基于宏基因组下一代测序策略的脑血栓微生物异质性鉴定

背景：脑血栓病因的诊断对于预防复发至关重要，但也具有挑战性。近期已证实血栓中存在微生物组，提示了一种区分不同来源脑血栓的新方法。然而，关于不同来源脑血栓的微生物定植是否存在异质性，目前知之甚少。方法和结果：本研究纳入40例急性缺血性卒中患者，并收集临床数据。采用宏基因组下一代测序检测人脑血栓样本的细菌和基因组特征。我们发现，大动脉粥样硬化血栓和心源性栓塞血栓之间的物种多样性相似，但脑血栓微生物群的物种组成和分布不同。与心源性栓塞组相比，大动脉粥样硬化组脑血栓中排名前10的细菌物种中Ralstonia insidiosa的相对丰度显著更高。20个操作分类单元与缺血性卒中的11项临床指标相关。基因本体富集分析揭示了9个不同的富集生物过程（如翻译和碳水化合物代谢过程等）。富集的京都基因与基因组百科全书通路包括核糖体、丁酸代谢和硫代谢。结论：本研究基于宏基因组下一代测序方法，提供了一种利用人脑血栓样本鉴别心源性栓塞血栓与大动脉粥样硬化血栓的诊断微生物学方法。我们的发现为脑血栓的微生物异质性提供了新视角，并展示了脑血栓的生物过程和通路特征。