FAM131B-AS2拷贝数增加通过缓解复制应激促进胶质母细胞瘤进展

Copy number gain of FAM131B-AS2 promotes the progression of glioblastoma by mitigating replication stress

作者信息Shaobo Wang, Yanhua Qi, Rongrong Zhao, Ziwen Pan, Boyan Li, Wei Qiu, Shulin Zhao, Xiaofan Guo, Shilei Ni, Gang Li, Hao Xue
PMID38285005
发布时间2024-06-03
DOI10.1093/neuonc/noae014

摘要

背景:胶质母细胞瘤(GBM)的特征是7号染色体拷贝数增加,尤其是7q34区域,这可能与治疗抵抗相关,但潜在的癌基因尚未完全明确。值得注意的是,长链非编码RNA(lncRNA)在此背景下的作用日益受到关注,需要进一步探索。方法:通过qPCR检测GBM样本和细胞中FAM131B-AS2的表达水平。在GBM细胞中过表达和敲低FAM131B-AS2以研究其在体内外的功能。利用RNA-seq、qPCR、Western blotting、RNA pull-down、共免疫沉淀实验及质谱分析探究FAM131B-AS2的作用机制。通过CCK8实验、EdU实验、彗星实验和免疫荧光评估FAM131B-AS2变化引起的表型改变。结果:对149例原发性GBM患者的分析发现,位于7q34区域的lncRNA FAM131B-AS2表达上调预示不良预后。机制上,FAM131B-AS2通过招募泛素特异性肽酶7稳定复制蛋白A1,并激活共济失调毛细血管扩张和Rad3相关蛋白激酶通路,从而保护单链DNA免受断裂,成为复制应激反应的关键调节因子。此外,FAM131B-AS2过表达抑制CD8+ T细胞浸润,而抑制FAM131B-AS2可激活cGAS-STING通路,增加淋巴细胞浸润并增强对免疫检查点抑制剂的反应。结论:FAM131B-AS2可作为辅助治疗反应的有前景的指标,并可能成为GBM联合免疫治疗的潜在靶点。

实验方法

产品清单

名称品牌货号
Lipofectamine 3000转染试剂Thermo Fisher ScientificL3000015
Illumina HiSeq4000平台Illumina--
氯脱氧尿苷Sigma AldrichC6891
碘脱氧尿苷Sigma AldrichI7125
抗IdU抗体BD Bioscience347580
抗BrdU抗体ABclonalA20304
Leica SP8共聚焦显微镜Leica--
彗星实验试剂盒Trevigen4250-050-K
SYBR Gold染料----
Leica DMi8显微镜Leica--
Pierce直接磁珠免疫沉淀/共免疫沉淀试剂盒Thermo Fisher Scientific88828
抗RPA1抗体Cell Signaling Technology2267
抗USP7抗体Cell Signaling Technology4833
同型IgG抗体Cell Signaling Technology2729
Magna RNA免疫沉淀RNA结合蛋白免疫沉淀试剂盒Sigma–Aldrich17-700
Pierce磁珠RNA-蛋白下拉试剂盒Thermo Fisher Scientific20164
多西环素----
替莫唑胺----
二甲基亚砜----
IVIS Spectrum活体成像系统Perkin Elmer--
抗PD-1抗体BioXcellBP0273
同型对照抗体BioXcellBP0089