患者队列临床与遗传特征描述
识别FLNC变异谱及表型关联。
多家族遗传分析,记录临床心肌病和心律失常表现。
Reduction of Filamin C Results in Altered Proteostasis, Cardiomyopathy, and Arrhythmias
包含多证据层级:患者临床与遗传分析、iPSC-CMs模型、基因编辑等基因对照、蛋白质稳态功能验证、场电位与工程心脏组织功能评估。
患者来源iPSC-CMs(携带FLNC变异) CRISPR-Cas9基因编辑的健康对照iPSC-CMs(FLNC ABD-/-) 工程心脏组织(EHTs)
FLNC基因编辑靶向肌动蛋白结合域(ABD),通过Sanger测序和扩增子测序确认克隆纯度 低剂量硼替佐米处理浓度0.1 μM,处理24小时 场电位测量在CardioExcyte 96平台上进行,以1 Hz起搏 EHTs收缩性指数在基因型和治疗盲法下评分,至少每个条件4个视频
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
识别FLNC变异谱及表型关联。
多家族遗传分析,记录临床心肌病和心律失常表现。
确定FLNC变异对蛋白表达的影响。
从患者成纤维细胞、尿细胞或PBMC生成iPSCs,分化为心肌细胞,通过免疫印迹和免疫荧光评估filamin C表达和定位。
创建等基因对照以研究filamin C功能缺失。
CRISPR-Cas9靶向FLNC外显子1(ABD),生成FLNC ABD-/- iPSCs,并验证编辑效率和脱靶。
检验filamin C缺失下蛋白质稳态维持能力。
对iPSC-CMs进行硼替佐米处理,检测伴侣蛋白和自噬标志物表达。
评估filamin C缺失对动作电位时程的影响。
使用多电极阵列记录iPSC-CMs的场电位,并在硼替佐米处理下监测变化。
在三维组织水平评估filamin C缺失对收缩功能的影响。
生成EHTs,测量硼替佐米处理前后的收缩性指数。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | mTeSR-1培养基 | Stem Cell Technologies | 85850 |
| 细胞分化 | CDM3培养基 | -- | -- |
| CHIR99021 | -- | -- | |
| Wnt-C59 | -- | -- | |
| 细胞分离 | TrypLE | Thermo | 12563011 |
| 基因编辑 | pSpCas9(BB)-2A-GFP质粒 | Addgene | 48138 |
| CloneR | Stem Cell | 5888 | |
| Thiazovivin | Sigma | SML1045 | |
| 嘌呤霉素 | Thermo | A1113803 | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo | 15596-018 |
| RT-qPCR | AmpliTaq Gold 360预混液 | Thermo | 4398881 |
| 蛋白提取 | 蛋白酶抑制剂混合物 | Sigma | 11836170001 |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | Sigma | 4906837001 | |
| 蛋白定量 | Bradford 1X染料试剂 | Biorad | 5000205 |
| Western blot | Laemmli蛋白上样缓冲液 | Biorad | 1610747 |
| 预制蛋白胶 | Biorad | 4561083 | |
| PVDF膜 | Biorad | 1620177 | |
| T20封闭缓冲液 | Thermo | 37543 | |
| FLNC抗体 | Sigma | HPA006135 | |
| FLNC抗体 | ABClonal | A13018 | |
| BAG3抗体 | Proteintech | 10599-1-AP | |
| HSPB8抗体 | Proteintech | 15287-1-AP | |
| HSP70抗体 | Proteintech | 10995-1-AP | |
| p62/SQSTM1抗体 | Proteintech | 18420-1-AP | |
| LC3抗体 | Sigma | L8918 | |
| α-肌节肌动蛋白抗体 | Sigma | A2172 | |
| 羊抗鼠IgG二抗 | Jackson ImmunoResearch | 115-035-003 | |
| 羊抗兔IgG二抗 | Jackson ImmunoResearch | 111-035-003 | |
| PICO化学发光底物 | Thermo | 34580 | |
| Femto化学发光底物 | Thermo | 34096 | |
| iBright 1500成像系统 | Invitrogen | -- | |
| Memcode可逆蛋白染色试剂盒 | Thermo | 24585 | |
| 免疫荧光 | α-actinin抗体 | Sigma | A7811 |
| 羊抗兔IgG二抗 | Invitrogen | A11012 | |
| 驴抗鼠IgG二抗 | Invitrogen | A21202 | |
| Prolong Gold封片剂 | Thermo | P36930 | |
| Axio Imager M2显微镜 | Zeiss | -- | |
| 药物处理 | 硼替佐米 | Cell Signaling | 2204S |
| 电生理 | CardioExcyte 96平台 | Nanion Technologies | -- |
| DataControl软件 | Nanion Technologies | -- | |
| 细胞分析 | Acuri C6 Plus流式细胞仪 | BD | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| iPSC-CMs分化 | 分化方案(Wnt调节)、CDM3培养基成分、CHIR99021浓度和暴露时间、Wnt-C59浓度和暴露时间 阅读提示:Methods: Generation and Differentiation of iPSC Lines |
| 基因编辑 | guide RNA序列、转染方法、筛选药物浓度和持续时间 阅读提示:Methods: Gene Editing/Off Target Analysis, Genotyping |
| 蛋白质稳态应激处理 | 硼替佐米浓度(0.1 μM)、处理时间(24小时) 阅读提示:Methods: Proteotoxic Stress With Bortezomib |
| 场电位测量 | 起搏参数(1 Hz)、数据记录平台(CardioExcyte 96)、处理浓度 阅读提示:Methods: Multielectrode Array Measurements |
| EHT功能评估 | EHT生成方案、硼替佐米处理浓度和时间、收缩性评分标准 阅读提示:Methods: Engineered Heart Tissue Generation |