人类肾脏内皮细胞整合单细胞转录组图谱

要点：我们创建了一个全面的正常人类肾脏内皮细胞参考图谱。我们证实人类肾脏中的内皮细胞类型在小鼠肾脏中也高度保守。背景：肾脏内皮细胞暴露于支持特定生理过程的不同微环境条件下。然而，人类肾脏内皮细胞的异质性尚未得到系统描述。方法：我们以相同流程重新处理并整合了七个包含超过20万个肾脏细胞的人类肾脏对照单细胞/单核RNA测序数据集。结果：我们识别出五种主要细胞类型，其中29,992个为内皮细胞。内皮细胞重新聚类确定了七个亚群，这些亚群在分子特征和生理功能上存在差异。将新数据映射到正常肾脏内皮细胞图谱可实现快速数据注释和分析。我们证实人类肾脏中的内皮细胞类型在小鼠肾脏中也高度保守，并鉴定了在人类和小鼠中保守的内皮标记基因，以及对应亚群之间的差异表达基因。此外，单细胞转录组数据与公共全基因组关联研究数据的联合分析显示，内皮细胞（尤其是动脉内皮细胞）在血压遗传性中显著富集。最后，我们从内皮细胞的共表达网络中鉴定出可能深度参与血压调节的M1和M12。结论：我们创建了一个全面的正常人类肾脏内皮细胞参考图谱，为理解肾脏内皮细胞在疾病、衰老及物种间的身份和功能如何改变提供了分子基础。最后，我们提供了一个可公开访问的在线工具，用于探索本研究中描述的数据集（https://vascularmap.jiangnan.edu.cn）。