药理学抑制PKM2对炎症小体活化的影响
验证PKM2抑制剂shikonin是否选择性影响不同炎症小体活化。
在LPS预处理的BMDMs、PMA分化的THP1细胞和PMs中,用ATP、poly(dA:dT)、MDP或flagellin刺激,并给予shikonin,检测IL-1β、IL-18、HMGB1释放和caspase-1活性。
PKM2-dependent glycolysis promotes NLRP3 and AIM2 inflammasome activation.
含体外巨噬细胞模型、基因敲除/敲低、体内内毒素血症和CLP脓毒症模型及生存分析,具备功能与机制验证。
小鼠原代骨髓来源巨噬细胞(BMDMs) 小鼠腹腔巨噬细胞(PMs) PMA分化的THP1细胞 髓系细胞特异性PKM2敲除小鼠(LPS/ATP或LPS/nucleosome模型)
LPS(500 ng/ml,3 h)预处理后,ATP(5 mM,30 min)或poly(dA:dT)(1 μg/ml,8 h)刺激,以MDP(200 ng/ml,8 h)或flagellin(200 ng/ml,8 h)作为对照 PKM2药理学抑制使用shikonin(1和5 μM),遗传学抑制使用PKM2特异性shRNA EIF2AK2抑制使用C16(1和5 μM)或EIF2AK2特异性shRNA 体内内毒素血症模型:LPS 5 mg/kg腹腔注射;CLP诱导多微生物脓毒症 髓系PKM2敲除小鼠:LPS(2 mg/kg)预处理3 h后,腹腔注射ATP(200 mg/kg)或nucleosome(20 mg/kg)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证PKM2抑制剂shikonin是否选择性影响不同炎症小体活化。
在LPS预处理的BMDMs、PMA分化的THP1细胞和PMs中,用ATP、poly(dA:dT)、MDP或flagellin刺激,并给予shikonin,检测IL-1β、IL-18、HMGB1释放和caspase-1活性。
通过shRNA敲低PKM2确认其对NLRP3和AIM2炎症小体活化的作用。
用PKM2特异性shRNA慢病毒转导BMDMs、PMA分化的THP1细胞和PMs,LPS预处理后给予炎症小体激活剂,检测细胞因子释放、caspase-1活化和PKM2二聚体形成。
验证糖酵解代谢及糖酵解相关基因是否参与NLRP3和AIM2炎症小体活化。
检测shikonin、2DG或PKM2 shRNA对PEP和乳酸水平的影响;敲低SLC2A1、LDHA或PDK1后检测乳酸产生、IL-1β/HMGB1释放和caspase-1活化;检测线粒体膜电位、MitoSOX和自噬标志物。
探讨PKM2是否影响caspase-1缺陷背景下的糖酵解及炎症小体接头蛋白相互作用。
在caspase-1−/− BMDMs中,给予shikonin或PKM2 shRNA,检测PEP/乳酸产生、NLRP3或AIM2与PYCARD的相互作用、LDH释放和线粒体膜电位。
验证PKM2依赖的乳酸产生是否通过EIF2AK2磷酸化调控炎症小体活化。
检测shikonin、PKM2 shRNA或PDK1 shRNA对ATP/poly(dA:dT)诱导的EIF2AK2磷酸化的影响;用乳酸处理BMDMs,结合C16、EIF2AK2 shRNA、caspase-1/11敲除、NLRP3/AIM2/NLRC4/NLRP1敲除及P2RX7拮抗剂A-438079,检测细胞因子释放和caspase-1/11活化。
评估靶向PKM2–EIF2AK2通路在致死性内毒素血症和多微生物脓毒症模型中的治疗潜力。
在LPS诱导的内毒素血症和CLP诱导的脓毒症小鼠中,给予shikonin或C16,检测腹腔巨噬细胞EIF2AK2磷酸化、caspase-1活性、血清IL-1β和HMGB1水平及生存率。
通过遗传学模型确认PKM2在体内NLRP3和AIM2炎症小体活化中的作用。
构建髓系细胞特异性PKM2敲除小鼠(PKM2flox/flox × LysM-Cre),LPS预处理后给予ATP或nucleosome,检测生存率和血清IL-1β、HMGB1水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞刺激 | 脂多糖(大肠杆菌LPS 0111:B4) | Sigma | L4391 |
| 糖酵解抑制 | 2-脱氧-D-葡萄糖 | Sigma | D8375 |
| EIF2AK2抑制 | C16 | Sigma | I9785 |
| P2RX7拮抗 | A438079 | Sigma | A9736 |
| 乳酸处理 | 乳酸 | Sigma | L6661 |
| PKM2抑制 | 紫草素 | Millipore Corporation | 517-89-5 |
| 炎症小体激活 | 三磷酸腺苷 | InvivoGen | tlrl-atp |
| poly(dA:dT)/LyoVec | InvivoGen | tlrl-patc | |
| 转染对照 | LyoVec | InvivoGen | lyec-12 |
| 炎症小体激活 | 胞壁酰二肽 | InvivoGen | tlrl-mdp |
| 鞭毛蛋白 | InvivoGen | tlrl-stfla | |
| AIM2炎症小体激活 | 纯化核小体 | EpiCypher | 16-0002 |
| 细胞因子检测 | HMGB1酶联免疫吸附测定试剂盒 | Shino Test Corporation | ST51011 |
| IL-1β酶联免疫吸附测定试剂盒 | R&D | MLB00C | |
| IL-1β酶联免疫吸附测定试剂盒 | R&D | DY201 | |
| IL-18酶联免疫吸附测定试剂盒 | R&D | 7625 | |
| IL-18酶联免疫吸附测定试剂盒 | R&D | 7620 | |
| 代谢物检测 | L-乳酸测定试剂盒 | Abcam | ab65331 |
| caspase活性检测 | caspase-1测定试剂盒 | Abcam | ab39412 |
| caspase-11测定试剂盒 | Abbexa Ltd | abx255239 | |
| 细胞毒性检测 | 乳酸脱氢酶测定试剂盒 | Abcam | ab102526 |
| 线粒体膜电位检测 | TMRE线粒体膜电位测定试剂盒 | Abcam | ab113852 |
| 线粒体ROS检测 | MitoSox | Thermo Fisher Scientific Inc. | M36008 |
| RNA干扰 | 对照空载shRNA | Sigma | SHC001 |
| Western blot | IL-1β抗体 | R&D | AF-401-NA |
| caspase-1抗体 | Adipogen | AG-20B-0042 | |
| NLRP3抗体 | Adipogen | AG-20B-0014 | |
| PKM2抗体 | Cell Signaling Technology | 4053 | |
| PKM1抗体 | Cell Signaling Technology | 7067 | |
| ACTB抗体 | Cell Signaling Technology | 3700 | |
| AIM2抗体 | Cell Signaling Technology | 13095 | |
| PDK1抗体 | Cell Signaling Technology | 3062 | |
| EIF2AK2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-1702 | |
| SQSTM1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-28359 | |
| PYCARD抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-22514-R | |
| 磷酸化EIF2AK2抗体 | Millipore | 07-886 | |
| MAP1LC3B抗体 | Novus Biologicals | NB100-2220 | |
| 增强化学发光 | Pierce | 32106 | |
| 免疫沉淀 | Protein A/G琼脂糖/琼脂糖珠 | Thermo Fisher Scientific Inc. | 20423 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 巨噬细胞炎症小体活化检测 | LPS预处理浓度与时间(500 ng/ml,3 h)、ATP(5 mM,30 min)、poly(dA:dT)(1 μg/ml,8 h)、MDP(200 ng/ml,8 h)、flagellin(200 ng/ml,8 h)的刺激条件及检测终点(ELISA、caspase-1活性、Western blot) 阅读提示:Methods的Cell culture小节及Figure 1、2图注 |
| PKM2药理学和遗传学抑制 | shikonin浓度(1和5 μM)、PKM2 shRNA转导时间(48 h)及对照shRNA设置 阅读提示:Methods的Reagents、RNAi小节及Figure 1、2图注 |
| 乳酸和EIF2AK2通路验证 | 乳酸浓度(5 mM,3 h)、C16浓度(1和5 μM)、EIF2AK2 shRNA及caspase-1/11、NLRP3、AIM2等基因敲除小鼠来源细胞的基因型 阅读提示:Methods的Cell culture、RNAi小节及Figure 5图注 |
| 体内内毒素血症和CLP脓毒症模型 | LPS剂量(5 mg/kg,i.p.)、CLP手术、shikonin(8 mg/kg)和C16(内毒素血症8 mg/kg;CLP 50 μg/kg)的给药时间点、每组动物数(n=20)及生存观察期 阅读提示:Methods的Animal model of endotoxemia and sepsis小节及Figure 6图注 |
| 髓系PKM2敲除小鼠模型 | PKM2flox/flox与LysM-Cre杂交策略、LPS(2 mg/kg)预处理3 h后ATP(200 mg/kg)或nucleosome(20 mg/kg)攻击、每组动物数(n=10) 阅读提示:Methods的Animal model of endotoxemia and sepsis小节及Figure 7图注 |