体内脂肪表型分析
确定14-3-3ζ缺失或过表达对脂肪量和肥胖的影响
使用14-3-3ζ敲除小鼠和转基因过表达小鼠,通过DEXA体成分分析、脂肪垫称重、脂肪细胞形态学分析和代谢笼检测能量摄入与消耗
14-3-3ζ coordinates adipogenesis of visceral fat.
体内敲除与转基因小鼠模型、体外3T3-L1和3T3-F442A细胞模型、RNAi挽救实验、转录组及ChIP等多层级功能与机制验证
14-3-3ζ敲除小鼠(C57BL/6背景) 14-3-3ζ过表达转基因小鼠(CD1背景) 3T3-L1前脂肪细胞 3T3-F442A前脂肪细胞
14-3-3ζ敲除小鼠与野生型同窝对照的脂肪垫重量(性腺和肾周脂肪) 14-3-3ζ过表达转基因小鼠在高脂饮食(60%脂肪)8周后的体重和脂肪量 3T3-L1细胞中转染14-3-3ζ siRNA后的油红O染色和Pparγ蛋白丰度 14-3-3ζ敲低细胞中同时敲低p27Kip1或Gli3对脂肪生成的挽救 RNA-seq分析中FDR校正q<0.05的差异表达基因
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定14-3-3ζ缺失或过表达对脂肪量和肥胖的影响
使用14-3-3ζ敲除小鼠和转基因过表达小鼠,通过DEXA体成分分析、脂肪垫称重、脂肪细胞形态学分析和代谢笼检测能量摄入与消耗
确定14-3-3ζ亚型特异性在脂肪细胞分化中的作用
在3T3-L1和3T3-F442A前脂肪细胞中转染14-3-3各亚型特异性siRNA,用MDI诱导分化,油红O染色评估脂肪生成
探究14-3-3ζ调控C/EBP-δ蛋白丰度的机制
免疫印迹检测C/EBP-δ,免疫共沉淀检测相互作用,使用放线菌酮、MG132、epoxomicin、3-MA和氯喹处理细胞,核质分离检测亚细胞定位
鉴定14-3-3ζ下游转录组变化和细胞周期调控
对si14-3-3ζ转染的3T3-L1细胞进行RNA测序,流式细胞术分析细胞周期,检测Cdkn1b/p27Kip1表达
验证14-3-3ζ通过hedgehog/Gli3调控Cdkn1b启动子
使用Cdkn1b启动子荧光素酶报告基因、Shh-light2细胞检测Gli依赖转录活性、ChIP-qPCR检测Gli3结合,共转染si14-3-3ζ和siGli3或si-p27Kip1进行挽救实验
在体内验证14-3-3ζ缺失对胚胎脂肪前体细胞的影响
对e18.5胚胎切片进行Pref-1、Gli3和p27Kip1免疫荧光染色,观察脂肪前体细胞数量和蛋白表达
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 优泌乐胰岛素 | Eli Lilly | -- |
| OneTouch UltraMini血糖仪 | Life Scan | -- | |
| PIXImus小鼠密度仪 | Inside Outside Sales | -- | |
| PhenoMaster代谢笼 | TSE Systems | -- | |
| 细胞培养 | 14-3-3拮抗剂I,2-5 | EMD Millipore | -- |
| Lipofectamine RNAiMax转染试剂 | Life Technologies | -- | |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Life Technologies | -- | |
| 药物处理 | MG132 | Sigma-Aldrich | -- |
| 环氧霉素 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 3-甲基腺嘌呤 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 氯喹 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 罗格列酮 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 荧光素酶报告基因试验 | 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | -- |
| ChIP分析 | Pierce磁性ChIP试剂盒 | Thermo Scientific | -- |
| 免疫荧光 | Pref-1/DLK1抗体(C-19, sc-8624) | Santa Cruz | sc-8624 |
| Gli3抗体(H-280, sc-20688) | Santa Cruz | sc-20688 | |
| p27Kip1抗体(C-10, sc-528) | Santa Cruz | sc-528 | |
| LipidTOX深红染料 | Life Technologies | -- | |
| 流式细胞术 | LSR II-561流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| Western blot | 14-3-3ζ抗体(#7413) | Cell Signaling Technology | 7413 |
| C/EBP-α抗体(D56F10, #8178) | Cell Signaling Technology | 8178 | |
| C/EBP-β抗体(#3082) | Cell Signaling Technology | 3082 | |
| C/EBP-δ抗体(#2318) | Cell Signaling Technology | 2318 | |
| Foxo1抗体(L27, #9454) | Cell Signaling Technology | 9454 | |
| Lipin1抗体(#5195) | Cell Signaling Technology | 5195 | |
| Pparγ抗体(81B8, #2443) | Cell Signaling Technology | 2443 | |
| cleaved caspase-3抗体(5A1E, #9664) | Cell Signaling Technology | 9664 | |
| Pgc1-α抗体(#4259) | Cell Signaling Technology | 4259 | |
| 微管蛋白抗体(#2146) | Cell Signaling Technology | 2146 | |
| Lamin A/C抗体(4C11, #4777) | Cell Signaling Technology | 4777 | |
| p27Kip1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | -- | |
| Gli3抗体 | Santa Cruz Biotechnology | -- | |
| TAP抗体(CAB1001) | Thermo Scientific | CAB1001 | |
| Gli3抗体(PA5-28029) | Thermo Scientific | PA5-28029 | |
| β-actin抗体(AC-15, #NB600-501) | Novus Biologicals | NB600-501 | |
| RNA提取 | RNEasy试剂盒 | Qiagen | -- |
| 实时定量PCR | StepOnePlus实时PCR系统 | Life Technologies | -- |
| RNA测序 | HiSeq 2500测序仪 | Illumina | -- |
| 细胞培养 | SAG | Cayman Chemicals | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型与代谢表型 | 小鼠品系背景(14-3-3ζKO为C57BL/6,过表达为CD1)、年龄(如24周或52周)、高脂饮食成分(60%脂肪)和喂养时长(8或12周) 阅读提示:Methods中“Animal husbandry and metabolic analyses”小节及图1、2、9图注 |
| 体外脂肪细胞分化 | 细胞系(3T3-L1或3T3-F442A)、分化诱导 cocktail(MDI:172 nM胰岛素、500 μM IBMX、500 nM地塞米松)、siRNA转染试剂和分化时间(7或14天) 阅读提示:Methods中“Cell culture and transient transfections”小节及图3图注 |
| 自噬与蛋白稳定性实验 | 抑制剂浓度(放线菌酮10 μM、MG132 10 μM、epoxomicin 100 μM)、处理时间(48小时或最后24小时) 阅读提示:Methods中“Cell culture and transient transfections”小节及图4图注 |
| Gli3/p27Kip1通路挽救实验 | siRNA共转染方案(针对14-3-3ζ和p27Kip1或Gli3)、检测终点(Pparγ蛋白丰度或油红O染色) 阅读提示:图6、7图注及Results中对应段落 |
| 胚胎脂肪前体细胞分析 | 胚胎阶段(e18.5)、抗体稀释比例(1:100)、切片厚度(8 μm) 阅读提示:Methods中“Fluorescent microscopy and flow cytometry”小节及图8图注 |