前脂肪细胞纤毛的体外和体内特征鉴定
确认前脂肪细胞在体外和体内是否具有初级纤毛,并定位其组织分布。
免疫荧光染色3T3-L1细胞、小鼠和人原代前脂肪细胞;使用cilia glow小鼠全组织成像观察附睾白色脂肪组织中纤毛化血管周围细胞;BrdU掺入评估HFD激活。
Omega-3 Fatty Acids Activate Ciliary FFAR4 to Control Adipogenesis.
包含体外细胞系、原代细胞、体内小鼠模型和组学分析,并进行了功能验证和机制验证
3T3-L1前脂肪细胞系 小鼠原代前脂肪细胞 人原代前脂肪细胞 Pdgfrα-CreERT Ift88条件敲除小鼠
前脂肪细胞纤毛的条件性消除使用Pdgfrα-CreERT Ift88flox/−小鼠,他莫昔芬3周龄灌胃200–250 mg/kg连续两天 DHA cocktail成分为0.4μg/ml胰岛素、0.02mM IBMX、0.1μM Dex、100μM DHA,处理分化前2天 FFAR4激动剂TUG891体内实验为9周龄雄性C57Bl/6J小鼠每日腹腔注射35 mg/kg,持续2周后结合60% HFD 3个月 ciliary cAMP检测使用cilia-targeted cADDis BacMam传感器,FFAR4激动剂加入后每10秒成像监测5分钟 ATAC-seq使用100μM DHA或1μM Dex处理4小时,每组两个重复
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认前脂肪细胞在体外和体内是否具有初级纤毛,并定位其组织分布。
免疫荧光染色3T3-L1细胞、小鼠和人原代前脂肪细胞;使用cilia glow小鼠全组织成像观察附睾白色脂肪组织中纤毛化血管周围细胞;BrdU掺入评估HFD激活。
验证前脂肪细胞纤毛对白色脂肪组织扩张和脂肪生成是否必需。
使用Pdgfrα-CreERT条件性敲除Ift88消除前脂肪细胞纤毛,监测体重、脂肪质量、瘦素水平、脂肪细胞大小和谱系追踪EYFP+脂肪细胞。
鉴定前脂肪细胞纤毛中调控脂肪生成的GPCR。
构建候选GPCR-GFP融合蛋白筛选纤毛定位;免疫荧光验证内源性FFAR4在3T3-L1、小鼠和人原代前脂肪细胞及体内血管周围细胞纤毛中的定位;TULP3敲除验证纤毛转运依赖性。
验证DHA和FFAR4激动剂是否通过FFAR4促进脂肪生成。
在3T3-L1、小鼠原代前脂肪细胞和人原代前脂肪细胞中,用DHA cocktail、FFAR4激动剂TUG891或FFAR1激动剂TUG424处理,结合FFAR4拮抗剂AH7614、TULP3或FFAR4敲除,评估Oil Red O染色和BODIPY荧光。
验证FFAR4激动剂体内处理是否促进饮食诱导的肥胖。
9周龄雄性C57Bl/6J小鼠每日腹腔注射TUG891或DMSO载体2周,第二周开始60% HFD或对照饮食3个月,监测体重。
验证FFAR4激活是否通过升高纤毛cAMP和EPAC信号启动脂肪生成。
使用纤毛靶向cAMP传感器cADDIS活细胞成像检测TUG-891刺激后纤毛cAMP变化;EdU掺入检测细胞周期再进入;使用EPAC抑制剂ESI-09和PKA抑制剂Rp-cAMPs处理分化细胞。
验证DHA/FFAR4是否通过CTCF介导染色质重塑激活PPARγ和CEBPα。
RNA-seq比较历史DM、DHA cocktail和对照cocktail处理24小时的3T3-L1细胞;ATAC-seq分析DHA或Dex处理4小时后的染色质可及性和转录因子motif;CTCF敲除细胞验证脂肪生成和脂肪基因表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 牛小牛血清 | -- | -- |
| GlutaMAX添加剂 | -- | -- | |
| 前脂肪细胞生长培养基 | PromoCell | -- | |
| 前脂肪细胞分化培养基 | PromoCell | -- | |
| 脂肪细胞营养培养基 | PromoCell | -- | |
| 药物处理 | 二十二碳六烯酸 | -- | -- |
| TUG891 | -- | -- | |
| TUG424 | -- | -- | |
| AH7614 | -- | -- | |
| T0070907 | -- | -- | |
| ESI-09 | -- | -- | |
| Rp-cAMPs | -- | -- | |
| 棕榈酸 | -- | -- | |
| 油酸 | -- | -- | |
| 他莫昔芬 | Sigma | T-5648 | |
| 地塞米松 | -- | -- | |
| IBMX | -- | -- | |
| 胰岛素 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | Pericentrin抗体 | Covance | PRB-432C |
| 乙酰化微管蛋白抗体 | Sigma | T7451 | |
| CEP170抗体 | Thermo | 41-3200 | |
| ARL13B抗体 | UC Davis/NIH NeuroMab Facility | 73-287 | |
| FFAR4抗体 | Yenzym | -- | |
| FFAR4抗体 | Santa Cruz | sc-390752 | |
| FGFR1OP抗体 | Novus | H00011116-M01 | |
| GFP抗体 | Invitrogen | A10262 | |
| 全组织染色 | CD31抗体 | BD | 553370 |
| BrdU抗体 | Cell Signaling | 5292 | |
| PDGFRα抗体 | R&D Systems | AF1062 | |
| ARL13B抗体 | Proteintech | 17711-1-AP | |
| LipidTox脂滴染料 | Invitrogen | H34475 | |
| 流式细胞术 | CD45 PE-Cy7抗体 | eBioscience | 250451-81 |
| CD31 PE-Cy7抗体 | eBioscience | 25-0311-81 | |
| TER119 PE-Cy7抗体 | eBioscience | 25-5921-81 | |
| CD34 Alexa Fluor 700抗体 | eBioscience | 56-0341-82 | |
| CD29 APC抗体 | eBioscience | 17-0291-80 | |
| SCA1 Pacific Blue抗体 | Biolegend | 108120 | |
| 原代前脂肪细胞分离 | II型胶原酶 | Sigma | C6885 |
| DNA酶 | Worthington | LS006344 | |
| 泊洛沙姆188 | Sigma | P5556 | |
| 含Earle盐的Medium 199 | Sigma | M4530 | |
| Histopaq-1077分离液 | Sigma | 10771 | |
| 抗CD45磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-052-301 | |
| 抗TER119磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-049-901 | |
| 腺病毒GFP或GFP-Cre | Vector BioLabs | 1060, 1700 | |
| Western blot | NuPage Novex 4–12% Bis-Tris蛋白凝胶 | Thermo Fisher Scientific | WG1402BOX |
| 硝酸纤维素膜 | Life Technologies | LC2001 | |
| Odyssey封闭缓冲液 | LI-COR | NC9232238 | |
| TULP3抗体 | Yenzym | -- | |
| PPARγ抗体 | Cell Signaling | 2435 | |
| 微管蛋白抗体 | Sigma | 9026 | |
| CEBPα抗体 | Cell Signaling | 8178 | |
| CTCF抗体 | Cell Signaling | 2899 | |
| ERK抗体 | Cell Signaling | 9107 | |
| 磷酸化ERK抗体 | Cell Signaling | 9101 | |
| AKT抗体 | Cell Signaling | 9272 | |
| 磷酸化AKT抗体 | Cell Signaling | 9271 | |
| CREB抗体 | Cell Signaling | 9104 | |
| 磷酸化CREB抗体 | Cell Signaling | 9198 | |
| 血清分析 | 胰岛素ELISA试剂盒 | ALPCO | 80-INSMSU-E01 |
| 瘦素ELISA试剂盒 | ALPCO | 22-LEPMS-E01 | |
| 游离脂肪酸ELISA试剂盒 | Wako | NEFA-HR2 | |
| 油红O染色 | 油红O | Sigma | 00625 |
| EdU掺入 | Click-iT EdU成像试剂盒 | Thermo | C10340 |
| 活细胞成像 | BODIPY 493/503 | -- | -- |
| 活细胞纤毛cAMP检测 | cADDis BacMam cAMP传感器 | Molecular Montana | D0211G |
| 丁酸钠 | Molecular Montana | -- | |
| RT-qPCR | RNeasy脂组织RNA提取试剂盒 | QIAGEN | -- |
| M-MLV逆转录酶 | Invitrogen | 28025-013 | |
| TaqMan基因表达预混液 | Applied Biosystems | 4369016 | |
| MicroAmp光学反应板 | Applied Biosystems | N8010560 | |
| qScript cDNA合成试剂盒 | Quantabio | -- | |
| PowerUp预混液 | Invitrogen | -- | |
| 细胞培养 | Fluoromount-G封片剂 | SouthernBiotech | 0100-01 |
| Glycergel封片剂 | Dako | C056330-2 | |
| 免疫荧光 | 正常驴血清 | Jackson ImmunoResearch | 017-000-121 |
| 细胞培养 | 聚凝胺 | Millipore | -- |
| 0.45μm OVDF滤器 | Millipore | -- | |
| siRNA转染 | DharmaFECT试剂1 | Dharmacon | -- |
| 细胞培养 | Fugene6转染试剂 | Promega | -- |
| ATAC-seq | 洋地黄皂苷 | Promega | -- |
| MinElute PCR纯化柱 | Qiagen | -- | |
| NextSeq500测序仪 | Illumina | -- | |
| RNA-seq | Illumina HiSeq4000测序仪 | Illumina | -- |
| 活细胞成像 | IncuCyte活细胞分析成像系统 | Essen Bioscience | -- |
| 动物实验 | EchoMRI3in1™体成分分析仪 | Echo Medical System | -- |
| 综合实验室动物监测系统 | Columbus Instruments, Inc. | -- | |
| 60%高脂饮食 | ResearchDiets | D12492 | |
| 匹配对照饮食 | ResearchDiets | D12450J | |
| 繁殖鼠粮 | Lab Diet | #5058 | |
| BrdU | Abcam | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 前脂肪细胞纤毛体内功能验证 | 他莫昔芬给药年龄(3周龄或6周龄)、剂量200–250 mg/kg、连续两天口服灌胃;PAno cilia小鼠基因型Pdgfrα-CreERT Ift88flox/−;对照基因型Ift88flox/−或Pdgfrα-CreERT Ift88flox/+ 阅读提示:Methods 'In vivo animal studies'及Figure 2 legend、Figure S2 |
| 3T3-L1体外脂肪生成 | DHA cocktail浓度(0.4μg/ml胰岛素、0.02mM IBMX、0.1μM Dex、100μM DHA)处理前2天;对照cocktail以EtOH/DMSO替代DHA;分化后维持培养基含1μg/ml胰岛素;总分化时间4–8天 阅读提示:Methods 'In vitro Adipogenesis'及Figure 5、Figure S5 |
| FFAR4激动剂体内实验 | 9周龄雄性C57Bl/6J小鼠每日腹腔注射TUG891 35 mg/kg或10% DMSO载体;注射2周后第二周开始60% HFD或对照饮食3个月 阅读提示:Methods 'In vivo animal studies'及Figure 5F |
| 纤毛cAMP活细胞检测 | cADDis BacMam传感器感染量25μl,含2mM丁酸钠,37°C孵育6小时后换含1mM丁酸钠培养基16–24小时;成像每10秒一次共5分钟,激动剂30秒后加入 阅读提示:Methods 'Live Cell Ciliary cAMP assay'及Figure 6E–F、Figure S6E |
| ATAC-seq和转录因子motif分析 | 3T3-L1细胞100μM DHA或1μM Dex处理4小时,2个重复;ATAC-seq使用Tn5转座酶和自定Nextera引物;测序平台NextSeq500,2×76 bp 阅读提示:Methods 'ATACseq and TF motif enrichment analysis'及Figure 7E |