人类肾脏内皮细胞的整合单细胞转录组图谱

关键点：我们创建了正常人类肾脏内皮细胞的全面参考图谱。我们证实人类肾脏中的内皮细胞类型在小鼠肾脏中也高度保守。背景：肾脏内皮细胞暴露于不同的微环境条件，支持特定的生理过程。然而，人类肾脏内皮细胞的异质性尚未得到系统描述。方法：我们以相同流程重新处理并整合了七个包含超过200,000个肾脏细胞的人类肾脏对照单细胞/单核RNA测序数据集。结果：我们鉴定了五种主要细胞类型，其中29,992个是内皮细胞。内皮细胞的重新聚类确定了七个亚群，这些亚群在分子特征和生理功能上有所不同。将新数据映射到正常肾脏内皮细胞图谱可以实现快速的数据注释和分析。我们证实人类肾脏中的内皮细胞类型在小鼠肾脏中也高度保守，并鉴定出人类和小鼠中保守的内皮标记基因，以及相应亚群之间的差异表达基因。此外，单细胞转录组数据与公共全基因组关联研究数据的联合分析显示，内皮细胞，尤其是动脉内皮细胞，在血压遗传力中显著富集。最后，我们从内皮细胞中的共表达网络鉴定了M1和M12，它们可能深度参与血压调节。结论：我们创建了正常人类肾脏内皮细胞的全面参考图谱，为理解肾脏内皮细胞的身份和功能在疾病、衰老和物种间如何改变提供了分子基础。最后，我们提供了一个公开可访问的在线工具来探索本工作中描述的数据集（https://vascularmap.jiangnan.edu.cn）。