分析 JUN 表达与前列腺癌分期及预后的关联
探索 JUN 表达水平是否随前列腺癌进展而变化,并评估其与患者生存的关联。
使用人类组织微阵列(TMA)通过免疫组化检测不同 Gleason 评分肿瘤中 JUN 蛋白水平;利用公开数据集分析 JUN mRNA 在原发性肿瘤、转移灶及不同风险组中的表达;通过 Kaplan-Meier 分析评估 JUN 表达与无复发生存期的相关性。
JUN mediates the senescence associated secretory phenotype and immune cell recruitment to prevent prostate cancer progression
包含人类样本 TMA 分析、小鼠遗传模型、转录组学、蛋白质印迹、免疫组化及功能验证,并验证了体内外功能。
Pten 缺陷小鼠前列腺癌模型(PtenPEΔ/Δ) Jun/Pten 双敲除小鼠模型(JunPEΔ/Δ; PtenPEΔ/Δ) 人前列腺癌细胞系 DU145 和 PC3 人类前列腺癌组织芯片(TMA)样本
小鼠模型中 Pten 和 Jun 的条件性敲除(PbCre 介导) 人类样本中 JUN 蛋白表达与 Gleason 评分的相关性 JUN 表达与患者无生化复发生存期的关联 衰老相关分泌表型(SASP)相关细胞因子(IL-1β、TNF-α、CCL3、CCL8)水平 STAT3 磷酸化水平(pSTAT3Y705)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探索 JUN 表达水平是否随前列腺癌进展而变化,并评估其与患者生存的关联。
使用人类组织微阵列(TMA)通过免疫组化检测不同 Gleason 评分肿瘤中 JUN 蛋白水平;利用公开数据集分析 JUN mRNA 在原发性肿瘤、转移灶及不同风险组中的表达;通过 Kaplan-Meier 分析评估 JUN 表达与无复发生存期的相关性。
建立 Pten 缺陷引发的前列腺癌模型,并在此基础上敲除 Jun,以研究 JUN 在肿瘤发展中的功能。
通过 PbCre 介导的 Pten 和 Jun 在前列腺上皮中的条件性敲除,产生四种基因型:野生型(wt)、Jun 单敲除(JunPEΔ/Δ)、Pten 单敲除(PtenPEΔ/Δ)、Jun/Pten 双敲除(JunPEΔ/Δ;PtenPEΔ/Δ)。
验证 Jun 缺失是否影响肿瘤负荷和生存期。
通过前列腺重量测量、组织学 H&E 染色及 Kaplan-Meier 生存分析比较不同基因型小鼠的表型差异。
揭示 JUN 在前列腺癌细胞中调控的基因表达网络,特别是衰老和免疫相关通路。
通过磁珠分选获取 EpCAM 阳性的前列腺上皮细胞,进行 RNA 测序,比较四种基因型间的差异表达基因,并进行 GO 富集和 GSEA 分析。
验证 JUN 是否调节 SASP 因子表达和免疫细胞募集。
通过免疫组化检测中性粒细胞(NIMP-R14)、巨噬细胞(F4/80)、B 细胞(CD79b)浸润;通过 Western blot 和多重免疫分析检测 IL-1β、TNF-α、NLRP3 等蛋白水平。
验证 JUN 表达与 SASP 因子及患者预后的相关性。
分析 TCGA-PRAD 数据库中 JUN、IL1B、CCL3、CCL8 表达及 pSTAT3Y705 水平,进行相关性和生存分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫荧光 | EpCAM 抗体 | Elab Science | E-AB-70132 |
| 蛋白质印迹 | pJUN (Ser73) 抗体 | Cell Signaling Technology | 9164 |
| JUN 抗体 | Cell Signaling Technology | 9165 | |
| pAKT (Ser473) 抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| AKT 抗体 | Cell Signaling Technology | 4691 | |
| β-肌动蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 4967 | |
| NLRP3 抗体 | Cell Signaling Technology | 15101 | |
| Pro-IL-1β 抗体 | R&D Systems | AF-401-NA | |
| β-微管蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 2146 | |
| 细胞分选 | 抗 CD326 生物素 | eBioscience | 13-5791-82 |
| RNA-seq | Magnisort™ 磁珠分选试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| RNA 质量检测 | 4200 TapeStation 系统 | Agilent | -- |
| 免疫组化 | NIMP-R14 抗体 | -- | -- |
| F4/80 抗体 | -- | -- | |
| CD79b 抗体 | -- | -- | |
| 颗粒酶 B 抗体 | -- | -- | |
| pSTAT3 抗体 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型 | Pten 和 Jun 的条件性敲除基因型、Cre 重组酶表达、小鼠周龄(19周)、伦理批准号 阅读提示:Methods: Mouse strains and animal work |
| 免疫组化 | 抗体克隆、稀释度、抗原修复条件、阳性细胞定量方法 阅读提示:Methods: Histological staining, Whole slide scan analysis |
| 蛋白质印迹 | 蛋白上样量(15-20 µg)、抗体稀释度、内参选择、封闭条件 阅读提示:Methods: Protein extraction and immune blotting |
| RNA-seq | EpCAM 细胞分选、RNA 质量要求、测序平台、差异表达阈值 阅读提示:Methods: Magnetic cell sorting, library preparation and RNA sequencing, RNA sequencing data analysis |
| 人体样本分析 | TMA 样本量、Gleason 评分分组、JUN 表达分级标准、生存分析分组 阅读提示:Methods: Human tissue microarray analysis, Kaplan–Meier survival analyses of public datasets |