脂肪酸合酶的蛋白水解激活信号传导压力解析

Proteolytic activation of fatty acid synthase signals pan-stress resolution

作者信息Hai Wei, Yi M Weaver, Chendong Yang, Yuan Zhang, Guoli Hu, Courtney M Karner, Matthew Sieber, Ralph J DeBerardinis, Benjamin P Weaver
PMID38167727
期刊Nat Metab
发布时间2024-01
DOI10.1038/s42255-023-00939-z

实验完整度

包含体外切割实验、CRISPR突变体、报告基因检测、代谢组学、转录组学、脂滴成像及小鼠肝脏研究,多层级验证功能与机制。

主要模型

秀丽隐杆线虫(C. elegans) 小鼠肝组织 小鼠原代成骨细胞

重点核对

FASN-1在Asp1593位点被CED-3切割(D1593E突变消除切割) FASN-CTF表达(尤其KR结构域活性)降低压力反应基因表达和脂滴积累 氧化还原状态:抗氧化剂(NAC、肌肽)降低ced-3突变体的压力反应,氧化剂(MDA)增强反应 ced-3(-)和fasn-1(D/E)突变体增强压力反应,但不影响棕榈酸合成 FASN加工在饱食小鼠肝中检测到,在禁食小鼠中未检测到

摘要

慢性压力和炎症既是许多人类疾病的结果,也是主要驱动因素。尽管缓解措施存在,但持续的反应性表明未能感知压力源的解除。在这里,我们展示了脂肪酸合酶(FASN)的蛋白水解切割事件在秀丽隐杆线虫中激活了压力解除的全局性线索。FASN在棕榈酸脂肪酸的生物合成中已得到充分确认。我们的结果表明FASN促进了独立于棕榈酸合成的抗炎谱。FASN的少量蛋白经caspase的氧化还原依赖性蛋白水解产生一个C端片段,该片段足以下调压力反应性的多个方面,包括基因表达、代谢程序和脂滴。FASN C端片段以细胞非自主方式信号传导压力解除。与这些发现一致,FASN加工也在饱食但未禁食的雄性小鼠肝脏中观察到。由于压力反应的下调对健康至关重要,我们的发现为控制压力反应的多个方面提供了潜在途径。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
动物如何感知多种压力源的解除并下调压力反应?
核心机制
caspase(CED-3)以氧化还原依赖性方式切割脂肪酸合酶(FASN),产生C端片段(CTF),该片段激活一个全局性压力解除信号,独立于其经典的棕榈酸合成功能。
主要证据
线虫中ced-3、ced-4和fasn-1(D/E)突变增强压力反应;FASN-CTF表达降低压力反应基因表达、脂滴积累,且需要KR结构域活性;代谢组学和转录组学显示CTF改变代谢和基因表达程序。
研究意义
为控制多种压力反应提供潜在途径,可能对与慢性压力相关的疾病有治疗意义。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

发现caspase和FASN调节压力反应

确定caspase和FASN是否调节对多种压力源的反应强度。

使用报告基因(HSP-4p::GFP、NLP-29p::GFP、GCS-1p::GFP)检测ced-3(-)、ced-4(-)和fasn-1(D/E)突变体在ER、渗透、ROS压力下的诱导;RNAi筛选鉴定fasn-1;AID降解确认FASN-1功能。

2

验证FASN被caspase切割及其功能

证明FASN被CED-3切割,并检验切割是否影响压力反应。

体外切割实验确定FASN-1的切割位点;生成切割抗性突变fasn-1(D/E);检测其对压力反应的影响;D2O标记检测棕榈酸合成。

3

分析FASN切割对代谢和氧化还原的影响

确定FASN切割是否影响代谢和氧化还原状态。

对野生型、ced-3(-)和fasn-1(D/E)进行非靶向代谢组学;检测谷胱甘肽比例;测试抗氧化剂和氧化剂的影响;检测caspase氧化和活性。

4

测试FASN-CTF的功能

评估FASN-CTF是否足以调节压力反应。

生成表达FASN-CTF的线虫株;检测其对压力反应基因表达、代谢产物和脂滴的影响;进行组织特异性表达实验。

5

确定FASN-CTF的酶活性要求

确定FASN-CTF的哪个酶结构域对其功能至关重要。

生成单个酶结构域突变体(ER-KO、KR-KO、ACP-KO、TE-KO)并检测其对压力反应和脂滴的影响。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
衣霉素Sigma-AldrichT7765
氯化钠Sigma-AldrichS7653
棕榈酸钠Sigma-AldrichP9767
N-乙酰半胱氨酸Sigma-AldrichA7250
L-肌肽Sigma-AldrichC9625
丙二醛Sigma-Aldrich63287
四丁基氯化铵Sigma-Aldrich86870
杜尔贝科改良伊格尔培养基----
Axiozoom显微镜Zeiss--
Nomarski显微镜Zeiss--
LSM900共聚焦显微镜Zeiss--
抗HA抗体Cell Signaling Technology3724S
抗肌动蛋白抗体Bio-Rad12004163
HA标签(C29F4)兔单克隆抗体Cell Signaling Technology11846S
Seahorse XFp分析仪Agilent--
DCP-Bio1探针----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
线虫培养与压力处理
线虫株、压力处理浓度与时间(衣霉素6 μg/ml、NaCl 400 mM、百草枯16 mM)、报告基因株系、动物同步化阶段、温度(20°C)
阅读提示:Methods: Maintenance of C. elegans strains, Stress treatment and metabolite supplementation; Figure legends for Fig. 1
CRISPR突变体构建
突变位点(D1593E)、同源臂设计、筛选标记、单拷贝插入位点(Mos1)
阅读提示:Methods: Generation of CRISPR-Cas9 mutations; Supplementary Tables 1-3
体外切割实验
蛋白片段表达系统(TNT)、caspase来源与浓度、孵育温度与时间(30°C过夜)
阅读提示:Methods: In vitro cleavage assay; Figure legends for Fig. 2c-e
代谢组学分析
样本量(6个生物学重复)、提取方法(85%甲醇)、数据分析工具(MetaboAnalyst)
阅读提示:Methods: Metabolomics; Figure legends for Fig. 3
蛋白检测
抗体稀释度、裂解液成分、蛋白上样量、凝胶浓度(4-20%梯度)
阅读提示:Methods: Western blot; Extended Data Fig. 4h
脂滴成像
报告基因DHS-3::GFP、显微镜设置(ApoTome)、图像分析(Fiji)
阅读提示:Methods: Imaging; Figure legends for Fig. 5