鉴定烟曲霉表面HscA蛋白与宿主细胞结合
筛选能与宿主上皮细胞结合的烟曲霉表面蛋白。
对烟曲霉不同形态进行表面生物素化,提取蛋白与A549细胞孵育,通过免疫荧光和western blot检测结合蛋白,鉴定出HscA。
Aspergillus fumigatus hijacks human p11 to redirect fungal-containing phagosomes to non-degradative pathway.
多细胞系体外实验、原代细胞、重组蛋白、LC-MS/MS及临床队列SNP关联分析,含功能与机制验证
A549人肺上皮细胞系 原代人气道上皮细胞(pAEC) 人肺CD45+细胞及血液中性粒细胞 烟曲霉分生孢子感染模型
烟曲霉分生孢子感染复数(MOI)为10,rHscA/rHsp70浓度为10 μg/mL 免疫荧光定量:每实验至少10张图像,至少3次生物学重复 p11敲除(p11-KO)A549细胞及p11敲低(siRNA 125 nM)验证 A2ti-1抑制剂使用浓度100 μM处理2天 临床队列483例异基因造血干细胞移植患者,rs1873311 SNP分型
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
筛选能与宿主上皮细胞结合的烟曲霉表面蛋白。
对烟曲霉不同形态进行表面生物素化,提取蛋白与A549细胞孵育,通过免疫荧光和western blot检测结合蛋白,鉴定出HscA。
探究HscA在宿主细胞损伤、黏附和吞噬体成熟中的作用。
构建ΔhscA突变株,进行LDH释放实验、黏附和内化实验,检测吞噬体酸化、p47phox和Rab7招募;用rHscA包被乳胶珠验证。
寻找与HscA相互作用的宿主蛋白。
用rHscA与A549细胞蛋白提取物孵育,进行链霉亲和素纯化和LC-MS/MS,鉴定p11;用p11-KO细胞和免疫共沉淀验证。
验证p11对Rab7排除、Rab11/Sec15招募及分生孢子外排的影响。
在p11-KO、p11-KD细胞及A2ti-1处理细胞中感染烟曲霉,免疫荧光检测p11、Rab7、Rab11、Sec15;活细胞成像观察外排和转移。
评估p11基因多态性与疾病风险的关联。
在483例异基因造血干细胞移植患者中,对p11基因标签SNP进行分型,分析其与IPA风险的关联;构建A549-T/C细胞系验证SNP功能。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | F-12K营养混合物培养基 | Gibco | -- |
| 胎克隆III血清 | Cytiva | SH30109 | |
| 胰岛素-转铁蛋白-硒 | Thermo Fisher Scientific | 41400045 | |
| LHC-9培养基 | Gibco | 12680013 | |
| SAGM小气道上皮细胞生长培养基试剂盒 | Lonza | CC-3118 | |
| 潮霉素B | InvivoGen | ant-hg-1 | |
| 纤连蛋白 | Sigma-Aldrich | F1141 | |
| TrypLE表达酶 | Gibco | 12604-013 | |
| 真菌培养 | 刚果红 | Sigma-Aldrich | C6277 |
| 衣霉素 | Sigma-Aldrich | T7765 | |
| 荧光增白剂 | Sigma-Aldrich | 18909 | |
| 蛋白纯化 | Strep-Tactin XT离心柱试剂盒 | IBA Lifesciences | 2-4151-000 |
| EZ-Link Sulfo-NHS-LC-生物素 | Thermo Fisher Scientific | 21335 | |
| Western blot | NuPAGE 4%–12% Bis-Tris凝胶 | Thermo Fisher Scientific | NP0322BOX |
| iBlot 2凝胶转印设备 | Thermo Fisher Scientific | IB21001 | |
| 小鼠单克隆抗p11抗体 | BD | 610071 | |
| 兔单克隆抗Rab7抗体 | Cell Signaling Technology | 9367 | |
| 兔多克隆抗Rab11a抗体 | Cell Signaling Technology | 2413 | |
| 兔多克隆抗Sec15抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-66234 | |
| 免疫荧光 | LysoTracker红色DND-99 | Thermo Fisher Scientific | L7528 |
| 链霉亲和素-Alexa Fluor 488偶联物 | Thermo Fisher Scientific | S11223 | |
| 山羊多克隆抗小鼠IgG (H+L)-Alexa Fluor 488 | Thermo Fisher Scientific | A-11029 | |
| 山羊多克隆抗兔IgG (H+L)-DyLight 633 | Thermo Fisher Scientific | 35562 | |
| LC-MS/MS | 胰蛋白酶/Lys-C混合物,质谱级 | Promega | V5071 |
| QExactive HF质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | L3000001 |
| DharmaFECT 1转染试剂 | Horizon Discovery | T-2001-02 | |
| siRNA | ON-TARGETplus人S100A10 siRNA SMARTpool | Horizon Discovery | L-011766-00-0005 |
| 抑制剂处理 | A2ti-1 | MedChemExpress | HY-136465 |
| 乳胶珠实验 | 红色荧光乳胶珠,平均粒径2.0 μm | Sigma-Aldrich | L3030 |
| 黄绿色荧光乳胶珠,平均粒径1.0 μm | Sigma-Aldrich | L1030 | |
| 磁性乳胶珠,平均粒径1.0 μm | Sigma-Aldrich | 75597 | |
| LDH释放实验 | CyQUANT LDH细胞毒性实验 | Thermo Fisher Scientific | C20300 |
| qPCR | iTaq通用SYBR Green预混液 | Bio-Rad | 1725122 |
| cDNA合成 | Maxima H Minus第一链cDNA合成试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | K1651 |
| RNA提取 | 通用RNA纯化试剂盒 | Roboklon | E3598 |
| DNA提取 | PureLink基因组DNA迷你试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | K182001 |
| 免疫共沉淀 | GFP-trap磁性琼脂糖 | ChromoTek | gtma-20 |
| Dynabeads蛋白G | Thermo Fisher Scientific | 10003D | |
| CD45+细胞分离 | CD45抗体,抗人,生物素,REAfinity | Miltenyi Biotec | 130-110-768 |
| 抗生物素微珠超纯 | Miltenyi Biotec | 130-105-637 | |
| 中性粒细胞分离 | PolymorphPrep分离液 | Progen | -- |
| 红细胞裂解 | 红细胞裂解缓冲液 | Roche | 11814389001 |
| 组织消化 | Dispase(来源于多粘芽孢杆菌) | Corning | 734-1312 |
| 猪胰弹性蛋白酶 | Sigma-Aldrich | E7885 | |
| 牛胰DNase I | Sigma-Aldrich | DN25 | |
| 基因分型 | KASPar检测 | LGC Genomics | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 烟曲霉感染宿主细胞 | MOI=10;感染时间8 h(A549、H441、pAEC、T7细胞)、3 h(肺CD45+细胞)、2 h(PMNs和PBMCs);rHscA/rHsp70浓度10 μg/mL 阅读提示:Methods:Infection experiments of cells |
| 免疫荧光定量 | 每实验至少计数10张图像,至少3次生物学重复;p11+吞噬杯百分比计算基于贴附分生孢子 阅读提示:Methods:Immunofluorescence and microscopy |
| p11敲除和敲低 | siRNA浓度125 nM;A2ti-1浓度100 μM处理2天;p11-KO细胞系通过CRISPR/Cas9构建 阅读提示:Methods:Knockdown and knockout of human p11 gene |
| 临床队列SNP分析 | 483例异基因造血干细胞移植患者;rs1873311 SNP;Fine-Gray竞争风险模型校正年龄、性别和显著临床变量 阅读提示:Methods:Genetic association study;SNP selection and genotyping;Quantification and statistical analysis |
| 活细胞成像 | A549细胞5×10^4接种,MOI=5感染4 h;Zeiss LSM 780共聚焦显微镜,20x物镜,4 h拍摄,间隔1-10 s 阅读提示:Methods:Immunofluorescence and microscopy(live cell imaging部分) |