坐骨神经压榨损伤模型的建立与HDAC1/2表达分析
确认HDAC1/2在损伤后施万细胞中的表达动态及SUMO化变化。
对成年小鼠行坐骨神经压榨损伤,取损伤侧与对侧神经,在1、3、5、12、30、60 dpl进行Western blot及HDAC1/2与CD68共免疫荧光,并以变性IP检测SUMO-1与HDAC2。
Delaying histone deacetylase response to injury accelerates conversion into repair Schwann cells and nerve regeneration.
含条件性基因敲除小鼠、Oct6 ΔSCE小鼠、原代大鼠施万细胞、ChIP、荧光素酶报告基因及HDAC1/2抑制剂体内功能验证
成年小鼠坐骨神经压榨损伤模型 HDAC1/2条件性双敲除小鼠(P0CreERT2) Oct6 ΔSCE突变小鼠 原代大鼠施万细胞(RSCs)去分化/再分化培养
坐骨神经压榨损伤模型:压榨5×10秒,采用压榨镊Ref. FST 00632-11 dKO小鼠:他莫昔芬2 mg/天腹腔注射连续5天,注射后7天损伤神经 Mocetinostat剂量10 mg/kg盆腔注射,损伤后24小时取材或每日1次连续2天(3天处理)或4天(5天处理) BrdU 100 mg/kg体重,处死前2小时腹腔注射标记增殖细胞 功能学检测:Rotarod 15 r.p.m.,每只3次,间隔30分钟;趾捏试验于4、10、16、18、29 dpl进行
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认HDAC1/2在损伤后施万细胞中的表达动态及SUMO化变化。
对成年小鼠行坐骨神经压榨损伤,取损伤侧与对侧神经,在1、3、5、12、30、60 dpl进行Western blot及HDAC1/2与CD68共免疫荧光,并以变性IP检测SUMO-1与HDAC2。
验证HDAC1/2缺失对施万细胞增殖、脱髓鞘、轴突再生和再髓鞘化的影响。
P0CreERT2与floxed Hdac1/Hdac2小鼠杂交,他莫昔芬诱导后7天压榨坐骨神经,进行BrdU掺入、甲苯胺蓝及电镜分析完整髓鞘环、Neurofilament免疫荧光追踪轴突再生、GAP-43免疫荧光及1 mpl g比值测定。
确定HDAC1/2缺失对Oct6、cJun、Pax3、Sox2表达时序的影响,并检验Oct6减少与修复性转化的因果关系。
对对照与dKO损伤神经进行Oct6、cJun、Pax3、Sox2 Western blot、免疫荧光和原位杂交;在Oct6 ΔSCE小鼠中检测cJun上调、5 dpl脱髓鞘与3 dpl轴突再生。
在体外验证Oct6下调对cJun上调及施万细胞增殖的影响。
按已报道方案培养原代RSCs,在去分化条件下以慢病毒shRNA敲低Oct6,检测cJun蛋白与EdU掺入。
解析HDAC2、JMJD2C、KDM3A与Sox10对Oct6和Krox20增强子的调控及组蛋白修饰变化。
在去分化或再分化RSCs中转染全长/ΔHR1/ΔHR2 Oct6 SCE或Krox20 MSE荧光素酶构建体及HDAC1、HDAC2、JMJD2C、KDM3A、Sox10、HDAC2K462R,检测荧光素酶活性;在神经组织中进行HDAC2、JMJD2C、KDM3A、Sox10、H3K9me3/2的ChIP-qPCR。
验证SUMO化HDAC2与JMJD2C、KDM3A、Sox10在神经中形成复合物及其对靶增强子激活的必要性。
在未损伤、1 dpl、12 dpl神经裂解液中进行非变性IP(Sox10、HDAC2、JMJD2C、KDM3A或GFP/Flag对照)后Western blot;并以HDAC2K462R突变体检测Oct6 SCE与Krox20 MSE激活。
检验损伤后短期抑制HDAC1/2能否加速轴突再生与运动/感觉功能恢复。
损伤后盆腔注射Mocetinostat或溶剂,设3天与5天处理组,进行Rotarod、趾捏试验、Oct6/cJun Western blot、30 dpl电镜计数再生轴突密度与髓鞘厚度。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 异氟烷 | -- | -- |
| Histoacryl组织胶 | BBraun | -- | |
| Mocetinostat | -- | -- | |
| BrdU | -- | -- | |
| 树脂包埋 | Spurr树脂 | Electron Microscopy Sciences | -- |
| 细胞培养 | DMEM | -- | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Invitrogen | -- | |
| 粗制GGF(牛垂体提取物) | Bioconcept | -- | |
| 佛司可林 | Sigma | -- | |
| dbcAMP | Sigma | -- | |
| RNA提取与反转录 | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| qRT-PCR | M-MLV反转录酶 | Promega | -- |
| ABI 7000序列检测系统 | Applied Biosystems | -- | |
| FastStart SYBR Green Master | Roche | -- | |
| 慢病毒包装 | Lipofectamine 2000 | Invitrogen | -- |
| pLP1包装质粒 | Invitrogen | -- | |
| pLP2包装质粒 | Invitrogen | -- | |
| pLP/VSVG包装质粒 | Invitrogen | -- | |
| Oct6敲低 | 大鼠Oct6 shRNA慢病毒构建体 | Origene Technologies | TL712899D |
| 对照敲低 | 对照shRNA慢病毒构建体 | Origene Technologies | TR30021 |
| 荧光素酶报告基因 | pGL3启动子载体 | Promega | -- |
| Oct6 ΔHR2 SCE构建体 | -- | -- | |
| Krox20-MSE8 pGL3-TATA构建体 | Addgene | #21261 | |
| 表达构建体 | pcDNA4-FLAG-Jhdm2a(KDM3A)表达构建体 | Addgene | #38136 |
| EdU检测 | Click-iT Plus EdU成像试剂盒 | Life Technologies | -- |
| 蛋白定量 | Lowry蛋白测定 | Bio-Rad Laboratories | -- |
| 共免疫沉淀 | protein A/G PLUS琼脂糖珠 | Santa Cruz Biotechnology | -- |
| 组织裂解 | Bioruptor超声破碎仪 | Diagenode | -- |
| 免疫荧光 | 蛋白酶K | -- | -- |
| 免疫荧光封片 | Citifluor封片剂 | Agar Scientific | -- |
| 免疫荧光 | O.C.T.包埋剂 | VWR chemicals | -- |
| 原位杂交 | NBT/BCIP显色底物 | Roche Diagnostics | -- |
| BrdU检测 | BrdU抗体 | Roche Diagnostics | -- |
| Alexa488山羊抗小鼠二抗 | Jackson ImmunoResearch | -- | |
| Western blot | HDAC1抗体(兔) | Genetex | GTX100513 |
| HDAC2抗体(小鼠) | Sigma | H2663 | |
| Sox10抗体(兔) | DCS Innovative Diagnostik-Systeme | SI058C01 | |
| GAPDH抗体(小鼠) | Genetex | GTX28245 | |
| P0抗体(鸡) | Aves Labs | PZO | |
| Krox20抗体(兔) | Axxora | CO-PRB-236P-100 | |
| Sox2抗体(小鼠) | Millipore | SC1002 | |
| Pax3抗体(小鼠) | Developmental Studies Hybridoma Bank | -- | |
| cJun抗体(小鼠) | BD Bioscience | 610327 | |
| β-actin抗体(小鼠) | Sigma | A5441 | |
| JMJD2C抗体(兔) | Abcam | ab85454 | |
| KDM3A抗体(小鼠) | Abcam | ab91252 | |
| KDM3A抗体(兔) | Abnova | PAB16817 | |
| 免疫荧光 | HDAC1抗体(兔) | Genetex | GTX100513 |
| HDAC2抗体(兔) | Santa Cruz Biotechnology | sc-7899 | |
| Krox20抗体(兔) | Axxora | CO-PRB-236P-100 | |
| JMJD2C抗体(兔) | Abcam | ab85454 | |
| KDM3A抗体(兔) | Proteintech | 12835-1-AP | |
| 神经丝抗体(鸡) | GeneTex | GTX85461 | |
| 神经丝抗体(兔) | Millipore | AB1987 | |
| cJun抗体(兔) | Abcam | ab32137 | |
| GDNF抗体(兔) | Abcam | ab18956 | |
| GAP-43抗体(兔) | Abcam | ab75810 | |
| 共免疫沉淀 | SUMO-1抗体(克隆D-11,小鼠) | Santa Cruz Biotechnology | sc-5308 |
| 乙酰赖氨酸抗体(兔) | Abcam | ab21623 | |
| GFP抗体(兔) | Abcam | ab290 | |
| Flag抗体(克隆M2,小鼠) | Sigma | F1804 | |
| 质谱 | 胰蛋白酶 | Promega | -- |
| QExactive HF质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| EASY-nLC1000色谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Pepmap100 C18捕获柱 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 免疫荧光成像 | Leica TCS SP-II共聚焦显微镜 | Leica | -- |
| 电镜成像 | Philips CM 100 BIOTWIN电镜 | Philips | -- |
| Morada侧装数码相机 | Olympus | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 坐骨神经压榨损伤模型 | 压榨方式(5×10秒)、压榨镊型号Ref. FST 00632-11、麻醉方案(异氟烷3%诱导,1.5–2%维持)、动物年龄3–4个月及性别混合 阅读提示:Methods的Animals部分 |
| HDAC1/2条件性双敲除 | 他莫昔芬2 mg/天腹腔注射连续5天,损伤在末次注射后7天;对照为同窝或年龄匹配同性别小鼠 阅读提示:Methods的Animals部分 |
| Mocetinostat给药 | 剂量10 mg/kg、盆腔注射、每日1次;3天处理为损伤当天及后续2天,5天处理为后续4天;溶剂对照 阅读提示:Methods的Animals部分及Figure 9图注 |
| 功能恢复行为学检测 | Rotarod 15 r.p.m.、每次限300秒、间隔30分钟、4与10 dpl;趾捏试验4、10、16、18、29 dpl;实验者对处理盲法;每组8–9只 阅读提示:Methods的Functional recovery experiments部分及Figure 9图注 |
| 原代RSCs去分化/再分化培养 | 增殖培养基成分(10% FCS、4 μg/ml GGF、2 μM forskolin)、DM饥饿8–15小时、1 mM dbcAMP处理3天、去分化24小时或3天、再分化dbcAMP 24小时 阅读提示:Methods的Cell culture部分及Supplementary Fig. 7 |
| ChIP与荧光素酶报告基因 | ChIP每次IP 75 μg蛋白与3 μg抗体、超声条件;荧光素酶转染后24小时裂解、0.6 μM Mocetinostat或溶剂 阅读提示:Methods的Chromatin immunoprecipitation与Luciferase gene reporter assay部分 |
| 免疫荧光与电镜取材分析 | 电镜分析位置为损伤点远端5 mm、超薄切片70 nm;免疫荧光切片厚度(5 μm或20 μm);每组动物数n=3 阅读提示:Methods的Semithin and ultrathin sections与Immunofluorescence部分及Figure 2图注 |