慢性IFN-II处理与体外增殖及体内成瘤实验
比较急性和慢性IFN-I/IFN-II对黑色素瘤细胞体外增殖和体内肿瘤生长的影响。
YUMM1.7细胞经IFNα、IFNβ或IFNγ处理24小时(急性)或28天(慢性),检测增殖,并将处理后的细胞植入C57BL/6小鼠侧腹,监测肿瘤生长。
Chronic type II interferon promotes tumor growth through mitochondrial RNA-induced type I interferon and prostaglandin synthesis.
结合小鼠及人黑色素瘤细胞体外模型、基因敲除、多组学分析及多个体内移植瘤模型,并进行了功能与机制验证。
小鼠YUMM1.7黑色素瘤细胞系 小鼠YUMMER1.7黑色素瘤细胞系 小鼠B16-F10黑色素瘤细胞系 人A375黑色素瘤细胞系
慢性IFN-II处理:IFNγ处理28天,急性为24小时 IFNAR或STAT2敲除对慢性IFN-II诱导的体内肿瘤生长的逆转 MAVS敲除对慢性IFN-II诱导的Ifnb1和Irf7表达的减弱 COX1/COX2双敲除对慢性IFN-II增强的肿瘤生长和PGE2产生的逆转 抗PD1耐药YUMMER1.7模型中COX1/2敲除恢复免疫治疗敏感性
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较急性和慢性IFN-I/IFN-II对黑色素瘤细胞体外增殖和体内肿瘤生长的影响。
YUMM1.7细胞经IFNα、IFNβ或IFNγ处理24小时(急性)或28天(慢性),检测增殖,并将处理后的细胞植入C57BL/6小鼠侧腹,监测肿瘤生长。
验证慢性IFN-II是否诱导肿瘤细胞内在的IFN-I反应。
通过RNA-seq、ATAC-seq、STAT1/STAT2 CUT&RUN、RT-qPCR和ELISA检测IFN-I相关基因和蛋白表达;利用IFNAR或STAT2敲除细胞验证IFN-I信号对体内肿瘤生长的作用。
确定慢性IFN-II诱导IFN-I信号的核酸来源及传感通路。
构建STING、MAVS及双敲除细胞,检测Ifnb1和Irf7表达;使用J2抗体检测胞质dsRNA,共聚焦显微镜观察MAVS聚集,RT-qPCR检测胞质mtRNA,mtRNA-FISH检测线粒体外mtRNA foci;使用IMT1B抑制线粒体转录,VBIT-4抑制VDAC。
验证慢性IFN-II诱导的IFN-I信号是否通过COX2-PGE2促进肿瘤生长。
检测PUFA代谢通路基因表达、eicosanoid谱和COX2蛋白;使用阿司匹林或COX1/2双敲除,检测肿瘤生长、PGE2水平及免疫细胞浸润。
评估COX2-PGE2在获得性抗PD1免疫治疗耐药中的作用。
YUMMER1.7细胞经三轮体内传代建立抗PD1耐药细胞系,检测Ptgs2表达;在耐药细胞中敲除COX1/2后重新植入并给予抗PD1治疗,监测肿瘤生长。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 慢性IFN-II处理与体内成瘤 | IFNγ处理浓度、慢性处理28天的具体换液频率、细胞植入数量、小鼠周龄和性别 阅读提示:Methods中细胞培养和动物实验部分,Figure 1 legend |
| IFNAR/STAT2敲除验证 | 敲除细胞系的构建方法、敲除效率验证、体内植入的细胞数量和小鼠数量 阅读提示:Methods中基因敲除部分,Figure 2 legend,Figure S5 |
| MAVS依赖性验证 | MAVS、STING等敲除细胞系的构建和验证、IMT1B和VBIT-4的处理浓度及时间 阅读提示:Methods中基因敲除和抑制剂处理部分,Figure 3 legend,Figure S6-S7 |
| COX1/2敲除与阿司匹林处理 | COX1/2双敲除的构建策略、阿司匹林饮水浓度、给药持续时间 阅读提示:Methods中基因敲除和药物处理部分,Figure 4 legend,Figure S13 |
| 免疫治疗耐药模型 | YUMMER1.7细胞植入数量、抗PD1抗体剂量和给药方案、传代轮次的具体时间 阅读提示:Methods中动物实验和免疫治疗部分,Figure 5 legend,Figure S14 |