ENU诱变筛选与CHD突变品系鉴定
鉴定引起CHD的突变并获取突变品系
对C57Bl/6J小鼠进行ENU诱变,通过宫内超声筛查超过80,000个胎儿,回收超过200个CHD突变品系,并通过全外显子测序和基因分型在135个品系中鉴定致病突变。
Genetic link between renal birth defects and congenital heart disease.
小鼠ENU正向遗传筛选135品系、患者队列77例、细胞培养与电镜及免疫荧光机制验证
ENU诱变C57Bl/6J小鼠突变品系 CHD患者队列(77例) 小鼠肾脏上皮细胞(MEK)
135个CHD突变品系中39个(29%)出现肾脏异常 77例CHD患者中23例(30%)有肾脏缺陷 Cep290突变体肾上皮细胞仅10%中心粒停靠,而野生型和Ift20突变体约半数停靠 严重囊性肾病仅见于纤毛相关基因突变品系
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定引起CHD的突变并获取突变品系
对C57Bl/6J小鼠进行ENU诱变,通过宫内超声筛查超过80,000个胎儿,回收超过200个CHD突变品系,并通过全外显子测序和基因分型在135个品系中鉴定致病突变。
确定CHD突变是否也引起肾脏异常及异常类型
对CHD突变品系进行肾脏组织学(H&E染色)和免疫荧光分析,分类肾脏异常包括双肾、多肾、肾缺如、肾积水、囊性肾病等。
分析囊性肾病表型与纤毛相关基因突变的关系
将囊性肾病分为继发于肾积水、中度囊性病和重度囊性病三类,并统计与纤毛相关基因或非纤毛相关基因突变的关联。
探究产前囊肿形成与中心粒停靠缺陷的关系
培养野生型、Ift20突变体和Cep290突变体小鼠肾上皮细胞,通过透射电镜观察中心粒停靠,通过免疫荧光检测Cep164、Nphp1和Ift88等标记物。
评估小鼠发现对人类CHD患者的临床相关性
招募77例需要手术干预的CHD患者,回顾性查阅病历,统计肾脏异常的发生率和类型。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 组织学染色 | SafeClear | Fisher Diagnostics | -- |
| Edgar Degas伊红 | Biocare Medical | -- | |
| Permount封片剂 | Fisher Scientific | -- | |
| 免疫荧光 | 鱼皮明胶 | Sigma | G7765 |
| Alexa Fluor偶联二抗 | Life Technologies | -- | |
| Prolong Gold封片剂 | Life Technologies | -- | |
| 6-11B-1抗体 | Sigma | T6793 | |
| GTU-88抗体 | Sigma | T5326 | |
| T1α抗体(克隆8.1.1) | Developmental Studies Hybridoma Bank, University of Iowa | -- | |
| Cep164抗体 | Proteintech | 22227-1-AP | |
| 荧光素标记双花扁豆凝集素 | Vector Labs | FL-1031 | |
| 荧光素标记四角豆凝集素 | Vector Labs | FL-1321 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| F12培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 电镜样品制备 | SpiPon 812/Araldite 502树脂 | -- | -- |
| 电镜观察 | Philips CM 10透射电子显微镜 | Philips | -- |
| Gatan Erlangshen电荷耦合器件数码相机 | Gatan | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| ENU诱变筛选 | 小鼠品系C57Bl/6J、ENU诱变方法、筛查胎儿数量、超声筛查时间点 阅读提示:Methods: Mouse breeding;Results: Forward genetic screen identifies diverse kidney anomalies |
| 肾脏表型分析 | H&E染色和免疫荧光的具体抗体、切片厚度、观察指标(双肾、多肾、肾积水、囊肿等) 阅读提示:Methods: Histology;Figure legends 1-3 |
| 细胞培养与中心粒停靠分析 | MEK细胞来源(胚胎第18天肾脏)、血清饥饿浓度0.25%和时间48小时、电镜固定条件、免疫荧光抗体稀释度 阅读提示:Methods: Cell culture;Figure 4 legend |
| 患者队列分析 | 患者年龄<1岁、CHD诊断标准、肾脏异常评估方法(超声、病历回顾)、样本量77例 阅读提示:Methods: Patient recruitment and analysis;Results: Human CHD patients have associated renal anomalies |