G1004 |
| 伊红染液 | BASO | BA-4024 | |
| 封片剂 | BASO | BA-7004 | |
| 天狼星红染色 | HEAD Biotechnology | 26357-02 | |
| 免疫组化 | EDTA抗原修复液 | Maxim | MVS-0099 |
| FAIM2抗体 | Abcam | ab72113 | |
| DAB显色液 | ZSGB-BIO | ZLI-9018 | |
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Procell | PM150323 |
| 胎牛血清 | Newzerum | BS-S500 | |
| 药物处理 | 5Z-7-氧杂泽烯醇 | MCE | -- |
| 分子克隆 | PacI限制性内切酶 | NEB | R0547L |
| 细胞培养 | 聚乙烯亚胺 | -- | -- |
| 免疫荧光 | α-actinin抗体 | Sigma | A7811 |
| 山羊血清 | -- | -- | |
| 抗小鼠Alexa Fluor 568荧光二抗 | Invitrogen | A11061 | |
| DAPI染料 | -- | -- | |
| 蛋白提取和定量 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | -- | -- | |
| 磷酸酶抑制剂 | -- | -- | |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | -- | -- |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | IPVH00010 |
| ChemiDoc XRS+成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| RNA提取 | TRI试剂 | -- | -- |
| RT-PCR | HiScript III逆转录预混液 | Vazyme | -- |
| 免疫共沉淀 | 蛋白A/G琼脂糖珠 | Bestchrom | AA104307 |
| RNA测序 | TransZol Up Plus RNA提取试剂盒 | TransGen Biotech | ER501-01 |
| RNAClean XP纯化试剂盒 | Beckman Coulter | A63987 | |
| 无RNase DNase试剂盒 | QIAGEN | 79254 | |
| 图像分析 | Image-Pro Plus 6.0 | Media Cybernetics | -- |
| 统计分析 | GraphPad | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物实验 | Faim2基因敲除小鼠构建方法、TAC手术具体操作细节、小鼠周龄及体重范围 阅读提示:Methods: Experimental Animals, Transverse Aortic Constriction |
| 体外细胞模型 | NRVM分离方法、培养条件、苯肾上腺素浓度及处理时间、腺病毒感染MOI和感染时间 阅读提示:Methods: Neonatal Rat Ventricular Myocytes Culture and Adenovirus Infection |
| 免疫荧光分析 | α-actinin染色抗体稀释度、固定和通透步骤、图像采集和细胞面积统计方法 阅读提示:Methods: Immunofluorescence Staining |
| Western blot分析 | RIPA裂解液配方、蛋白上样量、SDS-PAGE凝胶浓度、抗体信息及稀释度 阅读提示:Methods: Western Blot Assay, 表S2 |
| RNA-seq分析 | RNA提取试剂盒、文库构建方法、测序平台及数据比对分析参数 阅读提示:Methods: RNA Sequencing and Data Processing |
| 通路验证 | TAK1、JNK1/2、p38、ERK1/2和AKT的磷酸化抗体及对应磷酸化位点;5Z-7-ox的浓度和处理时间 阅读提示:Results: FAIM2 Regulates the MAPK Signaling Pathway Through TAK1 Phosphorylation, 图7-8 |