细胞模型的建立与表征
获得潜伏脑转移细胞并验证其代谢和线粒体特征。
通过体内表型筛选从HCC1954和SKBR3细胞中分离Lat细胞,并检测其脂肪酸代谢基因表达、脂质含量和线粒体形态。
Limiting mitochondrial plasticity by targeting DRP1 induces metabolic reprogramming and reduces breast cancer brain metastases
包含体外细胞模型、体内动物模型、患者样本分析及功能验证(DRP1敲低和药理学抑制)和机制验证(代谢示踪)。
HCC1954 HER2+乳腺癌细胞系(Pa、Lat、M-BM) SKBR3 HER2+乳腺癌细胞系(Pa、Lat、M-BM) 雌性无胸腺裸鼠(Hsd: athymic nude mice-Foxn1nu)脑转移模型 HER2+乳腺癌患者配对原发肿瘤和异时性脑转移样本
DRP1和p-DRP1S616在Lat和M-BM细胞中的表达水平 线粒体形态(管状、中间、点状)的分布 13C16棕榈酸示踪中FAO相关代谢物(柠檬酸、谷氨酸、苹果酸、GSH、GSSG)的M+2同位素富集 DRP1或CPT1A敲低后对肿瘤球形成和脑转移的影响 Mdivi-1(40 mg/kg)口服给药对脑转移负担的效果
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得潜伏脑转移细胞并验证其代谢和线粒体特征。
通过体内表型筛选从HCC1954和SKBR3细胞中分离Lat细胞,并检测其脂肪酸代谢基因表达、脂质含量和线粒体形态。
验证Lat细胞是否从星形胶质细胞摄取脂肪酸并以脂滴形式储存。
将BODIPY-C12标记的星形胶质细胞与癌细胞共培养,观察脂滴转移;检测Lat细胞对脂肪酸处理的反应。
检测Lat细胞中脂肪酸氧化及其对氧化还原平衡的影响。
使用14C-棕榈酸和13C16-棕榈酸进行示踪,检测FAO速率、TCA循环中间体富集和谷胱甘肽水平;测量ROS水平。
验证DRP1和CPT1A在FAO和线粒体动态中的必要性。
通过dox诱导shRNA敲低DRP1或CPT1A,观察线粒体形态、脂滴积累、FAO、ROS、细胞活力和肿瘤球形成的变化。
评估DRP1或CPT1A缺失对脑转移的影响。
将对照和敲低细胞心内注射入小鼠,通过dox饮食诱导敲低,通过IHC和生物发光成像评估脑转移负担。
验证DRP1抑制剂Mdivi-1对脑转移的治疗效果。
对荷瘤小鼠口服Mdivi-1(40 mg/kg)每天一次共4周,评估脑转移负担和体重的变化。
验证p-DRP1S616在人类异时性脑转移中的表达。
对HER2+乳腺癌患者匹配的原发肿瘤和脑转移样本进行IHC染色,评估p-DRP1S616表达水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Sigma-Aldrich | R8758 |
| DMEM高糖培养基 | Sigma-Aldrich | D6429 | |
| 胎牛血清 | Thermo Fisher Scientific | 10437028 | |
| 青霉素-链霉素 | Sigma-Aldrich | P0781 | |
| 星形胶质细胞生长添加物 | ScienCell Research Laboratories | 1852 | |
| 牛血清白蛋白 | Sigma-Aldrich | A6003 | |
| 棕榈酸钠 | Sigma-Aldrich | P9767 | |
| 脂肪酸摄取实验 | BODIPY-558/568-C12 | Thermo Fisher Scientific | D3835 |
| 细胞追踪 | 绿色细胞追踪染料 | Thermo Fisher Scientific | C7025 |
| 线粒体染色 | MitoTracker Deep Red FM | Thermo Fisher Scientific | M22426 |
| ROS检测 | CellROX Deep Red试剂 | Thermo Fisher Scientific | C10422 |
| 细胞凋亡检测 | APC Annexin V | BioLegend | 640932 |
| Caspase-3活性检测试剂盒 | Abcam | ab39401 | |
| 细胞活性检测 | MTT | Sigma-Aldrich | M5655 |
| CellTiter-Glo发光细胞活力测定试剂盒 | Promega | G9241 | |
| 脂滴染色 | 尼罗红 | -- | -- |
| 油红O | -- | -- | |
| Western blot | West Femto Super Signal底物 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 免疫组织化学 | 抗GFAP抗体 | -- | -- |
| 抗磷酸化DRP1S616抗体 | Cell Signaling Technology | 4494 | |
| 核染色 | Hoechst 33342 | Thermo Fisher Scientific | 62249 |
| 动物实验 | 多西环素 | Sigma-Aldrich | 3072 |
| Mdivi-1 | Selleckchem | S7162 | |
| 抗asialo-GM1多克隆抗体 | FUJIFILM Wako Shibayagi | 986-10001 | |
| 同位素示踪 | 13C16棕榈酸 | Cambridge Isotope Laboratories | CLM-6059 |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Biological Industries | 01-101-1A |
| 病毒包装 | Lipofectamine 3000 | Invitrogen | -- |
| PEG-it病毒沉淀溶液 | System Biosciences | LV810A-1 | |
| 透射电镜 | Tecnai G2 Spirit透射电镜 | FEI | -- |
| 成像 | Nikon CSU-W1转盘共聚焦显微镜 | Nikon | -- |
| IncuCyte3成像系统 | -- | -- | |
| EVOS荧光显微镜 | -- | -- | |
| 流式细胞术 | FACSCalibur流式细胞仪 | Becton Dickinson | -- |
| GC-MS | Agilent 7890/5975C气相色谱-质谱联用仪 | Agilent | -- |
| LC-MS | Orbitrap Fusion Lumos质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Ultimate 3000 RSLC-Nano液相色谱系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 小动物成像 | AMI-HTX小动物成像仪 | -- | -- |
| FAO测定 | MicroBeta2微孔板计数器 | PerkinElmer | -- |
| 分析软件 | FlowJo v10软件 | -- | -- |
| BD FACSDiva v9.0.1软件 | -- | -- | |
| MassHunter v.B08软件 | Agilent | -- | |
| Image Lab v6.1软件 | Bio-Rad | -- | |
| Proteome Discoverer v2.4 SP1软件 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 统计软件 | GraphPad Prism 9统计软件 | GraphPad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基、血清浓度、培养条件和传代比例 阅读提示:Methods: Cell lines |
| 脂肪酸摄取实验 | BODIPY-C12浓度、标记时间、共培养时间、细胞密度 阅读提示:Methods: BODIPY-558/568-C12 transfer assays; Figure 1 legends |
| 代谢示踪 | 13C16-棕榈酸浓度、处理时间、样本制备方法 阅读提示:Methods: In vitro 13C16 palmitic acid tracing; Figure 2 legends |
| 功能缺失实验 | shRNA序列、诱导条件(dox浓度)、处理时间 阅读提示:Methods: Virus production and infection; Figure 3 legends |
| 体内实验 | 细胞注射数量、注射方式、dox饮食开始时间、肿瘤负荷评估时间点 阅读提示:Methods: Intracardiac injections and in vivo mice studies; Figure 4 legends |
| 药理学抑制 | Mdivi-1剂量、给药方式、给药频率和持续时间 阅读提示:Methods: Mdivi-1 oral gavage; Figure 6 legends |