体外细胞活力与代谢救援
确定DON对PDAC细胞活力的影响及其作用的代谢通路。
对KPC和11种人PDAC细胞系进行DON剂量反应实验,并通过代谢物补充(NEAAs、α-KG、核苷、GlcNAc、天冬酰胺等)和GC-MS检测代谢物变化。
Glutamine mimicry suppresses tumor progression through asparagine metabolism in pancreatic ductal adenocarcinoma
包含体外细胞实验、PDO、多种小鼠模型(皮下、原位、尾静脉转移)、代谢物检测及功能验证(敲低/过表达ASNS),并明确机制与联合治疗。
小鼠KPC细胞皮下/原位同系移植模型 人PaTu 8988T和779E细胞原位异种移植模型 尾静脉注射KPC/HPAF-II细胞肺转移模型 人PDAC患者来源类器官(PDO)
DON给药剂量(10mg/kg或5mg/kg,腹腔注射)及给药方案(每隔一天或每周三次,持续2-3周) ASNase给药剂量(3U/g或60U/只)及联合方案 细胞实验中DON浓度及处理时间(24h或48h) ASNS敲低或过表达对DON敏感性的影响 代谢物补充实验(天冬酰胺0.1mM)及GC-MS检测
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定DON对PDAC细胞活力的影响及其作用的代谢通路。
对KPC和11种人PDAC细胞系进行DON剂量反应实验,并通过代谢物补充(NEAAs、α-KG、核苷、GlcNAc、天冬酰胺等)和GC-MS检测代谢物变化。
验证ASNS表达是否响应DON并调节DON敏感性。
通过免疫印迹和qPCR检测DON处理前后ASNS表达水平;利用siRNA敲低和过表达ASNS,评估DON对细胞增殖的影响。
评估DON单药或与ASNase联合对PDAC肿瘤生长和转移的影响。
使用KPC皮下和原位同系模型、PaTu 8988T和779E原位异种模型、尾静脉肺转移模型,给予DON或DON+ASNase治疗,测量肿瘤体积/重量、转移灶数量/大小。
在人类PDO中评估DON和ASNase的敏感性及协同作用。
将6个PDO培养于含天冬酰胺的培养基中,用DON(50μM)、ASNase(0.3U/ml)或两者联合处理5天,测定细胞活力并计算CI值。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 6-重氮-5-氧代-L-正亮氨酸 | Sigma | -- |
| L-天冬酰胺酶 | Prospec bio | -- | |
| 代谢物补充 | MEM非必需氨基酸 | Thermo Fisher | -- |
| 二甲基-2-氧代戊二酸 | Sigma | -- | |
| EmbryoMax核苷100X | Millipore | -- | |
| N-乙酰氨基葡萄糖 | Sigma | -- | |
| L-天冬酰胺 | Sigma | -- | |
| L-天冬氨酸 | Sigma | -- | |
| L-谷氨酸 | Sigma | -- | |
| L-脯氨酸 | Sigma | -- | |
| L-丙氨酸 | Sigma | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 基质胶 | Corning | -- | |
| PDO培养 | advanced DMEM/F12培养基 | -- | -- |
| HEPES | -- | -- | |
| Glutamax | -- | -- | |
| A83-01 | -- | -- | |
| 人表皮生长因子 | -- | -- | |
| 小鼠Noggin | -- | -- | |
| 人成纤维细胞生长因子10 | -- | -- | |
| 人胃泌素I | -- | -- | |
| N-乙酰半胱氨酸 | -- | -- | |
| 烟酰胺 | -- | -- | |
| B27添加剂 | -- | -- | |
| R-spondin1条件培养基 | -- | -- | |
| Afamin/Wnt3A条件培养基 | -- | -- | |
| 免疫组织化学 | ASNS抗体 | Proteintech | 14681-1-AP |
| Cleaved caspase 3抗体 | CST | 9664 | |
| Ki-67抗体 | ThermoFisher | MA5-14520 | |
| p53抗体 | CST | 2524 | |
| 磷酸化组蛋白H3抗体 | CST | 9701 | |
| 免疫组化 | 生物素化山羊抗兔二抗 | Vector | BA-1000-1.5 |
| VECTASTAIN Elite ABC HRP试剂盒 | Vector Labs | -- | |
| DAB HRP底物试剂盒 | Vector Labs | -- | |
| 代谢物检测 | L-正缬氨酸 | -- | -- |
| 谷氨酰胺检测 | 谷氨酰胺检测试剂盒 | Abcam | -- |
| RNA提取 | PureLink RNA小提试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| cDNA合成 | 高容量cDNA逆转录试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| qPCR | SYBR Premix Taq II预混液 | Takara | -- |
| 蛋白裂解 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白定量 | DC蛋白定量试剂盒 | Bio-Rad | -- |
| 转染 | Lipofectamine RNAiMax转染试剂 | ThermoFisher Scientific | -- |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| 小鼠Asns靶向siRNA | ThermoFisher Scientific | -- | |
| 阴性对照siRNA | ThermoFisher Scientific | -- | |
| ASNS表达载体 | OriGene | MC200523 | |
| 细胞活力检测 | CellTiter-Glo发光检测 | Promega | -- |
| 设备 | LightCycler 96实时荧光定量PCR仪 | Roche | -- |
| Odyssey CLx成像系统 | LI-COR | -- | |
| 酶标仪(BioTek Synergy H1) | BioTek | -- | |
| 组织破碎 | Bead Ruptor 12组织研磨仪 | Omni International | -- |
| 陶瓷珠 | Omni International | -- | |
| 成像 | Olympus CX-31显微镜 | Olympus | -- |
| INFINITY相机和软件 | Lumenera | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外细胞活力实验 | DON浓度范围、处理时间(24h或48h)、细胞密度(5000-10000细胞/孔)、天冬酰胺补充浓度(0.1mM) 阅读提示:Methods中'Cell number quantification by crystal violet staining' |
| 动物实验 | DON给药剂量(10mg/kg或5mg/kg)、给药频率(每隔一天或每周三次)、治疗持续时间(2-3周)、小鼠品系和性别(C57BL/6J或NU/J雌性)、细胞植入数量(500,000皮下、12,500原位、200,000尾静脉) 阅读提示:Methods中'Animal studies'、'Subcutaneous tumor model'、'Orthotopic tumor model'、'Experimental i.v. lung metastasis model' |
| ASNS表达检测 | DON处理浓度(10μM或0.5mM)、处理时间(24h)、抗体和稀释度(ASNS 1:500, Tubulin 1:10000) 阅读提示:Methods中'Immunoblotting'、'Immunohistochemistry' |
| ASNS敲低/过表达 | siRNA序列和浓度(25nM)、转染试剂(Lipofectamine RNAiMax)、过表达载体(CMV6-ASNS)和筛选时间(3-7天) 阅读提示:Methods中'siRNA and plasmid transfection' |
| PDO实验 | PDO培养条件(Matrigel dome, hCPLT)、DON和ASNase浓度(50μM和0.3U/ml)、处理时间(5天)、细胞活力检测方法(CellTiter-Glo) 阅读提示:Methods中'PDAC patient-derived organoids' |