检测PDAC细胞分泌BAG3及体内外释放
验证PDAC细胞是否释放BAG3及其在体内的存在
检测五种人PDAC细胞系细胞内和上清BAG3,亚细胞组分分离,免疫荧光共定位,小鼠血清和自发PDAC模型血清中BAG3检测。
BAG3 promotes pancreatic ductal adenocarcinoma growth by activating stromal macrophages.
包含体外细胞实验、原代单核细胞、多种小鼠模型(PDX、同系、原位)及患者样本,并有功能验证(抗体阻断、基因沉默)和机制验证(受体鉴定、信号通路)
人PDAC细胞系(MIA PaCa-2、PANC-1、CFPAC-1等) 小鼠巨噬细胞系J774.A1及人原代单核细胞 PDX模型(NOD/SCID及nu/nu小鼠) 原位和同系小鼠PDAC模型(nu/nu、C57BL6小鼠)
MIA PaCa-2细胞原位移植nu/nu小鼠,抗BAG3 mAb 20 mg/kg每48小时腹腔注射,肿瘤体积和转移评估 PDX模型(F1 cohort)抗BAG3 mAb 20 mg/kg每48小时腹腔注射,肿瘤体积测量 同系模型mt4-2D细胞接种C57BL6小鼠,抗BAG3 mAb 20 mg/kg每48小时腹腔注射4周 J774.A1细胞IFITM-2沉默(siRNA)后BAG3结合和IL-6释放检测 rBAG3刺激单核细胞后条件培养基对PDAC细胞增殖的影响(MTT法)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证PDAC细胞是否释放BAG3及其在体内的存在
检测五种人PDAC细胞系细胞内和上清BAG3,亚细胞组分分离,免疫荧光共定位,小鼠血清和自发PDAC模型血清中BAG3检测。
确定BAG3是否结合并激活巨噬细胞
FITC-rBAG3结合实验,rBAG3刺激J774.A1细胞,检测亚硝酸盐、COX-2、iNOS、IL-6,抗BAG3抗体阻断实验,原代单核细胞验证。
检验BAG3激活的巨噬细胞是否分泌促PDAC生长因子
用rBAG3或LPS刺激单核细胞的条件培养基处理MIA PaCa-2和CFPAC-1,MTT检测增殖,抗IL-6受体抗体阻断实验。
确定BAG3的受体和下游信号
His-rBAG3与J774.A1膜蛋白交联,LC-MS/MS鉴定IFITM-2,共免疫沉淀验证,siRNA沉默IFITM-2,检测AKT和p38磷酸化,抑制剂实验。
验证阻断BAG3对肿瘤生长和转移的影响
PDX模型、同系mt4-2D模型和原位MIA PaCa-2模型,抗BAG3 mAb治疗,监测肿瘤体积、转移、巨噬细胞浸润和细胞因子。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Dulbecco改良Eagle培养基 | GIBCO | -- |
| RPMI-1640培养基 | EuroClone | -- | |
| 胎牛血清 | GIBCO | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Lonza | -- | |
| L-谷氨酰胺 | Lonza | -- | |
| 马血清 | Gibco | -- | |
| 单核细胞分离 | 淋巴细胞分离液 | Lonza | 17-829F |
| 单核细胞分离试剂盒II | Miltenyi Biotec | 130-091-153 | |
| Western blot | 抗BAG3兔多克隆抗体 | BIOUNIVERSA s.r.l. | -- |
| 抗BAG3鼠单克隆抗体 | BIOUNIVERSA s.r.l. | -- | |
| 抗GAPDH(6C5)抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-32233 | |
| 抗磷酸化p38抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-17852-R | |
| 抗钙联蛋白(H-70)抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-11398 | |
| 抗Rab-4a(D-20)抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-312 | |
| 免疫荧光 | 抗β-整合素-PE抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-13590 |
| Western blot | 抗磷酸化Akt抗体 | Cell Signaling | 9271 |
| 抗iNOS抗体 | BD Transduction Laboratories | 610431 | |
| 抗COX-2抗体 | BD Transduction Laboratories | 610203 | |
| 抗体对照 | 人IgG | Sigma-Aldrich | I2511 |
| 小鼠IgG1 | Gmbh | ABIN125733 | |
| 细胞处理 | 托珠单抗 | Hoffmann-La Roche | -- |
| Western blot | 抗IFITM-2抗体 | Proteintech | 12769-1-AP |
| 免疫荧光 | DyLight 488标记抗兔IgG抗体 | Jackson Immunoresearch Laboratories | -- |
| 594标记山羊抗小鼠抗体 | Jackson Immunoresearch Laboratories | -- | |
| 抗体对照 | 小鼠IgG F(ab')2片段 | Jackson Immunoresearch Laboratories | 015-000-006 |
| Western blot | 过氧化物酶标记二抗 | Jackson Immunoresearch Laboratories | -- |
| 细胞活力检测 | MTT(3-(4,5-二甲基噻唑-2)-2,5-二苯基四氮唑溴盐) | Sigma-Aldrich | M2128 |
| 细胞刺激 | 脂多糖(大肠杆菌0111:B4) | Sigma-Aldrich | L4391 |
| 细胞处理 | 多粘菌素B硫酸盐 | Sigma-Aldrich | P0972 |
| 抗体标记 | FluoroTag FITC标记试剂盒 | Sigma-Aldrich | FITC1-1KT |
| 细胞处理 | 牛血清白蛋白 | Sigma-Aldrich | A9418 |
| ELISA | 小鼠IL-6 ELISA试剂盒 | eBioscience | 88-7064-88 |
| 人IL-6 ELISA试剂盒 | eBioscience | 88-7066-88 | |
| 细胞处理 | LY294002 | Calbiochem | -- |
| SB203580 | Calbiochem | -- | |
| 细胞转染 | Transfectin转染试剂 | Bio-Rad | -- |
| 逆转录 | QuantiTect逆转录试剂盒 | QIAGEN | 205310 |
| PCR | HotStarTaq预混液 | Qiagen | -- |
| Western blot | ECL检测试剂 | Amersham Life Sciences Inc. | -- |
| 免疫荧光 | Hoechst 33342 | Molecular Probes | -- |
| 抗F4/80抗体 | Abcam | -- | |
| 抗CD68抗体 | Abcam | -- | |
| 细胞因子检测 | Myriad RBM小鼠炎症MAP v. 1.0阵列 | Myriad RBM | -- |
| 质谱分析 | LTQ Velos线性离子阱质谱仪 | Thermo Scientific | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| BAG3释放检测 | 细胞系种类、培养条件、上清收集时间(16 h无血清培养)、外泌体分离离心参数 阅读提示:Methods 'Cell cultures'和'Isolation of exosomes from cell culture supernatants' |
| 巨噬细胞激活实验 | rBAG3浓度(6 μg/ml)、刺激时间(16-24 h)、检测指标(亚硝酸盐、IL-6、COX-2、iNOS)、抗BAG3 mAb浓度(320 μg/ml) 阅读提示:Figure 1图注和Results 'BAG3 is released from PDAC cells and activates macrophages' |
| IFITM-2沉默实验 | siRNA转染试剂(Transfectin)、转染后时间(48 h)、沉默效率验证(Western blot)、BAG3结合和IL-6释放检测 阅读提示:Figure 3图注和Methods 'Cell transfections' |
| 体内抗BAG3抗体治疗 | 小鼠品系和数量(PDX F1每组6只,同系每组10只,原位模型每组10只)、细胞接种数量(MIA PaCa-2 1×10^6,mt4-2D 0.25×10^6)、抗体剂量(20 mg/kg)和给药频率(每48 h)、肿瘤体积测量方法 阅读提示:Methods 'Animal studies'和图4图注 |
| 患者样本分析 | 患者数量(9例III期PDAC)、染色抗体(BAG3和CD68)、阳性判定标准(>50%肿瘤细胞阳性为高表达)、巨噬细胞计数方法(至少5个视野) 阅读提示:Figure 4f,g图注和Results 'Effect of BAG3 blocking on tumour growth and metastasis' |