检测AD小鼠和患者脑中MANF表达
确定MANF表达是否与AD相关突触病理有关
通过Western blot和免疫组化检测5xFAD小鼠(6月龄和12月龄)海马和皮层中MANF、PSD95的表达,以及AD患者脑组织中MANF和突触蛋白表达。
Increased expression of mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor (MANF) contributes to synapse loss in Alzheimer's disease
包含AD小鼠模型(5xFAD、APP/PS1)、MANF转基因和AAV介导的过表达/敲低、人类脑组织样本,并结合行为学、电生理、突触形态学、分子生物学和转录组学等功能与机制验证。
5xFAD小鼠 APP/PS1小鼠 MANF转基因小鼠 AD患者脑组织样本
5xFAD小鼠模型(6月龄和12月龄) MANF转基因小鼠(6月龄) AAV-MANF海马注射(6月龄WT和5xFAD小鼠,1个月后分析) AAV-Cas9/AAV-Manf-gRNA海马注射(9月龄5xFAD小鼠,3个月后分析)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定MANF表达是否与AD相关突触病理有关
通过Western blot和免疫组化检测5xFAD小鼠(6月龄和12月龄)海马和皮层中MANF、PSD95的表达,以及AD患者脑组织中MANF和突触蛋白表达。
确定MANF过表达是否导致认知和情感缺陷
对6月龄MANF转基因小鼠和AAV-MANF注射的WT小鼠进行行为学测试,包括新物体识别、场景恐惧条件化、线索恐惧条件化、高架十字迷宫和旷场实验。
确定MANF过表达是否导致突触丢失和功能障碍
通过Western blot和免疫荧光检测突触蛋白表达,Golgi染色观察树突棘密度,全细胞膜片钳记录海马CA1区自发性EPSC。
寻找MANF介导突触丢失的分子机制
通过共免疫沉淀和体外结合实验验证MANF与ELAVL2的相互作用,并确定MANF结合ELAVL2的RRM3结构域。
确定MANF过表达是否影响突触相关转录本的表达和稳定性
对6月龄MANF转基因小鼠和WT小鼠海马进行RNA-seq,分析差异表达基因;通过RIP实验检测ELAVL2结合RNA的变化,并用RT-qPCR验证。
确定增加MANF表达是否加重AD小鼠的病理表现
将MANF转基因小鼠与5xFAD小鼠杂交,或向5xFAD小鼠海马注射AAV-MANF,检测突触蛋白、胶质细胞激活、Aβ沉积和行为变化。
确定降低MANF表达是否改善AD小鼠的病理表现
向9月龄5xFAD小鼠海马注射AAV-Cas9和AAV-Manf-gRNA,敲低内源性MANF,检测突触蛋白、胶质细胞激活、Aβ沉积和行为变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Mei5bio | MF182-plus-10 | |
| 磷酸酶抑制剂 | Sigma | S7920 | |
| 磷酸酶抑制剂 | Sigma | S6508 | |
| ECL Prime化学发光底物 | Millipore | WBKLS0500 | |
| Clinx ChemiScope 6300成像系统 | Clinx | -- | |
| 免疫荧光染色 | OCT包埋剂 | Sakura | 4583 |
| Triton X-100 | Sigma | X100 | |
| DAPI | -- | -- | |
| 奥林巴斯FV3000共聚焦激光扫描显微镜 | Olympus | -- | |
| 免疫组织化学 | 小鼠和兔特异性HRP/DAB (ABC)检测免疫组化试剂盒 | Abcam | ab64264 |
| ELISA | Aβ42 ELISA试剂盒 | Invitrogen | KHB3441 |
| 电生理 | Multiclamp 700B放大器 | Molecular Devices | -- |
| 尼康Eclipse FN-1显微镜 | Nikon | -- | |
| Golgi染色 | FD快速高尔基染色试剂盒 | FD NeuroTechnologies | -- |
| 立体定位注射 | RWD立体定位仪 | RWD | 69100 |
| Hamilton微量注射器 | Hamilton | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| RT-qPCR | PrimeScript RT试剂盒(含gDNA Eraser) | Takara | RR047A |
| QuantiNova SYBR Green PCR试剂盒 | QIAGEN | 208052 | |
| CFX Connect实时荧光定量PCR系统 | Bio-Rad | -- | |
| RNA免疫沉淀 | RiboCluster Profiler RIP检测试剂盒 | MBL | RN1001 |
| 蛋白A磁珠 | Invitrogen | 88846 | |
| 蛋白表达 | pET-28a载体 | -- | -- |
| pGEX-4T-1载体 | -- | -- | |
| 谷胱甘肽琼脂糖珠 | Sigma | -- | |
| 免疫共沉淀 | 蛋白A琼脂糖 | Sigma | -- |
| 细胞培养 | BL21(DE3)感受态细胞 | -- | -- |
| western blot | 抗MANF抗体 | LSBio | B2688 |
| 抗MANF抗体 | Abcam | ab67271 | |
| 抗APP抗体 | Biolegend | 803001 | |
| 抗β淀粉样蛋白抗体 | Abcam | ab126649 | |
| 抗NeuN抗体 | Abcam | ab177487 | |
| 抗NeuN抗体 | Millipore | MAB377 | |
| 抗β-微管蛋白抗体 | Proteintech | 10094-1-AP | |
| 抗PSD95抗体 | Abcam | ab238135 | |
| 抗PSD95抗体 | GeneTex | GTX133091 | |
| 抗突触素抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-12737 | |
| 抗HA标签抗体 | Abcam | ab9110 | |
| 抗GFAP抗体 | Sigma | G3893 | |
| 抗GFAP抗体 | Abcam | ab7260 | |
| 抗IBA1抗体 | Abcam | ab178846 | |
| 抗GRP78抗体 | Zen-bioscience | 200310-4F11 | |
| 抗GST标签抗体 | Invitrogen | MA4-004 | |
| 抗His标签抗体 | Cell signaling | 9715 | |
| 抗组蛋白H3抗体 | Cell signaling | 2365 | |
| 抗Vinculin抗体 | Millipore | MAB3574 | |
| 抗Cas9抗体 | Sigma | MAC133 | |
| 抗GFP抗体 | Emarbio | EM33012 | |
| 抗ELAVL2抗体 | Proteintech | 14008-1-AP | |
| 抗ELAVL2抗体 | Proteintech | 67097-1-Ig | |
| 抗GRIA1抗体 | Proteintech | 67642-1-Ig | |
| 抗GRIN2A抗体 | Proteintech | 28525-1-AP |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 检测AD小鼠和患者脑中MANF表达 | 5xFAD小鼠月龄(6月龄和12月龄);AD患者样本量(3例AD,3例对照)及病理分期(Braak NFT阶段和Thal Aβ阶段) 阅读提示:Methods: Human brain samples, Animals; Figure legends Fig.1 |
| 行为学测试 | 小鼠月龄(6月龄);测试类型(新物体识别、恐惧条件化等);具体参数(如电击强度0.5mA、声音85dB等) 阅读提示:Methods: Mouse behavioral tests; Figure legends Fig.2 |
| 电生理记录 | 记录脑区(海马CA1);记录模式(全细胞膜片钳);保持电位(-70 mV);灌流液成分 阅读提示:Methods: Electrophysiology; Figure legends Fig.2 |
| 病毒注射 | 病毒血清型(AAV9);注射剂量(1×10^13 vg/ml,双侧各1μl);注射坐标(前囟后-2.5mm,中线旁±2.0mm,背腹-2.0mm);注射后时间点(1个月或3个月) 阅读提示:Methods: Virus packaging and stereotaxic injection |
| RNA测序 | 测序平台;差异表达阈值(P值<0.05,|log2FC|>0.5);分析软件(Salmon, edgeR等) 阅读提示:Methods: RNA sequencing |