验证PRMT5对TNBC细胞铁死亡的影响
确定PRMT5是否调控TNBC细胞对铁死亡诱导剂的敏感性。
在PRMT5过表达或敲低的MDA-MB-231和HCC1937细胞中,用RSL3或erastin处理,检测细胞活力、脂质ROS和MDA水平。
PRMT5 reduces immunotherapy efficacy in triple-negative breast cancer by methylating KEAP1 and inhibiting ferroptosis
包含体外细胞功能实验、机制研究(co-IP、质谱、突变体)、体内小鼠模型及患者样本验证,涵盖多层级证据。
TNBC细胞系(MDA-MB-231、HCC1937、BT549、MDA-MB-436) 非TNBC细胞系(T-47D、MCF7、SKBR3、AU565) 4T1小鼠同系移植瘤模型 接受免疫治疗的TNBC患者样本
细胞系类型及PRMT5表达状态(过表达或敲低) 铁死亡诱导剂种类及浓度(RSL3、erastin) PRMT5抑制剂类型及浓度(JNJ-64619178、GSK3326595) 体内实验中抗PD-1抗体和GSK3326595的给药方案 患者样本的免疫治疗反应及PRMT5、NRF2、HMOX1表达
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定PRMT5是否调控TNBC细胞对铁死亡诱导剂的敏感性。
在PRMT5过表达或敲低的MDA-MB-231和HCC1937细胞中,用RSL3或erastin处理,检测细胞活力、脂质ROS和MDA水平。
识别PRMT5调控的铁死亡相关下游分子。
利用GSE132407和GSE65965数据库分析PRMT5敲低或抑制后的差异表达基因,与FerrDb铁死亡基因集取交集,筛选出HMOX1等候选基因。
验证HMOX1是否是PRMT5调控铁死亡的关键下游效应分子。
在PRMT5过表达细胞中同时过表达HMOX1,用RSL3处理,检测细胞活力、MDA水平和细胞内亚铁浓度。
揭示PRMT5如何抑制NRF2/HMOX1通路。
通过Western blot检测PRMT5过表达或敲低后KEAP1、NRF2及其靶蛋白的表达;用co-IP和质谱检测PRMT5与KEAP1的相互作用及KEAP1甲基化;用放线菌酮实验检测KEAP1半衰期;用MG132处理检测蛋白酶体降解。
确定PRMT5甲基化KEAP1的具体精氨酸残基,并证明该甲基化抑制KEAP1泛素化降解。
构建KEAP1截短突变体和点突变体(R362K、R415K、R596K、R601K),通过co-IP检测PRMT5结合区域和甲基化位点;检测KEAP1泛素化水平及与TRIM25的相互作用。
探讨PRMT5和NRF2在不同铁浓度细胞中对铁死亡敏感性的影响。
在TNBC和非TNBC细胞系中过表达PRMT5或NRF2,用RSL3处理,检测细胞活力;用FerroOrange检测各细胞系的基础亚铁水平;分析NRF2表达与乳腺癌预后的相关性。
验证PRMT5抑制剂是否能增强抗PD-1免疫治疗的效果。
在4T1同系小鼠模型中,给予抗PD-1抗体和/或GSK3326595处理,测量肿瘤体积和重量,检测肿瘤组织MDA含量及KEAP1、NRF2、HMOX1蛋白表达。
验证PRMT5、NRF2和HMOX1表达与TNBC患者免疫治疗反应的相关性。
收集8例接受免疫治疗的TNBC患者样本,通过免疫组化检测PRMT5、NRF2和HMOX1表达,并根据临床反应分组比较。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Pricella | -- |
| 药物处理 | RSL3 | MedChemExpress | HY-100218A |
| erastin | MedChemExpress | HY-15763 | |
| Ferrostatin-1 | MedChemExpress | HY-100579 | |
| JNJ-64619178 | Selleck Chemicals | S8624 | |
| GSK3326595 | Selleck Chemicals | S8664 | |
| MG132 | MedChemExpress | HY-13259 | |
| 动物实验 | 抗PD-1抗体 | Bio X Cell | BE0146 |
| IgG对照 | Bio X Cell | BE0089 | |
| 细胞处理 | 干扰素γ | Beyotime | P6137 |
| Western blot | PRMT5抗体 | Cell Signaling Technology | D5P2T |
| KEAP1抗体 | Proteintech | 10503-2-AP | |
| NRF2抗体 | Proteintech | 16396-1-AP | |
| HMOX1抗体 | Proteintech | 10701-1-AP | |
| 脂质ROS检测 | BODIPY 581/591 C11 | Thermo Fisher Scientific | D3861 |
| MDA检测 | 脂质过氧化MDA检测试剂盒 | Abcam | ab118970 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | TaKaRa | -- |
| RT-qPCR | 逆转录试剂盒 | TaKaRa | -- |
| 铁离子检测 | 铁检测试剂盒 | Abcam | ab83366 |
| FerroOrange荧光探针 | Dojindo | -- | |
| 动物实验 | Matrigel基质胶 | Corning | 47743-720 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞系与培养 | 细胞系来源和培养条件(培养基、CO2浓度、温度)。 阅读提示:Methods - Cells and cell culture |
| 铁死亡诱导处理 | 铁死亡诱导剂种类、浓度和处理时间(RSL3、erastin)。 阅读提示:Results - PRMT5 prevents ferroptosis of TNBC cells; Figure 1 legend |
| 分子机制验证 | PRMT5敲低/过表达效率、KEAP1甲基化位点、KEAP1半衰期、MG132处理。 阅读提示:Results - PRMT5 inhibits NRF2/HMOX1 by methylating and stabilizing KEAP1; Figure 3 legend |
| 体内动物模型 | 4T1细胞接种数量、移植瘤模型建立、抗PD-1和GSK3326595给药剂量、途径、频率和时间。 阅读提示:Results - PRMT5 inhibitors potentiated the therapeutic efficacy of immunotherapy; Figure 6 legend; Methods - In vivo tumorigenesis assay |
| 患者样本分析 | 患者样本数量、临床反应分组、IHC染色抗体浓度和评分标准。 阅读提示:Methods - Patient samples; IHC staining; Figure 6J |