细胞分离与鉴定
从废弃伤口敷料中分离贴壁细胞,并确认其成纤维细胞身份。
从RDEB慢性伤口敷料中分离贴壁细胞,通过间接免疫荧光检测FAP、Vimentin和CD45表达,以确认成纤维细胞谱系。
Maintenance of chronicity signatures in fibroblasts isolated from recessive dystrophic epidermolysis bullosa chronic wound dressings under culture conditions
研究包含体外细胞模型(原代成纤维细胞)的多维度功能与分子验证,包括细胞形态、衰老、增殖、迁移、纤维化功能(胶原收缩)、TGF-β信号通路和炎症因子表达,并设置多个对照组,属于多层级功能验证,符合“高”完整性标准。
RDEB慢性伤口敷料来源成纤维细胞(RDEB-CW) RDEB皮肤活检来源成纤维细胞(RDEB) 健康供体皮肤成纤维细胞(NHF) RDEB急性伤口敷料来源成纤维细胞(RDEB-AW)
样本类型:慢性伤口定义为取样时开放超过1年且取样后至少3个月未闭合;急性伤口定义为存在超过14天且在敷料收集后6周内闭合。 培养条件:细胞在低传代(passage)下使用,培养基为DMEM补充10% FBS。 处理剂量:细胞因子分泌实验使用LPS 1 μg/ml刺激24小时。 实验重复:多数实验n=3-4,形态学分析每组225个细胞,衰老染色每组约4000个细胞。 对照设置:使用NHF和RDEB皮肤活检成纤维细胞作为对照,并设置RDEB-AW以排除分离方法的影响。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从废弃伤口敷料中分离贴壁细胞,并确认其成纤维细胞身份。
从RDEB慢性伤口敷料中分离贴壁细胞,通过间接免疫荧光检测FAP、Vimentin和CD45表达,以确认成纤维细胞谱系。
评估RDEB-CW成纤维细胞在体外的形态变化和衰老特征。
测量细胞面积和突起数量,进行衰老相关β-半乳糖苷酶染色,检测Lamin B1亚细胞定位。
检测RDEB-CW成纤维细胞的增殖和迁移能力。
使用CellTiter-Blue®增殖实验和2D划痕迁移实验评估细胞功能。
评估RDEB-CW成纤维细胞的收缩能力和纤维化标志物表达。
进行胶原盘收缩实验,并通过Western blot和免疫荧光检测α-SMA、Collagen I和YKL-40的表达。
检测RDEB-CW成纤维细胞中TGF-β1信号通路的激活状态。
通过Western blot检测TGF-β1前体、TGFBR-II、SMAD2/3、p-SMAD2/3和TSP1的蛋白水平。
评估RDEB-CW成纤维细胞的炎症状态和癌症相关基因表达。
通过RT-qPCR检测IL-1β、IL-6、APOBEC3A/B/H的mRNA水平,通过流式细胞术(CBA)检测IL-1β和IL-6的分泌。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| L-谷氨酰胺 | Gibco | -- | |
| 免疫荧光 | 含DAPI的Fluoromount G封片剂 | Invitrogen | -- |
| Triton X-100 | -- | -- | |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| 细胞增殖实验 | CellTiter-Blue®试剂盒 | Promega | -- |
| 胶原收缩实验 | 大鼠尾I型胶原 | SCBT | sc-136,157 |
| 衰老染色 | 衰老相关β-半乳糖苷酶染色试剂盒 | Cell Signaling | -- |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| DNA酶I | Thermo Scientific | -- | |
| High Capacity cDNA反转录试剂盒 | Applied Biosystems | -- | |
| Brilliant III Ultra-Fast SYBR® Green QPCR预混液 | Agilent Technologies | -- | |
| SYBR Select预混液 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Stratagene Mx3005P实时荧光定量PCR仪 | Agilent Technologies | -- | |
| Western blot | RIPA裂解缓冲液 | Cell Signaling Tech. | -- |
| 蛋白酶抑制剂 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | SCBT | -- | |
| Pierce™ BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher | -- | |
| 硝酸纤维素膜 | Bio-Rad | -- | |
| PowerBlotter XL转印试剂盒 | Thermo Fisher | -- | |
| Odyssey CLx红外成像系统 | LI-COR Biosciences | -- | |
| 流式细胞术 | BD™ FACSCanto流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| BD™ CBA人炎症细胞因子试剂盒 | BD Biosciences | -- | |
| 免疫荧光成像 | EVOS FL细胞成像系统 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Fluoview FV10i共聚焦显微镜 | Olympus | -- | |
| 统计分析 | GraphPad Prism 7.0软件 | GraphPad Software Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 样本收集与培养 | 慢性伤口定义:取样时开放超过1年,取样后至少3个月未闭合;急性伤口定义:存在超过14天,且6周内闭合;细胞来源:皮肤活检或废弃敷料。 阅读提示:Methods 'Cell samples' |
| 细胞培养条件 | 培养基:DMEM+10% FBS;传代次数:低传代;培养温度:37°C,5% CO2。 阅读提示:Methods 'Cell samples' |
| 细胞功能实验 | 增殖实验:每孔细胞密度1×10^4/cm2,检测时间0、24、48、72小时;迁移实验:划痕后0、8、24小时;胶原收缩实验:1×10^5细胞/孔,胶原浓度1 mg/ml,测量时间0、24、48、72小时。 阅读提示:Methods 'Cell proliferation assay', '2D migration assay', 'Collagen disc contraction assay' |
| 分子检测 | Western blot:细胞裂解液制备,抗体稀释比例和孵育条件;RT-qPCR:使用TRIzol提取RNA,cDNA合成,qPCR条件;炎症因子检测:LPS浓度1 μg/ml,孵育24小时,CBA试剂盒。 阅读提示:Methods 'Western Blot', 'RNA extraction, complimentary DNA synthesis and quantitative PCR', 'Cytokine analysis in supernatant by flow cytometry' |
| 统计分析 | 数据以均值±SD表示;多组间比较使用one-way ANOVA with Tukey post-hoc,非正态数据使用Kruskal-Wallis with Dunn's multiple comparisons test;p<0.05为显著。 阅读提示:Methods 'Statistical analysis' |