一种新型CRISPR/Cas9介导的结肠癌发生小鼠模型

A Novel CRISPR/Cas9-mediated Mouse Model of Colon Carcinogenesis

作者信息Hajime Kashima, Anthony Fischer, Daniel A Veronese-Paniagua, Vered A Gazit, Changqing Ma, Yan Yan, Marc S Levin, Blair B Madison, Deborah C Rubin
PMID39128652
发布时间2024
DOI10.1016/j.jcmgh.2024.101390

实验完整度

高

包含体外报告基因实验、转基因小鼠模型(icCas9N;PPAS和Vil-LCL-PLAGL2)、组织学、免疫组化/免疫荧光、qRT-PCR和Illumina测序等多层级验证。

主要模型

icCas9N;PPAS小鼠模型 icCas9N;PPAS;Vil-LCL-PLAGL2小鼠模型 HEK293T细胞

重点核对

多西环素诱导基因编辑的严格性与无泄漏性(使用rtTA和tTS双重系统) 肿瘤抑制基因(Apc、Pten、Smad4、Trp53)的突变频率和突变模式 PLAGL2过表达对结肠和小肠肿瘤数量及大小的影响 正常相邻组织中靶基因突变的存在与否

摘要

背景与目的 人类散发性结直肠癌(CRC)源于一个多步骤途径,该途径涉及结直肠上皮细胞中特定基因突变的顺序获得。体内建模CRC对于理解肿瘤微环境至关重要。为了精确重现人类CRC发病机制,小鼠模型必须包含这些多步骤的遗传异常。本研究旨在生成一种更接近模拟该多步骤过程的散发性CRC模型,并利用该模型研究新的Let7靶点PLAGL2在CRC发病机制中的作用。 方法 我们生成了一种CRISPR/Cas9体细胞突变小鼠模型,该模型是可诱导的、多重化的,可同时灭活涉及CRC发病机制的多个基因。我们同时使用了多西环素诱导的转录激活子和多西环素失活的转录抑制子,以实现Cas9切口酶的紧密、无泄漏表达。该小鼠转基因表达多个导向RNA,以在肠道上皮中诱导CRC中常见的4个肿瘤抑制基因Apc、Pten、Smad4和Trp53的散发性失活。这些小鼠与Vil-LCL-PLAGL2小鼠杂交,后者在肠道上皮中具有Cre诱导的PLAGL2过表达。 结果 这些小鼠在所有4个靶向肿瘤抑制基因中表现出随机的体细胞突变,导致小肠和结肠中出现多个腺瘤和腺癌。与Vil-LCL-PLAGL2小鼠的杂交表明,肠道特异性PLAGL2过表达增加了结肠肿瘤的生长。 结论 该条件性模型代表了一种新的CRISPR/Cas9介导的结直肠癌发生小鼠模型。这些小鼠可用于研究新的、先前未表征的基因在多种常见突变肿瘤抑制基因背景下的CRC中的作用,从而更接近地模拟人类CRC发病机制。 关键词:结直肠肿瘤,CRISPR/Cas9,小鼠模型,PLAGL2

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
本研究旨在开发一种更接近模拟人类CRC多步骤发病过程的小鼠模型,并利用该模型研究Let7靶点PLAGL2在CRC发病机制中的作用。
核心机制
PLAGL2过表达通过增加Tnfrsf19表达和Smad4突变频率,可能通过抑制TGFβ信号通路促进结肠肿瘤生长。
主要证据
icCas9N;PPAS;Vil-LCL-PLAGL2小鼠与icCas9N;PPAS小鼠相比,结肠肿瘤数量和大小显著增加,且结肠肿瘤中Tnfrsf19 mRNA表达升高、Smad4突变率增加。
研究意义
该模型可用于研究新型基因在结直肠癌发生中的作用,更接近地模拟人类CRC发病机制,并为PLAGL2作为潜在治疗靶点提供支持。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

模型构建与验证

建立并验证可诱导、多重化的CRISPR/Cas9体细胞突变小鼠模型,确保Cas9表达的紧密调控和靶向多个肿瘤抑制基因。

生成icCas9N小鼠(含rtTA和tTS系统)和PPAS小鼠(表达靶向Apc、Pten、Smad4、Trp53的gRNA),杂交获得icCas9N;PPAS小鼠。体外报告基因实验验证无泄漏表达,并对靶基因突变进行测序分析。

2

肿瘤诱导与表型分析

确定多西环素处理时间对肿瘤发生的影响,并分析肿瘤位置、组织学和突变谱。

对icCas9N;PPAS小鼠进行多西环素处理2周或3周,解剖后计数肿瘤、进行组织学分析、免疫组化和Illumina测序。

3

RNA表达分析

检测肿瘤和正常组织中Plagl2及其靶基因和干性标志物的表达变化。

提取肿瘤和正常组织的RNA,进行qRT-PCR分析。

4

PLAGL2过表达对肿瘤发生的影响

评估PLAGL2过表达在多个肿瘤抑制基因突变背景下对肠道肿瘤发生的作用。

将icCas9N;PPAS小鼠与Vil-LCL-PLAGL2小鼠杂交,通过他莫昔芬诱导PLAGL2过表达,比较肿瘤数量和大小,并分析基因表达和突变频率。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
HEK293T细胞----
多西环素EnvigoTD.01533
他莫昔芬Cayman--
异氟烷Patterson Veterinary--
石蜡----
Diva Decloaker缓冲液BIOcare Medical--
30%过氧化氢MilliporeHX0635-3
SuperBlock (PBS)封闭缓冲液Thermo Fisher Scientific--
β-catenin兔单克隆抗体Cell Signaling TechnologyD10A8
Smad4兔多克隆抗体Cell Signaling Technology9515
抗HA标签兔单克隆抗体Cell Signaling TechnologyC29F4
Da Vinci Green缓冲液Biocare Medical--
兔HRP聚合物Biocare Medical--
Betazid DAB显色液Biocare Medical--
AlexaFluoro 568荧光二抗Thermo Fisher Scientific--
AllPrep DNA/RNA Mini试剂盒Qiagen--
BeadBug匀浆器BenchMark Scientific--
Nanodrop2000分光光度计Thermo Scientific--
SuperScript IV逆转录酶Thermo Fisher Scientific18090010
Oligo(dT)20引物Invitrogen18418020
Bullseye实时qPCR预混液MidsciBEQPCR-S
CFX Connect实时荧光定量PCR检测系统Biorad--
Q5热启动DNA聚合酶New England BioLabs--
Qubit高灵敏度试剂盒Thermo Fisher Scientific--
Monarch PCR和DNA纯化试剂盒New England BioLabs--
Illumina测序平台Illumina--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
体外报告基因实验
细胞培养条件、质粒转染量和比例、多西环素浓度(0.5 μg/ml)和处理时间(72小时)
阅读提示:Methods部分(icCas9N mice)和图1B
动物模型构建与诱导
小鼠遗传背景(C57BL/6);多西环素饲料品牌、浓度和喂食时间(2周或3周,从6周龄开始);他莫昔芬剂量(250 mg/kg/天)、给药途径(腹腔注射)和时间(第49天和51天)
阅读提示:Methods部分(Doxycycline and Tamoxifen Administration),图4H
肿瘤分析
肿瘤计数方法(解剖显微镜);肿瘤大小测量方法(ImageJ);组织学分级标准(WHO标准)
阅读提示:Methods部分(Tumor Examination and Tissue Collection;Histologic Analysis of Tumors),图5E-I
基因表达分析
RNA提取方法;qRT-PCR使用的引物序列、内参基因(18s rRNA或GAPDH)、分析方法(2-ΔΔCT)
阅读提示:Methods部分(DNA and RNA Extraction From Mouse Intestines;Reverse Transcription and qRT-PCR),表5
突变分析
PCR扩增条件(Q5热启动聚合酶,30个循环);测序文库制备;CRISPResso2分析参数(平均质量>30,单碱基质量>10)
阅读提示:Methods部分(Illumina Sequencing for Mutation Profiles),表6和表7