构建工程化心脏组织模型
建立具有成熟心肌特征的体外模型,以模拟心肌应激和自身抗体结合环境。
将hiPSC-CMs和原代心脏成纤维细胞以3:1比例混合于纤维蛋白水凝胶中,在milliPillar平台上进行电机械刺激,培养于成熟培养基中。
An engineered human cardiac tissue model reveals contributions of systemic lupus erythematosus autoantibodies to myocardial injury
包含临床队列、工程化心脏组织、细胞培养、功能测定、RNA-seq、PhIP-seq、表面蛋白组学等多个独立证据层级,且包含功能验证和机制验证。
工程化人类心脏组织(hiPSC-CMs与心脏成纤维细胞共培养) hiPSC-CMs(WTC11-GCaMP6f) 原代人心脏成纤维细胞(NHCF-V) SLE患者队列(分为Myo-、Myo+SD-、Myo+SD+)
患者IgG浓度:0.5 μg/ml 电刺激频率递增方案:2 Hz至6 Hz,持续14天 培养时间:IgG处理14天 分组:Myo-(n=3)、Myo+SD-(n=4)、Myo+SD+(n=4)、健康对照(n=3) 钙处理测定:tau和FWHM,与基线比较
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立具有成熟心肌特征的体外模型,以模拟心肌应激和自身抗体结合环境。
将hiPSC-CMs和原代心脏成纤维细胞以3:1比例混合于纤维蛋白水凝胶中,在milliPillar平台上进行电机械刺激,培养于成熟培养基中。
评估不同临床亚组患者IgG与心脏组织的结合模式。
在培养第14天加入患者纯化IgG(0.5 μg/ml),继续培养14天;通过免疫荧光染色定量IgG结合水平(MFI),并分析结合模式。
检测患者IgG是否直接影响心脏组织的钙处理和收缩功能。
在IgG处理前(基线)和处理后第7天和第14天,测量组织钙瞬变(tau、FWHM)和收缩力。
确定Myo+SD+ IgG处理对组织转录谱的影响。
对处理后的组织进行RNA-seq,分析差异表达基因,并进行KEGG、GO通路分析和CIBERSORTx细胞组分预测。
验证Myo+SD+ IgG对心肌细胞线粒体功能的影响。
使用MitoTracker Green测定线粒体质量,Seahorse测定氧气消耗率,并测量SDH活性和线粒体膜电位(TMRM)。
识别Myo+SD+患者特异性的潜在致病性自身抗体及其靶点。
通过PhIP-seq分析患者IgG反应谱,结合心肌细胞和成纤维细胞表面蛋白组学,筛选与心肌损伤相关的候选靶点。
探究患者IgG是否促进心脏成纤维细胞增殖。
用患者IgG处理心脏成纤维细胞单层72小时,通过Ki-67染色定量增殖细胞比例。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| IgG纯化 | NAb Protein A/G离心试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 89950 |
| Zeba离心脱盐柱 | Thermo Fisher Scientific | 87766 | |
| 细胞培养 | mTeSR Plus培养基 | STEMCELL Technologies | 100-0276 |
| Matrigel基质胶 | Corning | 354230 | |
| EDTA | Thermo Fisher Scientific | 15575 | |
| 细胞分化 | RPMI 1640培养基 | Thermo Fisher Scientific | A4192302 |
| 重组人白蛋白 | Sigma-Aldrich | A9731 | |
| L-抗坏血酸2-磷酸 | Sigma-Aldrich | A8960 | |
| CHIR99021 | Tocris Bioscience | 4423 | |
| Wnt-C59 | Tocris Bioscience | 5148 | |
| II型胶原酶 | Worthington | LS004176 | |
| 胰酶 | Sigma-Aldrich | P7545 | |
| 细胞培养 | 成纤维细胞生长培养基3 | PromoCell | C-23130 |
| 外周血单个核细胞 | STEMCELL Technologies | 70025.2 | |
| 组织工程 | 聚二甲基硅氧烷 | Dow Chemical Company | 02065622 |
| 人纤维蛋白原 | Sigma-Aldrich | F3879 | |
| 人凝血酶 | Sigma-Aldrich | T6884 | |
| 6-氨基己酸 | Sigma-Aldrich | A7824 | |
| 免疫染色 | 抗人IgG二抗 | Thermo Fisher Scientific | A21090 |
| 抗α-肌动蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | A7811 | |
| 抗波形蛋白抗体 | Abcam | ab24525 | |
| NucBlue核染料 | Thermo Fisher Scientific | R37606 | |
| ProLong Diamond抗淬灭封片剂 | Invitrogen | 36961 | |
| 流式细胞术 | CF-647标记抗人IgG | Sigma-Aldrich | SAB4600181 |
| Apotracker Green凋亡检测试剂 | BioLegend | 427401 | |
| 碘化丙啶 | Thermo Fisher Scientific | R37169 | |
| 成像 | 激光共聚焦显微镜 | Nikon Instruments | -- |
| 高内涵成像系统 | BioTek Cytation 5, Agilent | -- | |
| 钙成像 | sCMOS相机 | Andor Technology | -- |
| 线粒体功能 | MitoTracker Green线粒体染料 | Thermo Fisher Scientific | M46750 |
| TMRM膜电位荧光探针 | -- | -- | |
| XF细胞线粒体应激测试试剂盒 | Agilent | 103015-100 | |
| SDH活性检测试剂盒 | Abcam | ab228560 | |
| RNA提取 | RNeasy微量试剂盒 | Qiagen | 74004 |
| RNA-seq | SMART-Seq v4超低起始量RNA试剂盒 | TaKaRa | -- |
| Nextera XT DNA文库制备试剂盒 | Illumina | -- | |
| 表面蛋白分析 | Pierce细胞表面生物素化与分离试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | A44390 |
| Halt蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Thermo Fisher Scientific | 78442 | |
| PhIP-seq | Q5热启动聚合酶 | New England Biolabs | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者队列 | 患者分组标准:18F-FDG PET/CT SUVmax≥1.5定义为心肌炎症;EF<50%定义为收缩功能障碍;样本量:Myo-(n=3)、Myo+SD-(n=4)、Myo+SD+(n=4)、健康对照(n=3)。 阅读提示:Methods部分'Patient cohort'和'18F-FDG PET/CT' |
| 工程化心脏组织制备 | hiPSC-CMs与成纤维细胞比例3:1;细胞浓度37,000 cells/μl;纤维蛋白原浓度5 mg/ml;培养于成熟培养基(MM);电刺激方案:2 Hz至6 Hz递增,持续14天。 阅读提示:Methods部分'Human engineered cardiac tissues'和'Optimization of engineered cardiac tissue culture medium' |
| IgG处理 | IgG浓度0.5 μg/ml;处理时间14天;添加时机为电刺激开始后7天(频率达到4 Hz时)。 阅读提示:Methods部分'Engineered cardiac tissue incubation with autoantibodies' |
| 钙处理测定 | 测量时间点为基线(第14天)和第21、28天;数据归一化至基线;参数:tau(τ)、FWHM、钙瞬变幅度等。 阅读提示:Methods部分'Calcium imaging and analysis' |
| 线粒体功能测定 | MitoTracker Green浓度及孵育时间;Seahorse检测中寡霉素、FCCP、鱼藤酮/抗霉素A的终浓度(1.5 μM、0.5 μM、0.5 μM);TMRM浓度(20 nM)及孵育时间(30分钟)。 阅读提示:Methods部分'MitoTracker Green assay'、'Measurement of mitochondrial membrane potential'和'Metabolic analysis' |