Cc2d2a基因敲除小鼠的构建与验证
建立Cc2d2a功能缺失的小鼠模型,验证基因敲除效率。
通过同源重组将Cc2d2a基因外显子6至8替换为含β-gal报告基因和新霉素选择盒的靶向载体,Southern blot和PCR验证正确整合,RT-PCR和免疫印迹验证转录本和蛋白缺失。
Ciliopathy-associated gene Cc2d2a promotes assembly of subdistal appendages on the mother centriole during cilia biogenesis.
包含基因敲除小鼠模型、MEFs细胞模型、免疫荧光、电镜、免疫电镜、微管再生等功能与机制验证
Cc2d2a-/-小鼠胚胎及组织 Cc2d2a-/-小鼠胚胎成纤维细胞(MEFs) 野生型与Cc2d2a-/-神经管及胚胎节点 IMCD3细胞及猴视网膜
Cc2d2a-/-小鼠基因型鉴定及CC2D2A蛋白缺失验证 MEFs血清饥饿诱导纤毛发生,约10%的Cc2d2a-/- MEFs逃避无纤毛表型 免疫荧光检测母中心粒标记(γ-tubulin、Arl13b、ninein、Odf2、trichoplein) 透射电镜观察亚远端附属物结构及微管锚定 微管再生实验:5 μM nocodazole处理1.5小时,再恢复0、5、30分钟检测微管星体形成
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立Cc2d2a功能缺失的小鼠模型,验证基因敲除效率。
通过同源重组将Cc2d2a基因外显子6至8替换为含β-gal报告基因和新霉素选择盒的靶向载体,Southern blot和PCR验证正确整合,RT-PCR和免疫印迹验证转录本和蛋白缺失。
确定Cc2d2a缺失导致的胚胎发育缺陷及组织学表型。
对E14、E16、E18胚胎及P0新生鼠进行基因型统计,观察大体形态、内脏位置、组织学及视网膜电图等。
验证Cc2d2a缺失对运动纤毛和感觉纤毛发生的影响。
扫描电镜观察E8胚胎节点,免疫荧光染色检测乙酰化α-tubulin标记的纤毛在胚胎节点、耳蜗、肝脏、肾脏和气管中的分布。
探究神经管缺陷是否与纤毛介导的Shh信号异常相关。
免疫荧光染色检测E12神经管中Shh、Olig2、Nkx2.2、Nkx6.1、Pax6、Pax7、HB9、Msx2等标记物的表达模式。
在细胞水平解析Cc2d2a缺失对纤毛发生和母中心粒结构的影响。
分离E12.5-E13.5胚胎成纤维细胞,血清饥饿诱导纤毛发生,免疫荧光检测Arl13b、γ-tubulin、ninein、Odf2、trichoplein、Rab8a等,透射电镜观察亚远端附属物超微结构。
验证CC2D2A是否参与母中心粒微管锚定。
使用nocodazole解聚微管后恢复,免疫荧光检测α-tubulin和γ-tubulin,观察微管星体形成。
确定CC2D2A在母中心粒的精细定位。
在IMCD3细胞和猴视网膜中进行免疫荧光和免疫电镜,使用抗CC2D2A抗体及10 nm金颗粒标记。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫荧光 | 抗乙酰化α-微管蛋白抗体 | Sigma | T6793 |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Sigma | T6199 | |
| 抗γ-微管蛋白抗体 | Sigma | T6557 | |
| 抗GT335抗体 | Adipogen | AG-20B-0020 | |
| 抗Arl13b抗体 | Proteintech | 17711-1-AP | |
| 抗Rab8a抗体 | Proteintech | 55296-1-AP | |
| 抗pericentrin抗体 | Abcam | ab448 | |
| 抗Olig2抗体 | R&D | AF2418 | |
| 抗CC2D2A抗体 | custom made | -- | |
| 抗trichoplein抗体 | Masaki Inagaki | -- | |
| 抗人cenexin (ODF2)抗体 | Kyung Lee | -- | |
| 抗ninein-L77和-L79抗体 | Michel Bornens | -- | |
| 抗rootletin6抗体 | Tiansen Li | -- | |
| 抗RPGR-S3抗体 | Tiansen Li | -- | |
| Alexa Fluor 488荧光染料 | Molecular Probes | -- | |
| Alexa Fluor 568荧光染料 | Molecular Probes | -- | |
| 微管再生实验 | 诺考达唑 | Sigma | -- |
| qRT-PCR | TaqMan检测试剂盒 | Applied Biosystems | Mm01211431_m1 |
| 细胞培养 | 腔室载玻片 | ibidi | -- |
| 流式细胞术 | 碘化丙啶 | -- | -- |
| 流式细胞仪 | BD Bioscience | -- | |
| 扫描电镜 | EMITECH K575高分辨镀膜仪 | EMITECH | -- |
| S-3000N扫描电子显微镜 | Hitachi | -- | |
| 透射电镜 | Leica UCT超薄切片机 | Leica | -- |
| H-7600透射电子显微镜 | Hitachi | -- | |
| 免疫电镜 | LR White树脂 | -- | -- |
| 山羊抗兔10 nm金标记二抗 | -- | -- | |
| 显微成像 | LSM 700共聚焦显微镜 | Zeiss | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| Cc2d2a基因敲除小鼠构建 | 敲除策略:替换外显子6-8;Southern blot探针:外显子5-6;验证方法:Southern blot、RT-PCR、免疫印迹 阅读提示:Methods 'Generation of Cc2d2a-/- mice and MEFs for phenotyping'及Figure 1a-d |
| MEFs纤毛发生诱导 | 细胞接种密度:每孔70,000个MEFs;培养基体积:300 μl;诱导条件:无血清培养基培养48小时;固定:4%多聚甲醛15分钟 阅读提示:Methods 'Generation of Cc2d2a-/- mice and MEFs for phenotyping' |
| 微管再生实验 | nocodazole浓度:5 μM;处理时间:1.5小时;恢复时间点:0、5、30分钟;固定:100%甲醇3分钟 阅读提示:Methods 'Microtubule regrowth assay'及Figure 6 |
| 免疫荧光抗体稀释比例 | 一抗稀释比例:抗CC2D2A 1:300,抗乙酰化α-tubulin 1:500,抗γ-tubulin 1:500,抗Arl13b 1:500,抗Odf2 1:50,抗ninein 1:2500,抗Rab8a 1:250,抗pericentrin 1:500等;二抗:Alexa Fluor 488/568 阅读提示:Methods 'Antibodies' |
| 透射电镜样品制备 | 切片厚度:80 nm;铜网:200目;染色:醋酸铀和柠檬酸铅 阅读提示:Methods 'Transmission Electron Microscopy (TEM) and Immuno EM' |
| 免疫电镜 | 金颗粒大小:10 nm;一抗稀释:抗CC2D2A 1:100;包埋树脂:LR White;切片厚度:90-100 nm 阅读提示:Methods 'Post embedding Immuno EM'及'Post embedding immunolabeling of monkey photoreceptors' |