淋巴母细胞系表达的免疫球蛋白基因可鉴别和预测双相情感障碍患者的锂反应

Immunoglobulin genes expressed in lymphoblastoid cell lines discern and predict lithium response in bipolar disorder patients

作者信息Liron Mizrahi, Ashwani Choudhary, Polina Ofer, Gabriela Goldberg, Elena Milanesi, John R Kelsoe, David Gurwitz, Martin Alda, Fred H Gage, Shani Stern
PMID37488168
发布时间2023-10
DOI10.1038/s41380-023-02183-z

摘要

双相情感障碍(Bipolar disorder, BD)是一种神经精神性情绪障碍,表现为反复发作的躁狂和抑郁。超过半数的BD患者对一线治疗药物锂盐(lithium)无反应,这使BD的临床管理变得复杂。鉴于其病因不明,理解导致锂盐反应变异的遗传特征具有重要意义。我们从10名对照者和19名BD患者的淋巴母细胞样细胞系(lymphoblastoid cell lines, LCLs)中发现了一组差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs),这些基因主要属于免疫球蛋白基因家族,可作为诊断和治疗BD的潜在生物标志物。重要的是,我们在数据集上训练了机器学习算法,这些算法能以最小误差预测BD亚型的锂盐反应,即使应用于另一实验室获取的24名BD患者的不同队列时亦然。这证明了我们预测BD锂盐反应的方法具有良好的可扩展性,有助于快速、适当地制定治疗干预决策。

实验方法

产品清单

名称品牌货号
BD Vacutainer® CPT™ 柠檬酸钠细胞制备管BD362761
T25和T75组织培养瓶----
RPMI 1640培养基Biological Industries01-100-1 A
1X抗-抗Thermofisher Scientific15240062
GlutamaxThermofisher Scientific35050061
热灭活胎牛血清SigmaF9665
Bio-Rad TC20™自动细胞计数仪Bio-RadTC20
Hy-Mycoplasma PCR试剂盒HylabsKI 5034I
TRIzol™试剂Thermofisher Scientific15596026
Zymo Quick RNA试剂盒Zymo ResearchR1054
RNA清洁和浓缩试剂盒Zymo ResearchR1013
ND-1000 Nanodrop分光光度计Thermofisher ScientificND-1000
Tape station 2200Agilent2200
TruSeq RNA文库制备试剂盒v2Illumina--