Cep57动粒定位与Mis12结合验证
验证Cep57是否定位于人类细胞动粒并与Mis12相互作用
利用抗Cep57抗体进行免疫荧光共染CREST、CENP-A、Mis12和Zwint-1;通过酵母双杂交、免疫共沉淀和GST pull-down验证Cep57与Mis12的结合;使用截短突变体定位结合区域;通过RNAi敲低Cep57或Mis12检测相互依赖的动粒定位。
Cep57 is a Mis12-interacting kinetochore protein involved in kinetochore targeting of Mad1-Mad2.
包含细胞系、体外重组蛋白、活细胞成像等多层级证据,并进行了功能验证与机制验证。
HeLa细胞 RPE1细胞 HEK293T细胞 体外纯化蛋白结合与微管共沉淀体系
Cep57与Mis12的结合区域及关键氨基酸(Mis12 L132G突变) Cep57与Mad1的结合区域(Cep57 C端195–500 aa,Mad1 N端1–530 aa) Cep57缺失对Mad1–Mad2动粒定位的影响(约减少50%) Cep57-12A突变体(12个正电荷残基突变为丙氨酸)对微管结合及Mad1移除的影响 活细胞成像检测有丝分裂时长和染色体滞后
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证Cep57是否定位于人类细胞动粒并与Mis12相互作用
利用抗Cep57抗体进行免疫荧光共染CREST、CENP-A、Mis12和Zwint-1;通过酵母双杂交、免疫共沉淀和GST pull-down验证Cep57与Mis12的结合;使用截短突变体定位结合区域;通过RNAi敲低Cep57或Mis12检测相互依赖的动粒定位。
验证Mis12与Cep57的相互作用是否介导Cep57的动粒定位
构建Mis12突变体,通过体外pull-down和酵母双杂交鉴定关键氨基酸L132G;在Mis12敲低细胞中表达RNAi抗性的野生型或L132G突变体Mis12,免疫荧光检测Cep57及其他KMN组分的动粒定位。
验证Cep57缺失是否减弱SAC激活
Cep57敲低后使用nocodazole或taxol处理,活细胞成像监测有丝分裂时长;免疫共沉淀检测Cdc20与Mad2的结合;Western blot检测securin和cyclin B1降解。
验证Cep57缺失是否导致染色体分离错误
活细胞成像监测HeLa和RPE1细胞从核膜破裂到后期起始的时间;免疫荧光检测染色体滞后和多极纺锤体;使用Mis12 L132G突变体验证动粒定位Cep57的特异性作用。
验证Cep57是否参与Mad1–Mad2的动粒定位
Cep57敲低后免疫荧光检测Mad1和Mad2的动粒信号;检测其他动粒蛋白KNL1、Zwint-1、ZW10、Bub1和BubR1的定位;使用siRNA抗性Cep57进行回复实验。
验证Cep57是否直接结合Mad1并定位结合区域
酵母双杂交、免疫共沉淀和体外pull-down验证Cep57与Mad1的结合;使用截短突变体定位Cep57 C端(195–500 aa)和Mad1 N端(1–530 aa)为结合区域;免疫荧光检测Mad1突变体的动粒定位。
验证Cep57的微管结合是否竞争性抑制Mad1结合并促进Mad1从动粒移除
微管共沉淀和pull-down实验检测Cep57与微管及Mad1的结合;构建Cep57-12A突变体(12个正电荷残基突变为丙氨酸)消除微管结合;在Cep57敲低细胞中表达野生型或12A突变体,免疫荧光检测 metaphase 动粒Mad1信号及有丝分裂阶段。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫荧光 | 抗Cep57抗体 | GeneTex | GTX115931 |
| 抗Mad1抗体 | GeneTex | GTX109519 | |
| 抗Mad2抗体 | Abcam | ab97777 | |
| 抗Mis12抗体 | Abcam | ab70843 | |
| 抗CENP-A抗体 | MBL | D115-3 | |
| 抗Zwint-1抗体 | GeneTex | GTX107155 | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Sigma | T9026 | |
| 抗γ-微管蛋白抗体 | Sigma | T3559 | |
| 抗CREST抗体 | -- | 12439-1-AP | |
| Western blot | 抗Flag抗体 | Sigma | F3165 |
| 抗GFP抗体 | MBL | D153-3 | |
| 抗HA抗体 | Sigma | H9658 | |
| 抗GAPDH抗体 | Biolinks | G9295 | |
| 抗Myc抗体 | MBL | M192-3 | |
| 抗β-微管蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 2128 | |
| 抗cyclin B1抗体 | Cell Signaling Technology | 12231 | |
| 抗securin抗体 | Abcam | ab79546 | |
| 抗Cdc20抗体 | GeneTex | GTX111137 | |
| 抗GST抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-33613 | |
| 免疫荧光 | 抗KNL1抗体 | Abcam | ab70537 |
| 抗DSN1抗体 | Proteintech | 17742-1-AP | |
| 抗ZW10抗体 | Proteintech | 24561-1-AP | |
| 抗Hec1抗体 | GeneTex | GTX70268 | |
| 抗BubR1抗体 | Proteintech | 11505-2-AP | |
| 抗Bub1抗体 | GeneTex | GTX107497 | |
| 细胞培养与转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| JetPEI转染试剂 | Polyplus transfection | -- | |
| 药物处理 | 紫杉醇 | Sigma | -- |
| MG132 | Sigma | -- | |
| 诺考达唑 | Invitrogen | -- | |
| 胸苷 | Sigma | -- | |
| 蛋白纯化 | 谷胱甘肽Sepharose 4B珠 | Amersham Bioscience | -- |
| 淀粉酶磁珠 | New England BioLabs | -- | |
| 免疫共沉淀 | 蛋白A-Sepharose珠 | Amersham Biosciences | -- |
| Western blot | 聚偏二氟乙烯膜 | Millipore | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| Cep57动粒定位与Mis12结合 | 抗体种类和稀释比例、细胞系(HeLa/RPE1)、siRNA序列和浓度、MG132处理时间 阅读提示:Methods中Antibodies、Cell cultures and treatments、RNA interference小节;Figure 1图注 |
| Cep57在SAC激活中的作用 | nocodazole浓度(100 nM)、taxol浓度(80 nM)、siRNA转染时间(48小时)、双胸苷同步化方案 阅读提示:Methods中Cell cultures and treatments;Figure 3图注 |
| Cep57对Mad1–Mad2动粒招募的影响 | nocodazole和MG132处理浓度与时间、taxol和MG132处理浓度与时间、免疫荧光定量方法 阅读提示:Methods中Cell cultures and treatments、Immunofluorescence;Figure 5图注 |
| Cep57微管结合活性在SAC沉默中的作用 | 微管浓度(1.0 μM)、GST-Cep57(195–500 aa)浓度(0.1 μM)、Flag-Mad1浓度(0.05 μM)、Cep57-12A突变位点 阅读提示:Methods中Microtubule polymerization and co-sedimentation assays;Figure 7图注 |