植物中广泛存在的依赖于位置的转录调控序列

Widespread position-dependent transcriptional regulatory sequences in plants

作者信息Yoav Voichek, Gabriela Hristova, Almudena Mollá-Morales, Detlef Weigel, Magnus Nordborg
PMID39266765
期刊Nat Genet
发布时间2024-10
DOI10.1038/s41588-024-01907-3

摘要

我们对真核生物转录的了解大多来源于对动物和酵母的研究;然而,植物在超过十亿年的时间里独立演化,这为转录调控机制的差异提供了充分的时间。本研究旨在阐明植物顺式调控序列的基本特性。通过对四种植物进行大规模平行报告基因实验,我们证明了转录起始位点下游序列在转录调控中的核心作用。与动物增强子的位置无关性不同,植物调控元件具有位置依赖性,其相对于转录起始位点的位置变化会显著影响转录活性。通过识别一个在维管植物中保守的DNA基序,我们强调了转录起始位点下游区域在调控转录中的重要性,该基序足以以剂量依赖的方式增强基因表达。大量位置依赖性增强子的发现,揭示了植物与动物在基因调控机制上存在根本性差异。

实验方法

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