建立肥胖诱导的HCC小鼠模型并验证
模拟人类NAFLD-NASH-HCC进展,并验证模型中的代谢和炎症特征
给6周龄C57BL/6J小鼠喂食CD-HFD或对照饮食长达15个月,检测体重、脂肪量、葡萄糖耐量、胰岛素敏感性、肝脏脂质积累、炎症和纤维化。
Fatty acid binding protein 5 suppression attenuates obesity-induced hepatocellular carcinoma by promoting ferroptosis and intratumoral immune rewiring
包括体外细胞实验(Huh7、BMDM)、动物模型(CD-HFD诱导HCC、MC38移植瘤)、基因敲除小鼠(Fabp5HKO)、单细胞转录组及代谢通量分析,并进行了功能验证和机制验证。
CD-HFD诱导的肥胖相关HCC小鼠模型 肝细胞特异性FABP5敲除小鼠(Fabp5HKO) Huh7人肝癌细胞系 MC38皮下移植瘤模型
CD-HFD喂养时间(15个月)及对照组饮食 SBFI-103给药剂量(15 mg/kg,腹腔注射)和频率(每两天一次,共3个月) FABP5 siRNA处理浓度和时间(5 μM,48小时) CD-HFD诱导HCC的动物数量(每组n=11-20) BMDM与OT-I T细胞共培养的比例(1:5)和SIINFEKL肽浓度(100 ng/ml)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟人类NAFLD-NASH-HCC进展,并验证模型中的代谢和炎症特征
给6周龄C57BL/6J小鼠喂食CD-HFD或对照饮食长达15个月,检测体重、脂肪量、葡萄糖耐量、胰岛素敏感性、肝脏脂质积累、炎症和纤维化。
描绘HCC进展过程中不同细胞类型的转录组变化,识别关键驱动基因
对15个月CD-HFD或ND喂养的小鼠肝脏细胞进行scRNA-seq,包括实质细胞和非实质细胞,将细胞聚类并注释,进行拟时间分析以追踪肝细胞向癌细胞转化过程中的基因表达变化。
验证FABP5抑制或沉默是否增加癌细胞对脂质过氧化和铁死亡的敏感性
用SBFI-103(5 μM)或FABP5 siRNA处理Huh7细胞48小时,检测脂质摄取、脂质过氧化(MDA、BODIPY 581/591 C11)、ROS(CellROX)、ER应激蛋白(PERK、ATF4、IRE1A、BIP)和细胞死亡。
确定FABP5抑制能否减轻CD-HFD诱导的HCC负担并促进肿瘤铁死亡
CD-HFD喂养12个月后,给小鼠腹腔注射SBFI-103(15 mg/kg,每两天一次)或载体,持续3个月。评估肿瘤发生率、结节数、体积、AFP水平、增殖/凋亡标志物、YAP信号通路、脂质过氧化和铁死亡标志物。
确定肝细胞特异性FABP5缺失是否保护小鼠免受HCC发展
生成Fabp5flox/flox;AlbCreERT2小鼠,他莫昔芬诱导敲除肝细胞FABP5,CD-HFD喂养15个月,评估肿瘤负担、AFP水平、脂质过氧化和铁死亡标志物。
确定FABP5抑制是否改变肿瘤免疫细胞组成和功能
对SBFI-103处理的HCC组织进行scRNA-seq,分析免疫细胞亚群,通过流式细胞术验证巨噬细胞表型(CD80/CD86、Ly6C)和T细胞活化(CD44/CD62L、Ki67),RNAscope验证空间分布。在MC38模型中验证其普适性。
确定FABP5抑制巨噬细胞是否增强CD8+ T细胞的活化和杀伤能力
用IL-4极化BMDMs并给予SBFI-103或siRNA处理,与OT-I T细胞和B16-OVA细胞共培养,检测T细胞活化标志物、增殖和细胞毒性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 饮食诱导 | 胆碱缺乏高脂饮食 | Research Diets | D05010402 |
| 对照饮食 | 对照饮食 | Research Diets | D12450H |
| FABP5抑制 | SBFI-103 | Stony Brooks University | -- |
| FABP5敲低 | FABP5 siRNA | Dharmacon | L-008710-00-0010 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| RPMI 1640培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | R&D Systems | -- | |
| L-谷氨酰胺 | Sigma | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Gibco | -- | |
| 胶原酶I | Sigma | SCR103 | |
| 脱氧核糖核酸酶I | Roche | 4716728001 | |
| Percoll分离液 | Sigma | P1644 | |
| 流式细胞术 | LIVE/DEAD固定性Aqua死细胞染色试剂盒 | Invitrogen | L34957 |
| 红细胞裂解液 | Roche | 11814389001 | |
| PMA/离子霉素细胞刺激混合物 | Invitrogen | 00-4970-93 | |
| 细胞增殖检测 | CellTrace Violet细胞增殖染料 | Invitrogen | C34557 |
| 脂质过氧化检测 | 丙二醛检测试剂盒 | Abcam | Ab118970 |
| BODIPY 581/591 C11荧光探针 | Invitrogen | D3861 | |
| 活性氧检测 | CellROX活性氧检测试剂 | Invitrogen | C10444 |
| 二氢乙啶 | -- | -- | |
| 脂肪酸摄取检测 | BODIPY FL C16荧光脂肪酸 | Invitrogen | D3821 |
| 葡萄糖摄取检测 | 2-NBDG荧光葡萄糖类似物 | Invitrogen | N13195 |
| 代谢分析 | Seahorse XF96 V3-PS细胞培养微孔板 | Agilent | 101085-004 |
| BSA偶联棕榈酸 | Sigma | P9767 | |
| 左旋肉碱 | Sigma | A6706 | |
| 依托莫昔 | Cayman Chemical | 828934-41-4 | |
| 寡霉素 | Sigma | 75351 | |
| FCCP解偶联剂 | Sigma | C2920 | |
| 鱼藤酮 | Sigma | R8875 | |
| RIPA裂解液 | -- | -- | |
| Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo | 23227 | |
| Western blot | 蛋白酶抑制剂混合物 | Abcam | ab271306 |
| 免疫组化 | 抗FABP5抗体 | R&D Systems | AF1476 |
| 免疫荧光 | 抗AFP抗体 | Proteintech | 14550-1-AP |
| 抗CD68抗体 | Bio-Rad | MCA1957 | |
| 鬼笔环肽-Alexa Fluor 647 | Thermo Fisher | A22287 | |
| DAPI染料 | Vector Laboratories | H-1200 | |
| RNAscope | RNAscope多重荧光试剂盒v2 | ACD Bio | 320293 |
| PCR | RNeasy小型RNA提取试剂盒 | QIAGEN | -- |
| iScript cDNA合成试剂盒 | Bio-Rad | -- | |
| SsoFast EvaGreen预混液 | Bio-Rad | -- | |
| 细胞凋亡检测 | TUNEL检测试剂盒 | QIAGEN | 74104 |
| 细胞培养 | 重组小鼠IL-4 | Peprotech | 214-14 |
| 精氨酸酶活性检测 | 精氨酸酶活性检测试剂盒 | Abcam | Ab180877 |
| 抗原递呈 | SIINFEKL肽 | Sigma | S7951 |
| 细胞毒性检测 | NucView 488 caspase-3底物 | Biotium | 10405 |
| GolgiPlug蛋白转运抑制剂 | BD | 555029 | |
| 生化检测 | ALT活性检测试剂盒 | Abcam | ab105134 |
| AST活性检测试剂盒 | Sigma | MAK055 | |
| AFP ELISA试剂盒 | R&D Systems | MAFP00 | |
| 脂质检测 | 甘油三酯检测试剂盒 | Abcam | Ab206386 |
| 胆固醇检测试剂盒 | Wako | 999-02601 | |
| 油红O | Sigma | O0625 | |
| 组织固定 | 福尔马林 | Sigma | -- |
| 组织学 | 蔗糖 | Sigma | S0389 |
| Triton X-100去垢剂 | Sigma | T8787 | |
| IHC | 过氧化氢 | Sigma | H1009 |
| 驴血清 | Sigma | D9663 | |
| 生物素化兔抗羊IgG | Jackson | 305-065-046 | |
| 链霉亲和素过氧化物酶 | Rockland | S000-03 | |
| DAB底物 | Rockland | DAB-10 | |
| 显微镜 | EVOS XL Core显微镜 | Thermo Scientific | AMEX1000 |
| Motic EasyScan Infinity 60扫描仪 | Motic | -- | |
| SELLARIS共聚焦显微镜 | Leica | -- | |
| 流式细胞术 | LSR II流式细胞仪 | BD | -- |
| FACSAria II流式分选仪 | BD | -- | |
| Western blot | Odyssey红外成像系统 | LI-COR | -- |
| 血糖检测 | Contour Ultra血糖仪 | Bayer | -- |
| 葡萄糖耐受测试 | 葡萄糖 | Thermo | A16828.0C |
| 胰岛素耐受测试 | 胰岛素 | Gibco | 12585014 |
| 电镜 | 醋酸铀酰 | Fisher Scientific | 18-607-646 |
| Poly/bed 812环氧树脂 | Polysciences | 08792-1 | |
| 代谢通量分析 | [1,2,3,4,5,6,6-2H7]葡萄糖 | -- | -- |
| [3-13C]乳酸钠 | -- | -- | |
| RNA-seq | RNeasy Plus微量RNA提取试剂盒 | QIAGEN | -- |
| TrueSeq小RNA文库制备试剂盒 | Illumina | -- | |
| 单细胞测序 | 单细胞3'试剂盒v2 | 10x Genomics | -- |
| HiSeq 4000测序仪 | Illumina | -- | |
| RNA-seq | NovaSeq测序平台 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系、年龄、性别、饮食类型、喂养时长 阅读提示:Methods: Mice |
| FABP5抑制处理 | SBFI-103剂量、给药途径、频率、持续时间 阅读提示:Methods: SBFI-103 administration in animals, cell lines and primary cells |
| 细胞实验 | 细胞系、培养条件、处理浓度和时间 阅读提示:Methods: Cell lines and primary cell culture |
| 脂质过氧化和铁死亡检测 | MDA、BODIPY C11、CellROX检测步骤、细胞密度和染色时间 阅读提示:Methods: Lipid peroxidation measurements |
| 巨噬细胞与T细胞共培养 | BMDM分化条件、IL-4浓度、SBFI-103/siRNA浓度、共培养比例和时长 阅读提示:Methods: Antigen-presenting assay and CD8+ T cell co-culture |
| 单细胞转录组测序 | 细胞制备、建库试剂盒、测序平台和参数 阅读提示:Methods: Droplet-based scRNA-seq library construction |