建立脂滴负载与卸载模型
在 glycolytic 和 oxidative 条件下追踪脂滴中脂肪酸的代谢去向。
Vero细胞以油酸负载24小时形成脂滴,随后在含或不含葡萄糖的培养基中卸载16小时,检测乳酸产生、氧消耗、线粒体膜电位、脂滴含量及放射性脂肪酸去向。
AMPK activation promotes lipid droplet dispersion on detyrosinated microtubules to increase mitochondrial fatty acid oxidation.
多细胞模型体外实验,结合活细胞成像、电镜、流式、生化及siRNA/基因敲除功能验证
Vero细胞(非洲绿猴肾成纤维细胞) 小鼠胚胎成纤维细胞(MEF,野生型及AMPKα敲除) COS-1细胞 C2C12成肌细胞
Vero细胞以175 µg/ml油酸负载24小时形成脂滴,之后在含/不含葡萄糖培养基中卸载16小时 AMPKα敲除MEF与野生型MEF分别以200和400 µg/ml油酸负载以匹配脂滴水平,再无糖卸载16小时 使用15 µM Nocodazole解聚微管,或15 µM Parthenolide抑制去酪氨酸化,处理16小时或短时4小时 使用100 µM Etomoxir抑制脂肪酸氧化,500 µM DEUP抑制脂解,检测β-氧化和脂滴消耗
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
在 glycolytic 和 oxidative 条件下追踪脂滴中脂肪酸的代谢去向。
Vero细胞以油酸负载24小时形成脂滴,随后在含或不含葡萄糖的培养基中卸载16小时,检测乳酸产生、氧消耗、线粒体膜电位、脂滴含量及放射性脂肪酸去向。
分析营养剥夺对脂滴细胞内分布和运动性的影响。
活细胞共聚焦显微镜观察脂滴分布,视频显微镜记录1分钟内脂滴运动,使用Nocodazole处理检验微管依赖性。
验证脂滴分散是否增加与线粒体的接触并促进脂肪酸氧化。
共聚焦显微镜和电子显微镜观察脂滴-线粒体接触,流式细胞术检测脂滴含量,放射性CO2产生测定β-氧化。
检验去酪氨酸化微管在脂滴分散和β-氧化中的必要性。
免疫荧光和Western blot检测去酪氨酸化微管水平,使用Parthenolide抑制TCP,转染GFP-TTL降低去酪氨酸化,分析脂滴分散和β-氧化。
确定AMPK激活对脂滴分散、运动性和消耗的影响。
使用AMPK激活剂AICAR和Metformin处理负载细胞,使用抑制剂Compound C处理卸载细胞,比较野生型与AMPKα敲除MEF的脂滴分散和消耗。
检验AMPK是否通过去酪氨酸化微管促进脂滴分散。
AICAR或Metformin处理负载细胞,检测去酪氨酸化微管水平和分布;Parthenolide与AICAR共处理,分析脂滴分散。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 二乙基伞形酮磷酸酯 | Sigma-Aldrich | -- |
| 乙莫克舍 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 2-脱氧葡萄糖 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 化合物C | Sigma-Aldrich | -- | |
| 氨基咪唑-4-甲酰胺核糖核苷酸 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 小白菊内酯 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 巴弗洛霉素A1 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 5-(十四烷氧基)-2-呋喃甲酸 | Santa Cruz Biotechnology | -- | |
| 诺考达唑 | Calbiochem | -- | |
| 脂滴与细胞核染色 | 尼罗红 | Molecular Probes | -- |
| 细胞核染色 | Hoechst-33258 | Molecular Probes | -- |
| 线粒体染色 | 深红线粒体追踪剂 | Molecular Probes | -- |
| 细胞培养 | 胰蛋白酶/EDTA | Life Technologies | -- |
| 杜尔贝科改良 Eagle 培养基 | Biological Industries | -- | |
| 胎牛血清 | Biological Industries | -- | |
| L-谷氨酰胺 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 青霉素 | Biological Industries | -- | |
| 链霉素 | Biological Industries | -- | |
| 非必需氨基酸 | Biological Industries | -- | |
| 脂滴负载 | 油酸 | Sigma-Aldrich | -- |
| 无脂肪酸牛血清白蛋白 | Sigma | -- | |
| 放射性标记 | 14C-油酸 | PerkinElmer | NEC-317 |
| siRNA转染 | Lipofectamine RNAiMAX试剂 | Invitrogen | -- |
| 质粒转染 | Lipofectamine LTX | Life Technologies | -- |
| 高分辨率呼吸测定 | 寡霉素 | Sigma | -- |
| FCCP | Sigma | -- | |
| 流式细胞术 | 四甲基罗丹明 | Molecular Probes | -- |
| 膜联蛋白V-APC | BD Pharmigen | 550474 | |
| 碘化丙啶 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 免疫荧光 | 抗α-微管蛋白抗体 | Sigma | T9026 |
| 抗去酪氨酸化微管蛋白抗体 | Millipore | Ab3201 | |
| 抗ACSL3抗体 | Abnova | B01P | |
| 抗ATP合酶抗体 | BD Transduction Laboratories | 611450 | |
| Western blot | 抗LC3B抗体 | Cell Signaling | 2775 |
| 抗磷酸化ACC抗体 | Cell Signaling | 3661 | |
| 抗AMPKα亚基抗体 | Cell Signaling | 23A3 | |
| 抗磷酸化AMPK抗体 | Cell Signaling | 40H9 | |
| 抗TTL抗体 | Protein Tech | 14067-1-AP | |
| 抗TCP抗体 | Protein Tech | 13778-075 | |
| 抗肌动蛋白抗体 | Abcam | ab40864 | |
| 抗乙酰化α-微管蛋白抗体 | Abcam | ab24610 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 脂滴负载与卸载 | 油酸浓度175 µg/ml,负载24小时;卸载时间16小时,培养基含或不含葡萄糖 阅读提示:Methods: Reagents, Cell culture and treatments |
| AMPK敲除MEF脂滴负载匹配 | 野生型MEF负载400 µg/ml油酸,AMPKα敲除MEF负载200 µg/ml油酸,24小时 阅读提示:Results: AMPK activation promotes LD dispersion and consumption; Figure 5h,i |
| 微管解聚与去酪氨酸化抑制 | Nocodazole 15 µM处理16小时或4小时;Parthenolide 15 µM或25 µM处理16小时或8小时 阅读提示:Results: Nutrient deprivation promotes LD dispersion; A subset of MTs contributes to LD dispersion; Figure 2g,h; Figure 3 |
| 脂肪酸氧化与脂解抑制 | Etomoxir 100 µM,DEUP 500 µM,处理16小时 阅读提示:Results: LDs channel FAs to different metabolic fates; Figure 1g,h |
| β-氧化测定 | 14C-油酸标记12小时(70.62 µg/ml),再175 µg/ml油酸12小时;卸载16小时,捕获14C-CO2 阅读提示:Methods: FA beta-oxidation assay |