ZmWAKL-ZmWIK-ZmBLK1-ZmRBOH4模块为玉米灰斑病提供数量抗性

The ZmWAKL-ZmWIK-ZmBLK1-ZmRBOH4 module provides quantitative resistance to gray leaf spot in maize

作者信息Tao Zhong, Mang Zhu, Qianqian Zhang, Yan Zhang, Suining Deng, Chenyu Guo, Ling Xu, Tingting Liu, Yancong Li, Yaqi Bi, Xingming Fan, Peter Balint-Kurti, Mingliang Xu
PMID38238629
期刊Nat Genet
发布时间2024-02
DOI10.1038/s41588-023-01644-z

实验完整度

包含遗传定位与精细定位、转基因功能验证(互补和过表达)、蛋白互作与磷酸化分析、体内体外生化实验以及突变体表型验证等多个独立证据层级。

主要模型

玉米(Zea mays L.)近等基因系NIL-Y32和NIL-Q11 玉米自交系B73(转基因受体) 本氏烟草(Nicotiana benthamiana)叶片(瞬时表达) 洋葱表皮细胞(亚细胞定位)

重点核对

供试菌株为Cercospora zeina,接种方法为10叶期叶鞘注射5 ml浓度为5×10^3孢子/ml的接种液 田间试验地点云南宝山(自然发病)和北京(人工接种) 用于基因表达的样本为每个基因型/处理3个叶圆片混合 GLS严重度评分在授粉后2周开始,每周一次,共3次,评分等级为1、3、5、7、9 统计方法:两组比较用Student's t检验或配对t检验,多组比较用单因素方差分析(Tukey或LSD)

摘要

灰斑病(GLS)由真菌病原体Cercospora zeae-maydis和Cercospora zeina引起,是世界范围内玉米(Zea mays L.)的主要叶部病害。在此,我们证明编码细胞壁相关受体激酶样蛋白的ZmWAKL是GLS主要数量抗病性位点的致病基因。由抗性等位基因编码的ZmWAKLY蛋白能够自身结合,并在质膜上与富含亮氨酸重复序列的免疫相关激酶ZmWIK相互作用。ZmWAKLY/ZmWIK受体复合物与受体样胞质激酶(RLCK)ZmBLK1相互作用并使其磷酸化,后者进而磷酸化其下游的NADPH氧化酶ZmRBOH4。在病原菌侵染时,ZmWAKLY的磷酸化活性瞬时增加,启动从ZmWAKLY、ZmWIK、ZmBLK1到ZmRBOH4的免疫信号传导,最终触发活性氧爆发。因此,我们的研究揭示了玉米ZmWAKL–ZmWIK–ZmBLK1–ZmRBOH4受体/信号传导/执行模块在感知病原菌入侵、转导免疫信号、激活防御反应和赋予对GLS增强的抗性中的作用。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
玉米灰斑病主要数量抗性位点qRgls1的致病基因及其介导抗病性的信号传导机制是什么?
核心机制
ZmWAKLY(抗性等位基因)在质膜上自结合并与共受体ZmWIK形成受体复合物,病原菌侵染后ZmWAKLY磷酸化活性瞬时增加,通过ZmWAKLY/ZmWIK复合物磷酸化RLCK ZmBLK1,ZmBLK1进一步磷酸化NADPH氧化酶ZmRBOH4,触发ROS爆发,从而增强对灰斑病的抗性。而感病等位基因ZmWAKLQ不能自结合,显示激酶活性缺陷并弱结合ZmWIK,无法有效启动免疫信号。
主要证据
通过图位克隆和转基因功能验证(互补和过表达)证明ZmWAKL是qRgls1致病基因;通过Co-IP、SLC、酵母双杂交、体外磷酸化实验等证明ZmWAKL-ZmWIK-ZmBLK1-ZmRBOH4的互作和磷酸化级联;Zmwik和Zmrboh4突变体对灰斑病更感病且ROS爆发减弱。
研究意义
揭示了玉米中一个新的免疫模块ZmWAKL–ZmWIK–ZmBLK1–ZmRBOH4,其感知病原菌入侵并传导免疫信号以激活防御反应,为作物数量抗病性的分子机制提供了新见解。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

qRgls1位点的精细定位与近等基因系构建

将数量抗病位点qRgls1缩小到更小的基因组区间,并创建只有该位点不同的近等基因系,为克隆致病基因提供材料

利用BC2F5、BC5F7、BC7F7重组自交系群体进行连续回交和自交,最终将qRgls1定位在122-kb区间;从重组体IV获得NIL-Y32(含Y32抗性等位基因)和NIL-Q11(含Q11感病等位基因),二者遗传背景一致性达96.12%。

2

候选基因的转基因功能验证

验证ZmWAKL是否为qRgls1的致病基因,并评估其抗病效果

在感病自交系B73背景下,分别转入Y32的基因组片段(包含天然启动子和完整ZmWAKLY编码区)、Ubipro驱动的ZmWAKLY-GFP和ZmWAKLQ-GFP过表达载体,以及嵌合基因ZmWAKLC(YmWAKLY ECD/TM + ZmWAKLQ ICD);通过自交和回交产生分离群体,接种C. zeina后评估GLS抗性。

3

ZmWAKL的分子特征分析

分析ZmWAKL两个等位基因的表达模式、亚细胞定位和结构差异

利用RT-qPCR检测ZmWAKLY和ZmWAKLQ在组织中的表达及接种后的表达变化;通过洋葱表皮细胞和转基因系根表皮观察GFP融合蛋白的亚细胞定位;比较两个等位基因的编码区序列。

4

ZmWAKL自结合和激酶活性分析

验证ZmWAKLY能否自结合并具有激酶活性,比较其与感病等位基因的差异

用膜酵母双杂交、SLC、Co-IP检测ZmWAKLY和ZmWAKLQ的自结合能力;用体外磷酸化检测ICD的激酶活性(MBP标签融合蛋白)。

5

鉴定ZmWAKL的共受体ZmWIK

寻找ZmWAKL在质膜上的共受体,并验证其相互作用

通过IP-MS从ZmWAKLY-GFP过表达转基因系中鉴定候选互作蛋白,通过SLC和Co-IP验证ZmWIK与ZmWAKL的互作,并通过体外磷酸化实验研究它们之间的相互磷酸化。

6

ZmWAKL/ZmWIK复合物与ZmBLK1的互作和磷酸化

验证ZmBLK1作为下游RLCK连接ZmWAKL/ZmWIK复合物,并确认磷酸化关系

通过SLC和Co-IP检测ZmBLK1与ZmWAKL、ZmWIK的互作;通过体外磷酸化实验分析三者间的磷酸化级联;在本氏烟草和转基因玉米原生质体中验证ZmBLK1的磷酸化水平。

7

下游NADPH氧化酶ZmRBOH4的鉴定

验证ZmRBOH4作为ZmBLK1的下游靶标,参与ROS爆发和抗病

通过SLC、pull-down验证ZmBLK1与ZmRBOH4的互作;体外磷酸化实验证明ZmBLK1磷酸化ZmRBOH4的N端;CRISPR/Cas9敲除ZmRBOH4观察对GLS抗性和植株表型的影响。

8

体内免疫应答及ROS爆发验证

验证ZmWAKL介导的抗病信号在体内引发ROS爆发,并确认相关组件的必要性

接种C. zeina后检测ZmWAKLY和ZmWAKLQ磷酸化水平变化;磷酸化蛋白质组学分析ZmBLK1和ZmRBOH4的磷酸化;用L-012化学发光法检测NIL和突变体的ROS爆发。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
pCAMBIA3301载体----
pBCXUN-Myc载体----
pEZS-NL载体----
pSuper1300-GFP载体----
JW771-35S-CLuc载体----
JW772-35S-NLuc载体----
pBT3-SUC载体----
pPR3-N载体----
pGADT7载体----
pGBKT7载体----
农杆菌菌株EHA105----
Axiom_M6H60k基因分型芯片Thermo Fisher Scientific--
RT-qPCR----
蛋白酶抑制剂混合物----
磷酸酶抑制剂----
α-GFP抗体ABclonalAE012
α-Myc抗体ABclonalAE010
α-Actin抗体EASYBIOBE0028
α-LUC抗体Abcamab181640
α-磷酸化(丝/苏氨酸)抗体Abcamab117253
α-MBP抗体ABclonalAE016
α-GST抗体Yeasen30903ES10
α-His抗体Yeasen30404ES60
α-Myc磁珠----
α-GFP磁珠MBLD153-11
MBP(麦芽糖结合蛋白)----
GST(谷胱甘肽S-转移酶)----
His标签----
MBPa(髓鞘碱性蛋白)EMD Millipore13-104
(32P)-γ-ATP----
ATP----
CBB染色----
放射自显影----
DUAL膜系统Clontech--
酵母菌株NMY51Clontech--
Y2HGold菌株Clontech--
荧光素PromegaE1601
化学发光成像系统Tanon--
ImageJ LauncherNational Institutes of Health--
LTQ Orbitrap Velos质谱仪Thermo Fisher Scientific--
胰蛋白酶----
TMT 6-plex试剂Thermo Fisher Scientific90068
Proteome DiscovererThermo Fisher Scientificv2.4.1.15
Mascot ServerMatrix Science2.3
IMAC微球----
TMT 6-plex标记Thermo Fisher Scientific90068
BCA蛋白定量试剂盒----
Agilent 300Extend C18色谱柱Agilent--
共聚焦显微镜Zeiss--
FM4-64MedchemExpressHY-103466
蔗糖----
金颗粒----
L-012Wako120-04891
辣根过氧化物酶Sigma-AldrichV900503
二甲基亚砜----
Silwet L-77----
GLOMAX96发光检测仪Promega--
扫描电子显微镜----
IBM SPSS StatisticsIBMSV26

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
精细定位与NIL构建
标记IDP2、M2的物理位置;用于基因分型的标记(Supplementary Table 1);重组体的来源和衍生系
阅读提示:Methods 'Sequential fine-mapping of qRgls1' 和 'Plant materials';图1a和图例
田间接种与GLS评估
种植地点(云南宝山自然发病、北京人工接种);播种规格(行距0.5m、株距0.25m);C. zeina接种浓度5×10^3孢子/ml,10叶期叶鞘注射5ml;病情调查时间(授粉后2周开始,每周一次,共3次);DSI计算方法和分级标准
阅读提示:Methods 'Field assays';图1c-e、j-l、Extended Data Fig. 2
转基因功能验证
基于Y32 BAC克隆构建的9.2kb基因组片段(含2.1kb启动子、2.2kb编码区、4.9kb 3'UTR);遗传转化受体B73;农杆菌菌株EHA105;过表达载体Ubipro:ZmWAKLY-GFP;回交群体背景(Q11或NIL-Y32);T1BC1F1和T1BC3F1群体的DSI比较
阅读提示:Methods 'Genetic transformation';图1b-h、i-o,Extended Data Fig. 4
蛋白互作和磷酸化分析
质膜定位的确认(FM4-64共定位);蛋白表达体系(本氏烟草、酵母、E. coli);纯化蛋白的标签和激酶失活突变(ZmWAKLY/K391E, ZmWAKLQ/K430E, ZmWIK/K339E, ZmBLK1/K114E);体外激酶缓冲液组成(20 mM Tris-HCl pH7.5, 10 mM MgCl2, 1 mM CaCl2, 1 mM DTT)
阅读提示:Methods 'Co-IP assay', 'SLC assay', 'In vitro phosphorylation assay';图3a-e、4a-j
体内磷酸化检测
C. zeina接种后ZmWAKL磷酸化检测时间点(6 hpi);α-phospho-(Ser/Thr)抗体(Abcam ab117253);蛋白提取缓冲液(含蛋白酶和磷酸酶抑制剂)
阅读提示:Methods 'In vivo phosphorylation assay';图6a、b
ROS爆发测定
使用C. zeina诱导;叶片切条(3mm宽);L-012浓度;HRP浓度(40 µg/ml);记录时间(1.25h,每60s)
阅读提示:Methods 'Oxidative burst assay';图6d-f