斑马鱼β细胞再生的功能验证
评估adjudin对β细胞消融后再生β细胞功能的影响
通过NTR/MTZ系统消融β细胞,用adjudin处理,检测ins表达、葡萄糖水平、β细胞数量及钙活性。
Adjudin improves beta cell maturation, hepatic glucose uptake and glucose homeostasis
包括斑马鱼体内功能实验、小鼠胰岛体外培养、RNA-seq、db/db小鼠体内治疗、人肝细胞球体实验等多层级验证。
斑马鱼幼虫(Tg(ins:Flag-NTR)、Tg(ins:CFP-NTR)、Tg(ins:NLuc)等系) 新生小鼠(P0)胰岛 成年小鼠(3月龄)胰岛 db/db小鼠胰岛 db/db小鼠体内模型 原代人肝细胞(PHH)球体
Adjudin浓度:在斑马鱼中为5 µmol/l,在胰岛和PHH中为10 µmol/l(部分实验使用3或30 µmol/l) db/db小鼠处理:腹腔注射50 mg/kg(或100 mg/kg)adjudin,隔天一次,持续3周 β细胞消融:3-4 dpf斑马鱼用10 mmol/l甲硝唑处理 GSIS检测:在2.8 mmol/l和16.7 mmol/l葡萄糖条件下分别孵育1小时 RNA-seq样本量:P0胰岛每组7个生物学重复,db/db胰岛每组8个生物学重复
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估adjudin对β细胞消融后再生β细胞功能的影响
通过NTR/MTZ系统消融β细胞,用adjudin处理,检测ins表达、葡萄糖水平、β细胞数量及钙活性。
验证adjudin对新生和成年胰岛功能的影响
分离P0、P4、P7和成年小鼠胰岛,用adjudin处理,检测β细胞标志物表达、GSIS、胰岛素分泌和增殖。
揭示adjudin对P0和db/db胰岛基因表达的影响
提取RNA,进行RNA-seq,分析差异表达基因和通路富集。
验证adjudin对糖尿病小鼠血糖稳态的影响
8周龄db/db小鼠腹腔注射adjudin或对照,监测体重、血糖,进行IPGTT和组织学分析。
评估adjudin对人肝细胞葡萄糖摄取的影响
培养原代人肝细胞球体,诱导胰岛素抵抗,用adjudin处理,测量培养基中葡萄糖消耗。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 斑马鱼处理 | Adjudin | MedChemExpress | HY-18996 |
| 甲硝唑 | Sigma | M3761 | |
| 葡萄糖检测 | 葡萄糖比色/荧光检测试剂盒 | BioVision | K688 |
| 荧光素酶检测 | Nano-Glo荧光素酶试剂 | Promega | N1110 |
| Glomax-96微孔板发光检测仪 | Promega | GM3000 | |
| 活体钙成像 | Zeiss LSM 900共聚焦显微镜 | ZEISS | -- |
| qPCR | Trizol试剂 | Thermo Fisher Scientific | 15596018 |
| Quick-RNA微量制备试剂盒 | Zymo Research | R1051 | |
| High Capacity cDNA逆转录试剂盒 | Applied Biosystems | 4368813 | |
| iTaq通用SYBR Green超混液 | Bio-Rad | 1725124 | |
| 胰岛分离 | 胶原酶P | Sigma | COLLP-RO |
| 胰岛培养 | RPMI 1640培养基 | Thermo Fisher Scientific | 21875034 |
| 胎牛血清 | Thermo Fisher Scientific | 26140079 | |
| 青霉素-链霉素 | Thermo Fisher Scientific | 10378016 | |
| GSIS | Krebs-Ringer碳酸氢盐HEPES缓冲液 | Thermo Fisher Scientific | J67795 |
| 胰岛素ELISA试剂盒 | Crystal Chem | 90080 | |
| Western blot | RIPA裂解缓冲液 | Sigma | R0278 |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | 11697498001 | |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | Roche | 4906845001 | |
| Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23227 | |
| Laemmli缓冲液 | Bio-Rad | 1610737 | |
| 预制4-15%梯度凝胶 | Bio-Rad | 4561086 | |
| Mini-PROTEAN 3电泳槽 | Bio-Rad | -- | |
| Trans-Blot Turbo转印系统 | Bio-Rad | -- | |
| SuperSignal West Dura长效底物 | Thermo Fisher Scientific | 37071 | |
| ChemiDoc成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| Whole mount staining | RapiClear 1.47 | SunJin Lab | RC147001 |
| iSpacer间隔器 | SunJin Lab | IS204 | |
| Click-iT EdU Alexa Fluor 647成像试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | C10340 | |
| 全组织染色 | 抗胰岛素抗体 | Agilent | IR00261 |
| 抗PDX1抗体 | Abcam | ab47267 | |
| 抗NKX6.1抗体 | DSHB | F55A10 | |
| 抗MafA抗体 | Novusbio | NBP1-00121 | |
| 抗TOM20抗体 | Abcam | ab56783 | |
| 抗E-钙黏蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 3195 | |
| Western blot | 抗TOM20抗体 | Proteintech | 11802-1-AP |
| 抗TFAM抗体 | Abcam | ab131607 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Sigma | A5441 | |
| 斑马鱼处理 | 2-NBDG | Thermo Fisher Scientific | N13195 |
| 三卡因 | Sigma | -- | |
| 人肝细胞培养 | William's E培养基 | Thermo Fisher Scientific | A1217601 |
| 地塞米松 | -- | -- | |
| 转铁蛋白 | -- | -- | |
| L-谷氨酰胺 | -- | -- | |
| 胰岛素 | -- | -- | |
| 超低吸附培养板 | Corning | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 斑马鱼模型 | 斑马鱼品系、发育阶段、adjudin浓度(5 µmol/l)、β细胞消融方法(10 mmol/l MTZ) 阅读提示:Methods: Zebrafish, Chemical treatments, beta cell ablation and glucose assay of zebrafish larvae |
| 小鼠胰岛培养 | 小鼠品系和年龄、胰岛分离方法、培养条件(11 mmol/l葡萄糖)、adjudin浓度(10 µmol/l)、处理时间(1天) 阅读提示:Methods: Islet isolation and treatment, GSIS in islet cultures |
| RNA-seq | 样本量(P0每组7个,db/db每组8个)、测序平台(Illumina NovaSeq)、比对和差异表达分析方法 阅读提示:Methods: RNA-seq and data analysis |
| db/db小鼠体内实验 | 小鼠品系和年龄(8周龄雄性BKS(D)-Leprdb/JOrlRj)、处理剂量(50或100 mg/kg)、给药途径(腹腔注射)、频率(隔天一次)、持续时间(3周) 阅读提示:Methods: Mice, Results: Adjudin improves glucose homeostasis in db/db mice |
| 人肝细胞球体 | PHH供体数量(1)、球体形成条件、诱导胰岛素抵抗的培养基配方、adjudin浓度(3或10 µmol/l)、处理时间(24小时) 阅读提示:Methods: Primary human hepatocyte culture, Glucose consumption measurement in PHHs |