oskar核糖核蛋白颗粒的液-固相变对其在果蝇胚胎发育中的功能至关重要

Liquid-to-solid phase transition of oskar ribonucleoprotein granules is essential for their function in Drosophila embryonic development.

作者信息Mainak Bose, Marko Lampe, Julia Mahamid, Anne Ephrussi
PMID35325593
期刊Cell
发布时间2022-04-14
DOI10.1016/j.cell.2022.02.022

实验完整度

高

体外纯化蛋白凝聚物、细胞系、果蝇活体成像、转基因果蝇及胚胎表型多层级验证,含功能与机制验证

主要模型

果蝇卵母细胞及卵房 体外纯化oskar 3′UTR与Bruno/Hrp48/PTB凝聚物 果蝇S2R+细胞 转基因果蝇胚胎

重点核对

oskar 3′UTR与Bruno或Hrp48在150 mM NaCl条件下形成凝聚物,FRAP显示Bruno不可动部分大、Hrp48居中 Bruno ΔN或Hrp48 ΔC转基因在相应缺陷背景中的表型拯救程度 FUS LC系连oskar mRNA后颗粒材料性质改变及后极定位缺陷 1,6-己二醇处理15 min及秋水仙素处理100 μg/ml 2 h对颗粒的影响 胚胎孵化率、极细胞数目及Eve条纹和腹节图式

摘要

oskar核糖核蛋白(RNP)颗粒不对称定位于卵母细胞后极,对果蝇胚胎的腹部图式形成和生殖细胞形成至关重要。我们证明卵母细胞中的oskar RNP颗粒是具有类固体物理性质的凝聚物。利用纯化的oskar RNA和支架蛋白Bruno与Hrp48,我们在体外证实oskar颗粒经历液-固相变。液相允许RNA掺入,而固相阻止额外RNA的掺入,同时允许客户蛋白以RNA依赖的方式分配。对支架颗粒蛋白进行遗传修饰或将人肉瘤融合蛋白(FUS)的内在无序区系连到oskar mRNA上,可以在体内调节颗粒的材料性质。由此产生的类液体性质损害了oskar的定位和翻译,对胚胎发育造成严重影响。我们的研究反映了生理性相变如何塑造RNA-蛋白凝聚物,以调控一种指导生殖细胞形成的母源RNA的定位和表达。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
oskar RNP颗粒的物理性质及其液-固相变如何影响oskar mRNA的定位、翻译和胚胎发育?
核心机制
oskar RNP颗粒通过液-固相变成熟为类固体凝聚物;液相允许RNA掺入,固相阻止额外RNA进入但允许客户蛋白以RNA依赖方式分配。
主要证据
体外纯化oskar 3′UTR与Bruno/Hrp48形成球形凝聚物,FRAP和cryo-ET显示快速固化;体内STED、活体成像及FUS LC系连实验显示改变材料性质损害oskar定位和翻译。
研究意义
研究揭示生理性相变塑造RNA-蛋白凝聚物,调控指导生殖细胞形成的母源RNA的定位和表达。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

体内oskar颗粒物理性质表征

确定卵母细胞中oskar RNP颗粒是否为液体或固体样凝聚物

对w1118卵房进行smFISH和3D STED成像,测量颗粒球形度和大小;活体成像观察颗粒融合;1,6-己二醇处理和卵质挤出实验检测颗粒溶解性

2

体外最小oskar RNP凝聚物重构与相变分析

验证纯化oskar RNA与支架蛋白能否在体外形成凝聚物并发生液-固相变

从昆虫细胞纯化EGFP标记的Bruno、Hrp48和mRFP-PTB,与体外转录的oskar 3′UTR混合,通过EMSA、FRAP、cryo-ET检测结合、动态性和结构

3

液相与固相选择性通透性验证

检验液相是否允许RNA掺入、固相是否排除RNA但允许蛋白分配

在Bruno-oskar 3′UTR凝聚物组装后0或30 min加入荧光标记oskar 3′UTR或mRFP-PTB,共聚焦成像和cryo-ET观察RNA和蛋白分布

4

支架蛋白PrLD在颗粒组装中的功能验证

确定Bruno和Hrp48的PrLD对oskar颗粒形成、定位和翻译的影响

在果蝇生殖系表达Bruno FL/ΔN或Hrp48 FL/ΔC转基因,结合smFISH、免疫染色和EMSA检测oskar颗粒形态、定位、翻译及蛋白结合能力

5

FUS LC系连改变颗粒材料性质

测试将oskar颗粒推向更液态是否影响其定位和翻译

表达MCP-EGFP-FUS LC或MCP-EGFP-FUS LC 12E系连oskar6xMS2 mRNA,活体成像、smFISH和免疫染色检测颗粒动态、定位及Oskar蛋白

6

胚胎发育后果评估

评估颗粒材料性质改变对生殖细胞形成和腹部图式的影响

对胚胎进行Vasa免疫染色计数极细胞、Eve免疫染色观察条纹、角质层制备分析腹节及孵化率统计

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
1,6-己二醇Sigma240117
秋水仙碱SigmaC9754
胰岛素SigmaI9278
胎牛血清Life Technologies10082147
Schneider果蝇培养基Life Technologies21720024
SumoStar蛋白酶Life Sensors4110
聚乙二醇4000Thermo ScientificEL0011
MEGAscript T7转录试剂盒Thermo ScientificAMB13345
StrepTrap HP层析柱MerckGE28-9075-47
HisTrap HP层析柱MerckGE17-5248-01
HiLoad 16/600 Superdex 200pg凝胶过滤柱MerckGE28-9893-35
Effectene转染试剂Qiagen301425
X-tremeGENE HP DNA转染试剂Roche06 366 236 001
兔抗EGFP抗体Torrey Pines BiolabsTP401
兔抗组蛋白H3抗体Abcamab1791
四甲基罗丹明标记牛血清白蛋白Thermo ScientificA23016

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
体外相分离实验
蛋白浓度10 μM、oskar 3′UTR浓度100 nM、缓冲液150 mM NaCl、SumoStar蛋白酶1 U/20 μl 30 min
阅读提示:STAR Methods中In vitro phase separation assays及Figure 2、Figure S3图注
FRAP分析
感兴趣区1.4-1.5 μm²、漂白100%激光功率、记录至1 min(帧间隔0.35 s)或3 min(帧间隔2 s)
阅读提示:STAR Methods中Fluorescence recovery after photobleaching及Figure 2D、S3H、S3I
1,6-己二醇处理
5% 1,6-己二醇处理15 min,溶剂对照为水
阅读提示:STAR Methods中Ex vivo treatments of whole ovaries及Figure 1C、S1B
秋水仙素处理
100 μg/ml秋水仙素处理2 h,溶剂对照为100%乙醇,成像在90 min时进行
阅读提示:STAR Methods中Ex vivo treatments of whole ovaries及Figure 6E、S7E
FUS LC系连实验
oskar6xMS2转基因、MCP-EGFP-FUS LC或12E表达、oskar RNA-null背景oskA87/Df3RpXT103
阅读提示:STAR Methods中Generation of transgenic flies及Figure 6、Figure 7