应激后Hsp70共伴侣结合的时序变化分析
探究应激后Hsp70在蛋白重折叠与降解功能之间的转换。
HEK293T细胞经H2O2处理,免疫沉淀内源性Hsp70和Hsc70,Western blot检测共伴侣Hop、Hsp90、CHIP、Hsp40结合随时间变化。
ARD1-mediated Hsp70 acetylation balances stress-induced protein refolding and degradation.
包含体外重组蛋白乙酰化、ATP酶活性、细胞系应激模型、突变体功能验证及斑马鱼体内实验,具备功能与机制验证
HEK293T细胞 SH-SY5Y细胞 斑马鱼胚胎
Hsp70 K77乙酰化水平在应激后早期(1–4 h)升高,后期(12–24 h)降低 K77R突变削弱Hsp70与Hop/Hsp90结合,增强与CHIP/Hsp40结合 K77Q突变在后期 impair 泛素介导的蛋白降解 ARD1 K136R或显性负性突变体阻断应激诱导的Hsp70 K77乙酰化 斑马鱼中Hsp70 K77R突变降低对H2O2和MPTP应激的保护作用
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究应激后Hsp70在蛋白重折叠与降解功能之间的转换。
HEK293T细胞经H2O2处理,免疫沉淀内源性Hsp70和Hsc70,Western blot检测共伴侣Hop、Hsp90、CHIP、Hsp40结合随时间变化。
明确应激后Hsp70乙酰化是否与共伴侣结合变化相关。
HEK293T细胞经H2O2处理,免疫沉淀Hsp70和Hsc70,用抗乙酰化赖氨酸抗体检测乙酰化水平;SH-SY5Y细胞稳定表达GFP-Hsp70,比较乙酰化与转录激活时间。
确定ARD1是否直接乙酰化Hsp70并介导应激反应。
免疫共沉淀检测ARD1与Hsp70/Hsc70结合;ARD1 siRNA敲低后检测Hsp70乙酰化和共伴侣结合;体外乙酰化实验用重组GST-ARD1、GST-Hsp70、GST-Hsc70。
确定ARD1介导的Hsp70乙酰化关键位点。
构建Hsp70缺失突变体进行体外乙酰化,LC-MS/MS鉴定乙酰化肽段;K77R点突变验证;制备K77乙酰化特异性抗体检测细胞应激后K77乙酰化。
验证K77乙酰化是否调节Hsp70的ATP酶循环。
体外乙酰化后检测野生型和K77R突变体ATP酶活性和ATP结合;序列比对和结构分析K77位置。
验证K77乙酰化是否决定Hsp70与Hop/CHIP的竞争性结合。
细胞转染Hsp70 WT或K77R,检测共伴侣结合;体外乙酰化后竞争性结合实验;TSA处理或HDAC4过表达/敲低改变乙酰化状态,检测共伴侣转换。
验证K77乙酰化/去乙酰化转换是否影响蛋白重折叠和降解。
荧光素酶重折叠实验检测早期重折叠;MG132处理检测后期总蛋白泛素化;蛋白聚集检测试剂检测聚集。
验证Hsp70 K77乙酰化是否保护细胞抵抗应激诱导的死亡。
SH-SY5Y稳定表达Hsp70 WT/K77R和ARD1 WT/DN,多种应激处理后检测存活率、凋亡率、caspase剪切和细胞色素c释放。
在体内验证ARD1介导的Hsp70 K77乙酰化对应激的保护作用。
斑马鱼胚胎注射Hsp70 WT/K77R和ARD1 WT/DN mRNA,H2O2处理检测存活率,MPTP处理检测多巴胺能神经元损失和运动活性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 质粒构建 | Muta-Direct定点突变试剂盒 | Intron | -- |
| 转染 | 聚乙烯亚胺 | -- | -- |
| Oligofectamin试剂 | Invitrogen | -- | |
| PolyFect试剂 | Qiagen | -- | |
| 细胞培养 | G418 | -- | -- |
| Western blot | 抗Hsp70抗体 | Enzo Lifescience | ADI-SPA-810 |
| 抗Hsc70抗体 | Enzo Lifescience | ADI-SPA-815 | |
| 抗Hop抗体 | Cell Signaling Technology | 5669 | |
| 抗Hsp40抗体 | Cell Signaling Technology | 4868 | |
| 抗乙酰化赖氨酸抗体 | Cell Signaling Technology | 9941 | |
| 抗细胞色素c抗体 | Cell Signaling Technology | 11940 | |
| 抗cox-4抗体 | Cell Signaling Technology | 4844 | |
| 抗caspase-9抗体 | Cell Signaling Technology | 9508 | |
| 抗剪切caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9661 | |
| 抗HDAC4抗体 | Cell Signaling Technology | 7628 | |
| 抗Hsp90抗体 | Santa Cruz | sc-7947 | |
| 抗CHIP抗体 | Santa Cruz | sc-66830 | |
| 抗Myc抗体 | Santa Cruz | sc-40 | |
| 抗ARD1抗体 | Santa Cruz | sc-33820 | |
| 抗GST抗体 | Santa Cruz | sc-138 | |
| 抗FLAG抗体 | Sigma | F1804 | |
| 抗微管蛋白抗体 | Sigma | T9016 | |
| 抗GFP抗体 | Abcam | ab6556 | |
| 抗泛素抗体 | Dako | Z0458 | |
| 免疫沉淀 | A或G琼脂糖珠 | Upstate | -- |
| 蛋白纯化 | 谷胱甘肽琼脂糖4B | GE Healthcare | -- |
| 体外结合实验 | 人Hop重组蛋白 | BioVision | -- |
| 人CHIP重组蛋白 | BioVision | -- | |
| ATP结合实验 | ATP-琼脂糖珠 | Innova Biosciences | -- |
| ATP酶活性检测 | ATP酶检测试剂盒 | Innova Biosciences | -- |
| Hsp40重组蛋白 | ATGen | -- | |
| 细胞分级分离 | 培养细胞线粒体分离试剂盒 | ThermoFisher Scientific | -- |
| 蛋白聚集检测 | Proteostat蛋白聚集检测试剂盒 | Enzo Lifescience | -- |
| 细胞存活检测 | LDH检测试剂盒 | DoGen | -- |
| 凋亡检测 | APC Annexin V凋亡检测试剂盒 | Biolegends | -- |
| mRNA体外转录 | mMESSAGe mMACHINE试剂盒 | Ambion | -- |
| 免疫组化 | 抗TH抗体 | Millipore | -- |
| 生物素标记二抗 | Vector Labs | -- | |
| VECTASTAIN ABC试剂盒 | Vector Labs | -- | |
| 行为学分析 | DanioVision追踪系统 | Noldus Information Technology | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞应激处理 | 应激试剂浓度:1 mM H2O2、100 μM etoposide、1 mM MPP+、100 mM NaCl、150 mM EtOH;处理时间点需按图注核对 阅读提示:Methods中Cell culture and stimulation小节及Figure 1、3、5、6图注 |
| Hsp70乙酰化检测 | 免疫沉淀使用的抗体、抗Lys-Ac抗体货号#9941、时间点(早期1–4 h,晚期12–24 h) 阅读提示:Figure 1b、2b、3d图注;Methods中Immunoblotting and immunoprecipitation及Antibodies小节 |
| 体外乙酰化实验 | 重组蛋白用量(0.5–1 μg)、乙酰-CoA浓度(10 mM)、反应温度37 °C、反应时间1 h 阅读提示:Methods中In vitro acetylation assay小节及Figure 2d、3c图注 |
| 荧光素酶重折叠实验 | H2O2浓度0.3 mM、处理30 min、恢复2 h;环己酰亚胺处理30 min 阅读提示:Methods中Luciferase refolding assay小节及Figure 5e图注 |
| 斑马鱼体内实验 | mRNA注射量200 pg;H2O2浓度5 mM处理1 h;MPTP浓度10 μg/ml处理1–5 dpf;检测时间点 阅读提示:Methods中In vitro mRNA transcription、Zebrafish survival rate、Immunohistochemistry小节及Supplementary Fig. 11 |