患者样本收集与分组
获取LVAD支持后有或无CRR的患者以及正常对照的左心室组织样本,为后续单核RNA测序提供材料。
收集4名正常对照、4名CRR患者和4名NCRR患者的左心室组织样本,并依据超声心动图参数定义CRR。
Overexpression of ATP5F1A in Cardiomyocytes Promotes Cardiac Reverse Remodeling
结合单核RNA测序、患者样本、TAC和DCM小鼠模型,并进行功能验证(超声、病理、代谢检测)。
C57BL/6J小鼠TAC手术模型 DCM转基因小鼠模型(cTnTR141W) LVAD支持患者左心室组织样本
AAV9-cTNT-ATP5F1A的注射剂量为1×10^12病毒基因组/小鼠,经尾静脉注射 TAC小鼠在术前2周接受AAV9注射,并在注射后42天和56天进行超声心动图检测 DCM小鼠在注射前和注射后56天进行超声心动图检测 通过超声心动图检测LVEF和LVEDV评估心脏功能
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获取LVAD支持后有或无CRR的患者以及正常对照的左心室组织样本,为后续单核RNA测序提供材料。
收集4名正常对照、4名CRR患者和4名NCRR患者的左心室组织样本,并依据超声心动图参数定义CRR。
识别与CRR相关的关键细胞类型和分子特征。
从组织样本中提取细胞核进行snRNA-seq,鉴定细胞类型,比较各组差异表达基因和细胞比例,并进行轨迹分析。
验证心肌细胞中ATP5F1A过表达是否能促进CRR。
构建AAV9-cTNT-ATP5F1A载体,通过尾静脉注射到TAC和DCM小鼠中,利用超声心动图和病理染色评估效果。
评估ATP5F1A过表达对心脏功能、形态和代谢的影响。
通过超声心动图检测LVEF和LVEDV,Masson染色评估纤维化,WGA染色评估心肌细胞大小,Seahorse测量耗氧率(OCR)和细胞外酸化率(ECAR)。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 组织病理学分析 | Masson三色染色试剂盒 | Solarbio | G1340 |
| 免疫组化染色 | ATP5F1A抗体 | Abcam | ab176569 |
| TTN抗体 | Abcam | ab307446 | |
| CD68抗体 | Abcam | ab955 | |
| SPARC抗体 | Abcam | ab203284 | |
| HSPG2抗体 | Abcam | ab2501 | |
| CD31抗体 | Abcam | ab182981 | |
| LDB2抗体 | Proteintech | 11873-1-AP | |
| TXNIP抗体 | Abcam | ab188865 | |
| ACTC1抗体 | Abcam | ab46805 | |
| MYH6抗体 | Proteintech | 22281-1-AP | |
| CD3抗体 | Abcam | ab16669 | |
| CD2抗体 | Abcam | ab314761 | |
| PTK2抗体 | Abcam | ab40794 | |
| GNLY抗体 | Abcam | ab241333 | |
| IL7R抗体 | Abcam | ab259806 | |
| vWF抗体 | Abcam | ab6994 | |
| FLRT2抗体 | GeneTex | GTX123309 | |
| PCSK5抗体 | Proteintech | 16470-1-AP | |
| PDE3A抗体 | Abcam | ab244337 | |
| 免疫组化分析 | Vectra定量病理成像系统 | PerkinElmer | -- |
| 图像分析 | Image J软件 | -- | version |
| 超声心动图 | Vevo 3100成像系统 | FUJIFILM | -- |
| 代谢测量 | Seahorse XF细胞线粒体压力测试试剂盒 | Agilent | 103015-100 |
| 胰岛捕获微孔板 | Agilent | 103518-100 | |
| Seahorse XFe24分析仪 | Agilent | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本 | CRR定义标准(LVEF≥40%,左心室舒张末期内径<6cm,LVEF增加≥5%);样本量4例每组 阅读提示:Methods部分Sample Collection |
| TAC小鼠模型 | C57BL/6J小鼠年龄(3周龄用于AAV注射),TAC手术方法,AAV9注射剂量和途径(1×10^12病毒基因组/小鼠尾静脉注射),超声心动图时间点(注射后42天和56天) 阅读提示:Methods部分Transverse Aortic Constriction和Adeno-Associated Virus 9 Vector Construction and Injection,Results部分Overexpression of ATP5F1A in Cardiomyocytes Could Promote CRR |
| DCM小鼠模型 | cTnTR141W转基因小鼠,AAV9注射剂量和途径(1×10^12病毒基因组/小鼠尾静脉注射),超声心动图时间点(注射前和注射后56天) 阅读提示:Methods部分Dilated Cardiomyopathy Mouse Model和Adeno-Associated Virus 9 Vector Construction and Injection |
| 代谢测量 | 使用Seahorse XFe24分析仪,试剂盒(103015-100),微孔板(103518-100),组织厚度100μm 阅读提示:Methods部分Oxygen Consumption Rate and Extracellular Acidification Rate Calculation |