建立牙周炎联合DSS结肠炎模型
验证口腔炎症是否加剧肠道炎症
丝线结扎上颌磨牙诱导牙周炎,14天后给予DSS诱导结肠炎,检测体重、DAI、组织学、细胞因子及CyTOF免疫图谱
The Intermucosal Connection between the Mouth and Gut in Commensal Pathobiont-Driven Colitis.
含体外巨噬细胞、类器官、悉生/SPF小鼠模型、基因敲除、Kaede追踪和联体共生等多层证据及功能机制验证
丝线诱导牙周炎小鼠模型 DSS诱导结肠炎小鼠模型 悉生/germ-free Il10−/−小鼠口服菌群定植模型 Kaede转基因小鼠与联体共生小鼠
牙周炎模型:上颌磨牙间丝线结扎持续14天,对照为结扎3小时 DSS处理:丝线结扎后第14天给予1.5% DSS 5天,随后普通水2天,第7天处死 合成菌群定植:sHOM由3株、sLOM由5株组成,每株109 CFU,定植56天 K. aerogenes SK431经口给予109 CFU/天,联合DSS 2.0% 5天 Anakinra 50 mg/kg/天腹腔注射以阻断IL-1R信号
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证口腔炎症是否加剧肠道炎症
丝线结扎上颌磨牙诱导牙周炎,14天后给予DSS诱导结肠炎,检测体重、DAI、组织学、细胞因子及CyTOF免疫图谱
明确牙周炎是否导致口腔与肠道中特定致病菌共同富集
16S rRNA测序分析口腔和粪便菌群,LEfSe分析差异菌群,qPCR定量Klebsiella/Enterobacter丰度
验证口腔致病菌能否在易感宿主中诱发结肠炎
将HOM/LOM及sHOM/sLOM定植GF Il10−/−小鼠,监测体重、粪便Lcn2、组织学和Th1/Th17
明确口腔致病菌促结肠炎是否依赖巨噬细胞炎症小体和IL-1β
检测结肠炎症小体相关基因,流式鉴定IL-1β产生细胞,anakinra阻断实验,BMDM/LP细胞与菌共培养,炎症小体敲除小鼠实验
验证牙周炎是否在口腔产生致病菌特异性Th17细胞并可迁移至肠道致病
检测cLN中TEM及Th17表型,细菌抗原刺激实验,过继转移口腔TEM至sHOM/sLOM定植Rag1−/−小鼠,Kaede光转换追踪,联体共生模型
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| DSS诱导结肠炎 | 葡聚糖硫酸钠 | MP Biomedical | 0216011090 |
| 葡聚糖硫酸钠 | Cayman | 23250 | |
| 细菌共培养 | 庆大霉素 | Thermo Fisher Scientific | 15750060 |
| IL-1信号阻断 | 阿那白滞素(IL-1受体拮抗剂) | Swedish Orphan Biovitrum AB | 48899 |
| 树突状细胞培养 | 重组小鼠GM-CSF | Biolegend | 576304 |
| 结肠类器官培养 | 人IV型胶原蛋白 | Sigma | C5533 |
| 组织消化 | 3型胶原酶 | Worthington | LS004185 |
| DNase I | Worthington | LS006342 | |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Thermo Fisher Scientific | 21870076 |
| 类器官培养 | Advanced DMEM/F12培养基 | Thermo Fisher Scientific | 12634010 |
| 细胞分离 | Hank平衡盐溶液 | Thermo Fisher Scientific | 14170112 |
| 细胞培养 | 青霉素-链霉素 | Thermo Fisher Scientific | 15140122 |
| 组织消化 | 二硫苏糖醇 | Sigma | D0632 |
| 0.5M EDTA(pH 8.0) | Promega | PR-V4231 | |
| 淋巴细胞分离 | Percoll分离液 | GE Healthcare | 17-0891-01 |
| 细菌分离培养 | 麦康凯琼脂 | SIGMA | M7408 |
| 细胞培养 | 胎牛血清 | gibco | 16000-044 |
| CyTOF分析 | Cell-ID顺铂活性染料 | Fluidigm | 201064 |
| 流式分析 | Fc受体封闭剂 | Biolegend | 101320 |
| 动物镇痛 | 卡洛芬 | Zoetis | RXRIM-INJ |
| 动物麻醉 | 异氟烷 | Fluriso | 13985-528-40 |
| qPCR | PCR预混液 | Promega | M7502 |
| RNA提取 | E.Z.N.A.总RNA提取试剂盒I | OMEGA | SKU: R6834-01 |
| DNA提取 | DNeasy血液与组织DNA提取试剂盒 | QIAGEN | 69506 |
| CD4+ T细胞分离 | EasySep小鼠CD4+ T细胞分离试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | NC0471206 |
| 细胞分选 | EasySep小鼠生物素阳性选择试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | NC0845277 |
| 核内染色 | eBioscience Foxp3/转录因子染色缓冲液套装 | Thermo Fisher Scientific | 00-5523-00 |
| 流式染色 | 固定与透化溶液 | BD | 554722 |
| 类器官制备 | 细胞回收液 | Corning | 354253 |
| 细胞刺激 | 高尔基体阻断剂 | BDB555029 | BDB555029 |
| cDNA合成 | 高容量RNA-to-cDNA试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 4387406 |
| qPCR | SYBR Green PCR预混液 | Thermo Fisher Scientific | 4309155 |
| 小鼠品系 | C57BL/6小鼠 | The Jackson Laboratory | JAX 000664 |
| Rag1−/−小鼠 | The Jackson Laboratory | JAX 002216 | |
| Il10−/−小鼠 | The Jackson Laboratory | JAX 002251 | |
| CD45.1小鼠 | The Jackson Laboratory | JAX 002014 | |
| Il17a-EGFP小鼠 | The Jackson Laboratory | JAX 018472 | |
| Kaede小鼠 | The RIKEN BioResource Research Center | RBRC05737 | |
| Il1r−/−小鼠 | The Jackson Laboratory | JAX 003245 | |
| Nlrp3−/−小鼠 | The Jackson Laboratory | JAX 021302 | |
| 细胞系 | T84人结直肠癌细胞系 | ATCC | ATCC CCL-248 |
| 组织研磨 | Mini-BeadBeater-16组织研磨仪 | Thermo Fisher Scientific | NC0342321 |
| 细菌DNA提取 | 石榴石研磨珠(0.7 mm) | QIAGEN | 13123-50 |
| Kaede光转换 | 准直二极管激光系统 | Laserglow Technologies | LRD-0405 |
| 质谱流式 | CyTOF Helios系统 | Fluidigm | -- |
| 全基因组测序 | Illumina MiSeq(500v2)测序平台 | Illumina | -- |
| 流式分选 | FACSAria II流式细胞分选仪 | BD | -- |
| 流式分析 | LSRFortessa流式细胞仪 | BD | -- |
| FACSCelesta流式细胞仪 | BD | -- | |
| 手术缝合 | BD Autoclip伤口闭合系统 | Thermo Fisher Scientific | 22-275998 |
| 伤口夹 | Thermo Fisher Scientific | 01-804-5 | |
| 丝线结扎 | Roboz Surgical 5-0黑色丝线 | Thermo Fisher Scientific | NC9422522 |
| 手术缝合 | Ethilon 5-0尼龙缝合线 | Ethicon | 6544169 |
| 动物备皮 | Veet脱毛膏 | Reckitt Benckiser Parsippany (Walmart) | 46280011302 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 牙周炎模型建立 | 丝线类型(100 μm直径)、结扎位置(上颌第一与第二磨牙间)、持续时间(14天或3 h对照)、麻醉剂组合 阅读提示:Methods中Experimental periodontitis model小节及Figure S1 |
| DSS诱导结肠炎 | DSS浓度与批号(1.5%或2.0%)、给药天数、饮水恢复天数、处死时间点 阅读提示:Methods中Dextran sulfate sodium (DSS)–induced colitis model小节及Figure 1A、Figure 4I图注 |
| 口腔菌群定植悉生小鼠 | LOM定义为14天结扎、HOM为3小时结扎、sHOM/sLOM菌株组成与每株109 CFU、定植时长56天 阅读提示:Methods中IL-10–deficient colitis model小节及Figure 3F图注 |
| 炎症小体–IL-1β阻断实验 | anakinra剂量50 mg/kg、给药途径(i.p.)、给药频率及与DSS/K. aerogenes的时序 阅读提示:Figure 4E和4I图注、Figure 6L图注及Methods相关段落 |
| T细胞过继转移 | TEM细胞表型门控(CD3+CD4+CD44hiCD62LloCD25−)、转移细胞数2×105/小鼠、转移途径、观察时长8周 阅读提示:Methods中T cell transfer colitis model小节及Figure 5I图注 |
| Kaede光转换追踪 | 紫光波长405 nm、照射时长1分钟、光转换时间点相对于结扎和DSS的时间安排 阅读提示:Methods中Kaede photoconversion小节及Figure 6B图注 |
| 联体共生模型 | CD45.2结扎14天与CD45.1连接、术后恢复1周、DSS 100 mg/次与K. aerogenes 109 CFU经口连续6天、仅处理CD45.1受体 阅读提示:Methods中Parabiosis model小节及Figure 7A图注 |