微流控模型建立与WSS施加
在体外模拟淋巴管流体剪切应力对癌细胞的作用。
采用软光刻技术制作PDMS微流控芯片,通道内壁涂覆I型胶原,接种PC3、DU145等细胞,适应24小时后通过注射泵施加层流WSS。
Fluid shear stress activates YAP1 to promote cancer cell motility.
体外微流控模型、基因表达谱、siRNA/shRNA敲低、药理学抑制、体内原位移植瘤模型及患者来源淋巴结节样本,包含功能与机制验证。
PC3人前列腺癌细胞系 DU145人前列腺癌细胞系 LNCaP人前列腺癌细胞系 PC3-DsRed-Express原位前列腺癌小鼠模型
WSS强度:0.05 dyne cm⁻²用于促进迁移,高达5 dyne cm⁻²时抑制迁移 YAP1敲低效率及对WSS诱导迁移的影响(siRNA,n=3独立实验) TAZ敲低对WSS诱导迁移无显著影响(siRNA,n=3独立实验) TEAD1-4联合敲低将WSS诱导迁移降至静态水平(siRNA,n=3独立实验) YAP1-TEAD抑制剂verteporfin(1 μM)或YTIP对WSS诱导迁移的阻断
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
在体外模拟淋巴管流体剪切应力对癌细胞的作用。
采用软光刻技术制作PDMS微流控芯片,通道内壁涂覆I型胶原,接种PC3、DU145等细胞,适应24小时后通过注射泵施加层流WSS。
检测WSS是否促进癌细胞运动、伪足形成和基质金属蛋白酶活性。
对WSS处理后的PC3和DU145细胞进行延时显微成像,量化细胞速度和轨迹;扫描电镜观察伪足;qRT-PCR检测MMP2/MMP9转录;荧光肽底物法检测总MMP活性。
鉴定WSS激活的信号通路和YAP1依赖的基因表达变化。
对WSS处理3小时的PC3细胞进行Illumina Human HT-12 v4.0表达谱芯片分析,并进行IPA通路分析和YAP1靶基因比对;qRT-PCR验证AMOTL2、CTGF、ANKRD1、CYR61等基因在不同时间点的表达。
明确YAP1和TAZ对WSS诱导癌细胞迁移的各自贡献。
通过siRNA敲低YAP1或TAZ,检测WSS下细胞迁移速度;通过免疫荧光和Western blot检测YAP1/TAZ核转位及S127磷酸化;使用8xGTIIC-DsRed报告系统检测TEAD转录活性。
验证ROCK、LIMK和cofilin在WSS激活YAP1及细胞迁移中的作用。
使用ROCK抑制剂Y27632、LIMK抑制剂LIMKi3处理细胞,检测cofilin磷酸化、YAP1 S127磷酸化和细胞迁移;通过shRNA敲低cofilin或gelsolin,检测对迁移的影响。
验证YAP1与TEAD转录因子结合是否介导WSS诱导的细胞迁移。
转染YAP1 S127A或YAP1 5SA/S94A突变体,检测细胞迁移;使用verteporfin或YTIP抑制YAP1-TEAD相互作用;siRNA敲低TEAD1-4单个或组合,检测迁移速度。
在体内验证淋巴结转移灶中YAP1表达是否高于原发瘤。
将PC3-DsRed-Express细胞原位接种于裸鼠前列腺,10-12周后成像引导切除淋巴结,进行H&E和YAP1免疫组化评分。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | F-12K培养基 | -- | -- |
| RPMI 1640培养基 | -- | -- | |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 药物处理 | 维替泊芬 | Sigma | -- |
| Y27632 | Cayman Chemical | -- | |
| PF-562271 | Selleck Chemicals | -- | |
| LIMKi3 | Millipore | -- | |
| U0126 | Cayman | -- | |
| 微流控芯片制作 | Sylgard 184硅弹性体试剂盒 | Dow Corning | -- |
| I型胶原 | -- | -- | |
| sticky-Slide VI0.4 | ibidi GmbH | -- | |
| 流速控制 | 可编程注射泵(PhD Ultra) | Harvard Apparatus | -- |
| 电镜观察 | Quanta 400 ESEM扫描电镜 | FEI | -- |
| 转染 | FuGENE6转染试剂 | Promega | -- |
| DharmaFECT 1转染试剂 | Dharmacon | -- | |
| 聚凝胺 | -- | -- | |
| RNA提取 | RNeasy Micro试剂盒 | Qiagen | -- |
| qRT-PCR | Taqman PCR | Applied Biosystems | -- |
| MMP活性检测 | Mca-K-P-L-G-L-Dpa-A-R-NH2荧光肽底物 | R&D system | -- |
| 荧光检测 | Infinite M1000 Pro酶标仪 | TECAN | -- |
| 基因表达谱 | Illumina Human HT-12 v4.0表达谱芯片 | Illumina | -- |
| 免疫荧光染色 | 小鼠抗YAP1单克隆抗体(克隆2F12) | Abnova | H00010413-M01 |
| 抗TAZ单克隆抗体(克隆M2-616) | BD pharmingen | 560235 | |
| 兔抗微管蛋白多克隆抗体(克隆H-300) | Santa Cruz | sc-5546 | |
| Alexa 488标记兔抗小鼠二抗 | Invitrogen | A11059 | |
| Cy3标记驴抗小鼠二抗 | Jackson Immunoresearch | 715-165-151 | |
| Alexa 488标记山羊抗兔二抗 | -- | A11008 | |
| Alexa Fluor 594鬼笔环肽 | ThermoFisher | A12381 | |
| Draq5 | Invitrogen | -- | |
| Western blot | 抗YAP1抗体(克隆H-9) | Santa Cruz | sc-271134 |
| 磷酸化YAP1(Ser127)抗体 | Cell Signaling Technology | 4911 | |
| 抗TAZ抗体(克隆M2-616) | BD Pharmingen | -- | |
| 抗cofilin抗体 | Abcam | ab42824 | |
| 抗磷酸化cofilin(S3)抗体 | Abcam | ab12866 | |
| 抗gelsolin抗体 | Santa Cruz | sc-57509 | |
| 抗磷酸化p44/42 MAPK(磷酸化ERK1/2,Thr202/Tyr204)抗体 | Cell Signaling Technology | 9101 | |
| 抗p44/42 MAPK(ERK1/2)抗体 | Cell Signaling Technology | 9102 | |
| 抗FAK抗体 | Cell Signaling Technology | 3285 | |
| 抗磷酸化FAK(Tyr397)抗体 | Cell Signaling Technology | 3283 | |
| β-actin抗体(克隆C4) | Santa Cruz | sc-271134 | |
| 免疫组化 | YAP1抗体(克隆1A12) | Acris | AM06727PU-N |
| MACH4小鼠探针 | Dako | -- | |
| MACH4通用聚合物 | Dako | -- | |
| DAB显色剂 | Dako | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 微流控芯片制备与WSS施加 | PDMS通道尺寸(长度35 mm,直径1.8 mm)、I型胶原包被浓度(50 μg ml⁻¹)与时间(4°C 24小时)、流速(47 μl min⁻¹)及对应WSS(0.05 dyne cm⁻²)、细胞接种后适应时间(24小时) 阅读提示:Methods 'Microfluidic devices and application of WSS'小节及Supplementary Fig. 1 |
| 细胞迁移检测 | 延时成像时间间隔(3分钟)、总时长(6小时)、环境条件(37°C,5% CO2)、每位置细胞数(>15)、每装置位置数(5)、每条件装置数(≥3)、独立实验次数(n=3或n=7) 阅读提示:Methods 'Time-lapse imaging'小节及Figure 1图注 |
| YAP1/TAZ敲低与迁移功能验证 | siRNA终浓度(25 nM)、转染试剂(DharmaFECT 1)、WSS施加时间(6小时)、迁移量化方法(延时成像追踪)、独立实验次数(n=3) 阅读提示:Methods 'Ectopic expression and knockdown'小节及Figure 3图注 |
| 药理学抑制实验 | Verteporfin浓度(1 μM)、Y27632浓度(10 μM)、PF-562271浓度(5 μM)及预孵育时间(2小时)、LIMKi3浓度(10 μM)、U0126浓度(10 μM) 阅读提示:Methods 'Cell culture and pharmacological reagents'小节 |
| 原位移植瘤模型与淋巴结转移分析 | 细胞接种数量(106个PC3-DsRed-Express细胞)、小鼠品系与周龄(6-8周龄雄性nu/nu)、接种部位(前列腺背侧)、评估时间(植入后10-12周)、YAP1 IHC评分方法(阳性百分比×染色强度,0-300) 阅读提示:Methods 'Histopathology of primary tumours and metastases'小节及Figure 2图注 |