LegK4对高尔基体和酵母生长的效应
验证LegK4的激酶活性是否引起细胞表型
将EGFP标记的LegK4-∆1–58-wt、LegK4-∆1–58-DA或EGFP对照瞬时转染HeLa细胞,24小时后免疫荧光观察高尔基形态;将LegK4构建体在半乳糖诱导启动子下转化酵母,观察生长。
A Legionella pneumophila Kinase Phosphorylates the Hsp70 Chaperone Family to Inhibit Eukaryotic Protein Synthesis.
包含体外纯化蛋白生化实验、细胞系转染、细菌感染模型及多聚核糖体分析等多个独立证据层级,并进行功能与机制验证。
HEK-293T细胞系 HeLa细胞系 嗜肺军团菌感染模型 酿酒酵母BY4741菌株
LegK4-∆1–58-wt及其激酶失活突变体D271A(LegK4-DA)的构建与使用 感染实验使用L.p. LP02菌株、ΔlegK4及ΔdotA突变株,MOI=100 使用1 µM Thapsigargin处理6小时诱导UPR HPG掺入实验检测整体翻译,HPG脉冲1小时 多聚核糖体分离使用10-50%蔗糖梯度,超速离心条件37,000 rpm 2.5小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证LegK4的激酶活性是否引起细胞表型
将EGFP标记的LegK4-∆1–58-wt、LegK4-∆1–58-DA或EGFP对照瞬时转染HeLa细胞,24小时后免疫荧光观察高尔基形态;将LegK4构建体在半乳糖诱导启动子下转化酵母,观察生长。
鉴定LegK4直接磷酸化的宿主蛋白
将纯化的LegK4-∆1–58-wt与HEK-293T细胞裂解液及ATP-γ-硫代磷酸或苄基-N6-取代的ATP类似物孵育,免疫沉淀硫代磷酸化蛋白,LC-MS/MS鉴定。
确认LegK4磷酸化Hsp70并确定磷酸化位点
使用纯化的Hsc70、Hsp72、BiP及其点突变体与LegK4孵育,通过Western blot和LC-MS/MS检测磷酸化。
验证LegK4在感染期间磷酸化胞质Hsp70
用L.p. WT、ΔlegK4、ΔdotA或回补菌株感染HEK-293T-FCγRIII细胞,使用磷酸化特异性抗体检测Hsc70/Hsp72 pT495和BiP pT518。
评估磷酸化对Hsc70功能的影响
用LegK4磷酸化重组Hsc70,通过孔雀石绿ATPase测定和荧光素酶折叠测定比较磷酸化与未磷酸化Hsc70的活性。
验证LegK4表达是否抑制UPR和整体蛋白合成
转染EGFP-LegK4-∆1–58-wt或突变体,用Thapsigargin诱导UPR,通过FACS检测BiP水平;用HPG掺入实验检测整体翻译。
探究LegK4对翻译机器及Hsp70与核糖体关联的影响
转染LegK4-∆1–58-wt或-DA,或JG-98处理,进行蔗糖梯度多聚核糖体分离,UV检测核糖体图谱,并Western blot检测各组分中Hsp70和RPL10A。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Axenia BioLogix | -- | |
| 转染 | Fugene HD转染试剂 | Promega | -- |
| opti-MEM培养基 | Gibco | -- | |
| Western blot | 抗硫代磷酸酯抗体 | Abcam | Ab92570 |
| BiP抗体 | Proteintech | 11587-1-AP | |
| CHOP抗体 | Proteintech | 15204-1-AP | |
| HSC70/HSP70抗体 | Enzo | ADI-SPA-820 | |
| RPL10A抗体 | NovusBio | NBP2-47298 | |
| GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 2118 | |
| FLAG抗体 | Invitrogen | MA1-91878-D680 | |
| 免疫荧光 | GM-130抗体 | BD | 610823 |
| Alexa-488山羊抗兔 | Invitrogen | -- | |
| Alexa-568山羊抗鼠 | Invitrogen | -- | |
| 流式细胞术 | Zombie Aqua活性染料 | BioLegend | -- |
| 抗兔Alexa-647 | Invitrogen | -- | |
| HPG掺入实验 | AlexaFluor-647叠氮化物 | Thermo Fisher | -- |
| 高炔丙基甘氨酸 | ClickChemistryTools | -- | |
| 药物处理 | 毒胡萝卜素 | Enzo | -- |
| MG-132 | Selleckchem | -- | |
| JG-98 | -- | -- | |
| 多聚核糖体分离 | RNaseOUT | Invitrogen | -- |
| 蛋白纯化 | 镍-次氮基三乙酸琼脂糖树脂 | Qiagen | -- |
| Superdex 200柱 | Amersham Biotech | -- | |
| ATPase测定 | 孔雀石绿 | Sigma Aldrich | -- |
| 荧光素酶折叠 | 萤火虫荧光素酶 | Promega | -- |
| LC-MS/MS | 胰蛋白酶 | Promega | -- |
| Asp-N蛋白酶 | Promega | -- | |
| ZipTip吸头 | Millipore | -- | |
| nanoACQUITY超高效液相色谱 | Waters | -- | |
| LTQ Orbitrap Velos质谱仪 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| LegK4诱导的高尔基体片段化 | 转染质粒(EGFP-LegK4-∆1–58-wt、LegK4-DA或EGFP对照)、转染时间24小时、计数100个EGFP阳性细胞、三次重复 阅读提示:Figure 1A和1B图注及对应的Methods中免疫荧光部分 |
| L.p.感染实验 | L.p.菌株(LP02 WT、ΔlegK4、ΔdotA、回补菌株)、感染复数(MOI)100、感染时间1小时、FCγRIII细胞、opsonization抗体浓度1:2000 阅读提示:Methods中“L.p. Infections”部分及Figure 2D图注 |
| 体外Hsc70 ATPase和折叠实验 | Hsc70浓度、LegK4-∆1–58-wt用量、ATP浓度1 mM、DnaJA2浓度、孵育时间1小时、温度37°C、重复数6次 阅读提示:Methods中“ATPase assays with Malachite Green”和“Luciferase Refolding”部分及Figure 3A和3B图注 |
| UPR抑制实验 | Thapsigargin浓度1 µM、处理时间6小时、MG-132预处理浓度10 µM处理1小时、FACS检测BiP 阅读提示:Methods中“BiP Expression Assay for FACS”部分及Figure 3D图注 |
| 多聚核糖体分析 | 蔗糖梯度10-50%、超速离心37,000 rpm 2.5小时、JG-98浓度20 µM处理3小时、放线菌酮浓度100 µg/mL 阅读提示:Methods中“Polysome Fractionation and Protein Precipitation for Western Blotting”部分及Figure 4图注 |