确认Treg细胞中miR-146a高表达
验证miR-146a而非miR-146b在Treg细胞中高表达。
用stem-loop Taqman实时RT-PCR区分miR-146a与miR-146b,并检测pri-miR-146a与pri-miR-146b在CD4+CD25+Treg与CD4+CD25−CD62Lhi初始T细胞中的表达。
Function of miR-146a in controlling Treg cell-mediated regulation of Th1 responses.
包含混合骨髓嵌合体小鼠体内模型、体外抑制实验、荧光素酶报告、免疫印迹及SOCS1缺失遗传验证
混合骨髓嵌合体小鼠(Mirn146a−/−/Foxp3KO、Mirn146a−/−/B6) Foxp3creSOCS1fl/fl小鼠 FACS纯化的CD4+CD25hi Treg细胞与CD4+CD25−CD62Lhi初始T细胞 Mirn146a−/−Stat1+/−与Mirn146a−/−Ifng−/−小鼠骨髓嵌合体
骨髓混合比例1:1,每只受体注射3-5×10^6细胞,受照剂量950 rads IFNγ中和抗体克隆XMG1.2,每只0.5 mg腹腔注射,自骨髓移植后3周开始每周给药 体外抑制实验:4×10^4初始CD4+T细胞与Treg按指定比例共培养72小时,CD3抗体刺激,辐照(2000 rads)去除T细胞的脾细胞 荧光素酶报告检测在转染后24小时读取,使用野生型或突变型Stat1 3′UTR 流式细胞因子检测:2×10^6脾细胞经PMA 50 ng/ml和离子霉素250 ng/ml刺激5小时,含Golgi plug
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证miR-146a而非miR-146b在Treg细胞中高表达。
用stem-loop Taqman实时RT-PCR区分miR-146a与miR-146b,并检测pri-miR-146a与pri-miR-146b在CD4+CD25+Treg与CD4+CD25−CD62Lhi初始T细胞中的表达。
区分miR-146a缺陷对Treg细胞数量与抑制功能的细胞内在与外在效应。
将miR-146a缺陷或足够小鼠骨髓与Ly5.1+B6或Ly5.1+Foxp3KO骨髓按1:1混合,移植入受照Rag2−/−或TCRβδ−/−受体,分析嵌合体Treg比例、数量、活化标志及存活。
判断miR-146a缺失是否影响Treg细胞总体体外抑制功能。
FACS纯化来自健康或患病嵌合体的miR-146a缺陷或足够Treg细胞,与野生型反应性CD4+T细胞按指定比例共培养,检测增殖。
确定miR-146a缺失Treg细胞存在时何种效应反应失调。
用流式检测Foxp3−CD4+、Foxp3+CD4+及CD8+T细胞中IFNγ、IL-4、IL-17分泌,并检测Treg细胞自身IFNγ产生。
检验IFNγ反应是否驱动miR-146a缺陷Treg细胞相关自身免疫病。
在混合骨髓移植后3周开始每周腹腔注射IFNγ中和抗体或同型对照IgG,观察临床、组织学及细胞因子变化。
确定miR-146a是否直接抑制小鼠Stat1表达。
构建含野生型或突变型Stat1 3′UTR的荧光素酶报告,转染miR-146a足够或缺陷CD4+T细胞,检测荧光素酶活性;并用免疫印迹检测Stat1、磷酸化Stat1、TRAF6、IRAK1蛋白。
通过Stat1单倍剂量不足和Ifng缺失区分Treg细胞与效应T细胞中miR-146a的作用。
构建Mirn146a−/−Stat1+/−/Foxp3KO与Mirn146a−/−Ifng−/−/Foxp3KO混合骨髓嵌合体,分析存活、IFNγ与IL-4产生及活化表型。
通过非miR-146a手段改变Treg细胞Stat1活化,验证其表型。
分析Foxp3creSOCS1fl/fl小鼠及Foxp3creSOCS1fl/fl/Foxp3KO嵌合体的Treg数量、Stat1活化、IFNγ产生与病理。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| RNA提取 | miRNeasy试剂盒 | Qiagen | -- |
| cDNA合成 | iScript cDNA合成试剂盒 | Bio-Rad | -- |
| 实时PCR | SYBR green | Applied Biosystems | -- |
| 荧光素酶报告 | psiCheck2荧光素酶报告质粒 | Promega | -- |
| Amaxa小鼠T细胞核转染试剂盒 | Lonza | -- | |
| 双荧光素酶报告检测系统 | Promega | -- | |
| 流式细胞术 | 抗CD4抗体 | eBioscience | -- |
| 抗CD8抗体 | eBioscience | -- | |
| 抗CD25抗体 | eBioscience | -- | |
| 抗CD62L抗体 | eBioscience | -- | |
| 抗CD103抗体 | eBioscience | -- | |
| 抗GITR抗体 | eBioscience | -- | |
| 抗ICOS抗体 | eBioscience | -- | |
| 抗CXCR3抗体 | eBioscience | -- | |
| 胞内染色 | 抗Foxp3抗体 | eBioscience | -- |
| 抗IL-4抗体 | eBioscience | -- | |
| 抗IFNγ抗体 | eBioscience | -- | |
| 抗CTLA-4抗体 | eBioscience | -- | |
| 流式细胞术 | 抗Ki67抗体 | BD bioscience | -- |
| 细胞因子检测 | 高尔基体阻断剂 | BD Biosciences | -- |
| Western blot | 抗TRAF6抗体 | Millipore | 04-451 |
| 抗IRAK1抗体 | Novus | NBP1-03169 | |
| 抗Stat1抗体 | Cell Signaling Technology | 9172 | |
| 抗磷酸化Stat1抗体 | Cell Signaling Technology | 9167 | |
| 抗Stat5抗体 | Cell Signaling Technology | 9363 | |
| 抗磷酸化Stat5抗体 | Cell Signaling Technology | 9359 | |
| 抗β-actin抗体 | Sigma | AC-74 | |
| 体内IFNγ中和 | IFNγ中和抗体(克隆XMG1.2) | -- | XMG1.2 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 混合骨髓嵌合体构建 | 骨髓混合比例1:1;每只受体3-5×10^6细胞;受照剂量950 rads;受体为Rag2−/−或Tcrβ/Tcrδ−/−小鼠;移植后6周或濒死时分析 阅读提示:Experimental procedures中Generation of bone-marrow chimeras mice and in vivo IFNγ neutralization小节及Fig. 1A、Fig. 5B图注 |
| 体内IFNγ中和 | 抗体克隆XMG1.2,0.5 mg/只,腹腔注射,自移植后3周开始每周给药;对照为同型匹配IgG 阅读提示:Experimental procedures中Generation of bone-marrow chimeras mice and in vivo IFNγ neutralization小节及Fig. 3A图注 |
| 体外抑制实验 | 4×10^4初始Ly5.1−CD4+CD25−CD62Lhi T细胞;与Treg按指定比例混合;CD3抗体刺激;辐照(2000 rads)脾细胞;共培养72小时;3H-TdR掺入最后8小时 阅读提示:Experimental procedures中In vitro suppression assay小节及Fig. 2A-B、Fig. 7A图注 |
| 荧光素酶报告实验 | psiCheck2质粒含野生型或突变型Stat1 3′UTR;Amaxa小鼠T细胞核转染试剂盒;转染后24小时检测;双荧光素酶报告系统 阅读提示:Experimental procedures中Luciferase reporter assay小节及Fig. 4B图注 |
| 细胞因子流式检测 | 2×10^6脾细胞;PMA 50 ng/ml与离子霉素250 ng/ml;含Golgi plug;37 °C刺激5小时 阅读提示:Experimental procedures中Flow cytometry and cytokine secretion assays小节 |
| Western blot检测 | 每泳道5×10^5细胞;β-actin归一化;抗体货号见原文;使用NIH Image J软件定量 阅读提示:Experimental procedures中Western blot analysis小节及Fig. 4C-D、Fig. 7B图注 |