GSK621诱导的CALR膜暴露检测
验证AMPK激活是否在AML细胞中诱导免疫原性细胞死亡的标志物CALR膜暴露。
用GSK621处理小鼠C1498细胞、人AML细胞系(MOLM14和OCI-AML2)以及患者原代AML细胞,通过流式细胞术检测活细胞表面CALR的表达。同时设置CALR敲除和过表达对照验证抗体特异性。
AMPK activation induces immunogenic cell death in AML
包含细胞系、患者样本、体外共培养、动物疫苗接种模型等多个独立证据层级,并进行了AMPK依赖性、PERK机制验证及T细胞耗竭功能验证。
小鼠C1498 AML细胞系 MLL-AF9转化的小鼠原代AML细胞 人AML细胞系MOLM14和OCI-AML2 患者AML骨髓样本
GSK621处理浓度和时间(30 μM 24小时用于CALR暴露) AMPK敲除(PRKAA1 sgRNA)及回补验证 PERK敲除及回补验证 疫苗接种模型中T细胞耗竭(CD4/CD8抗体) BMDC共培养比例(1:2至1:20)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证AMPK激活是否在AML细胞中诱导免疫原性细胞死亡的标志物CALR膜暴露。
用GSK621处理小鼠C1498细胞、人AML细胞系(MOLM14和OCI-AML2)以及患者原代AML细胞,通过流式细胞术检测活细胞表面CALR的表达。同时设置CALR敲除和过表达对照验证抗体特异性。
证明GSK621诱导的CALR暴露依赖于AMPK。
使用CRISPR/Cas9敲除AMPKα1(PRKAA1)的人AML细胞系(MOLM14和OCI-AML2),比较NTG和KO细胞中GSK621诱导的CALR表面暴露;并通过回补AMPKα1截短突变体(1-312)进行拯救实验。
验证AMPK诱导的CALR暴露是否通过PERK通路。
使用PERK(EIF2AK3)敲除的MOLM14细胞,并通过多西环素诱导表达野生型PERK,检测GSK621处理后eIF2α磷酸化和CALR表面暴露的变化。
验证GSK621处理的AML细胞是否能促进树突状细胞成熟。
将GSK621、MTO、AraC或DMSO预处理的C1498和MLL-AF9 AML细胞与小鼠骨髓来源树突状细胞(BMDC)共培养过夜,通过流式检测CD80、CD86、MHCII表达。
验证GSK621处理的白血病细胞能否诱导体内抗肿瘤免疫反应。
用GSK621或DMSO处理C1498或MLL-AF9细胞,固定后皮下接种到C57BL/6小鼠左胁,7天后加强免疫,再一周后右胁接种活细胞,监测肿瘤生长和生存。部分实验用CD4/CD8抗体耗竭T细胞。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | α-MEM培养基 | Gibco | 12561-072 |
| 胎牛血清 | Sigma Aldrich | F2442 | |
| 丙氨酰谷氨酰胺 | Corning | 25-015-CI | |
| 基因编辑 | pLKO5.sgRNA.EFS.tRFP质粒 | -- | Addgene no. 57823 |
| pLenti6–AMPK α1 1-312质粒 | -- | Addgene plasmid no. 162131 | |
| 病毒生产 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Thermo Fisher | 11668019 |
| 病毒包装 | psPAX2包装质粒 | -- | Addgene no. 12260 |
| pMD2.G包膜质粒 | -- | Addgene no. 12259 | |
| pECO-PAC2包装质粒 | -- | -- | |
| 小鼠原代细胞培养 | 美索库尔特半固体培养基 | Stem Cell Technologies | M3234 |
| 重组小鼠IL-6 | -- | -- | |
| 重组小鼠SCF | -- | -- | |
| 重组小鼠IL-3 | -- | -- | |
| 细胞分离 | 死细胞去除试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-090-101 |
| BMDC培养 | 重组小鼠GM-CSF | -- | -- |
| BMDC活化对照 | 脂多糖 | -- | -- |
| 疫苗接种 | 基质胶 | -- | -- |
| T细胞耗竭 | InVivoMAb抗小鼠CD4抗体 | BioXcell | BE0003-1 |
| InVivoMAb抗小鼠CD8α抗体 | BioXcell | BE0061 | |
| T细胞耗竭对照 | InVivoMAb大鼠IgG2b同型对照 | BioXcell | BE0090 |
| Western blot | 抗肌动蛋白抗体 | MilliporeSigma | A5441 |
| 抗AMPKα抗体 | Cell Signaling Technology | 2532S | |
| 抗钙网蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 12238S | |
| 抗Cas9抗体 | Cell Signaling Technology | 14697S | |
| 抗eIF2α抗体 | Cell Signaling Technology | 9722S | |
| 抗磷酸化AMPKα(Thr172)抗体 | Cell Signaling Technology | 2535S | |
| 抗磷酸化eIF2α(Ser51)抗体 | Cell Signaling Technology | 3398S | |
| 流式细胞术 | 牛血清白蛋白 | Fisher BioReagents | BP1600100 |
| 抗小鼠CD16-CD32 Fc受体阻断剂 | ThermoFisher Scientific | BDB553141 | |
| 人BD Fc受体阻断剂 | BD Biosciences | 564219 | |
| 膜联蛋白V结合缓冲液 | Thermo Fisher Scientific | BDB556454 | |
| 碘化丙啶染色液 | ThermoFisher Scientific | BDB556463 | |
| DAPI染料 | Cell Signaling Technology | 4083S | |
| Zombie Green染料 | BioLegend | 423111 | |
| Zombie Aqua染料 | BioLegend | 423101 | |
| 抗钙网蛋白抗体(内质网标志物) | Abcam | ab 2907 | |
| 山羊抗兔IgG(H+L)二抗, Alexa Fluor 488 | Invitrogen | A-11034 | |
| Alexa Fluor 647抗钙网蛋白抗体(EPR3924) | Abcam | ab196159 | |
| APC抗人CD45抗体 | BioLegend | 368512 | |
| 膜联蛋白V-Pacific Blue | BioLegend | 640918 | |
| APC抗小鼠CD11c抗体 | BioLegend | 117310 | |
| Brilliant Violet 510抗小鼠CD86抗体 | BioLegend | 105039 | |
| PE抗小鼠I-A/I-E (MHCII)抗体 | BioLegend | 107607 | |
| PerCP/cyanine5.5抗小鼠CD80抗体 | BioLegend | 104721 | |
| CytoFLEX S流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- | |
| BD LSRFortessa X-20流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| Western blot成像 | Image Quant LAS-4000成像仪 | -- | -- |
| 药物处理 | GSK621 | -- | -- |
| 米托蒽醌 | -- | -- | |
| 阿糖胞苷 | -- | -- | |
| 伊达比星 | -- | -- | |
| 维奈托克 | -- | -- | |
| 二甲基亚砜 | -- | -- | |
| 统计分析 | GraphPad Prism 9 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基成分、培养条件(5% CO2, 37°C)、支原体检测 阅读提示:Methods: Cell lines |
| GSK621处理 | GSK621浓度(如30 μM)、处理时间(6、24、48小时)、溶剂对照(DMSO) 阅读提示:Results: Figure 1, Figure 2 |
| CALR膜暴露检测 | 流式细胞术的活细胞门控、CALR抗体(克隆EPR3924)、染色条件(4°C 30分钟) 阅读提示:Methods: Flow cytometry; Figure 1 |
| AMPK敲除验证 | PRKAA1 sgRNA序列、MOI、敲除效率(Western blot确认)、AMPK活性完全消除 阅读提示:Methods: Generation of CRISPR KO cells; Figure 2A |
| PERK敲除验证 | EIF2AK3 sgRNA设计、诱导表达系统(多西环素浓度) 阅读提示:Figure 2G-H; supplementary methods |
| BMDC共培养 | BMDC分化方案(GM-CSF浓度、天数)、共培养比例、时间(过夜)、活化标志物 阅读提示:Methods: BMDC generation, Coculture experiments; Figure 3 |
| 疫苗接种实验 | 小鼠品系、周龄、性别;细胞处理浓度和时间(30 μM 24小时);固定方法(1%福尔马林);细胞数量;注射途径;时间间隔;T细胞耗竭抗体剂量和时间 阅读提示:Methods: Vaccination assay; Figure 4 |
| T细胞耗竭 | 抗体克隆、剂量、注射时间点,确保耗竭效率 阅读提示:Methods: Vaccination assay; Figure 4E-F |