建立小鼠角膜感染模型验证ROS清除细菌
验证NADPH氧化酶产生的ROS对铜绿假单胞菌清除的作用
用PAO1或ΔpscD突变株感染C57BL/6和gp91phox−/−小鼠角膜,24小时后量化角膜混浊和细菌载量,并检测中性粒细胞浸润。
Pseudomonas aeruginosa Effector ExoS Inhibits ROS Production in Human Neutrophils.
含体外原代中性粒细胞、ADP-核糖基化生化实验、体内小鼠角膜感染模型,且完成Ras(R41K)功能回补和机制验证
人外周血原代中性粒细胞 C57BL/6小鼠角膜感染模型 gp91phox−/−小鼠角膜感染模型
细菌感染复数(MOI 30)及感染时间(ROS检测90分钟,蛋白磷酸化15-60分钟) 铜绿假单胞菌菌株:PAO1、ΔpscD、Δ3TOX、ΔexoST、ΔexoS、ΔexoT、exoS(A-)、exoT(A-)、exoST(A-) 小鼠角膜感染剂量1×10^5 CFU,感染后24小时检测角膜混浊和CFU Tat-Ras(R41K)使用浓度(0.01-3 μM)及预处理30分钟 ADP-核糖基化反应中ExoS 0.8 μM、NAD 200 μM、14-3-3ζ 3.2 μM,孵育6.5小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证NADPH氧化酶产生的ROS对铜绿假单胞菌清除的作用
用PAO1或ΔpscD突变株感染C57BL/6和gp91phox−/−小鼠角膜,24小时后量化角膜混浊和细菌载量,并检测中性粒细胞浸润。
确定T3SS效应蛋白是否抑制中性粒细胞ROS产生,并鉴定关键效应蛋白及其活性域
用人外周血中性粒细胞感染多种铜绿假单胞菌菌株,化学发光法检测ROS;使用基因缺失株和点突变株明确ExoS和ExoT的ADPRT活性而非Rho-GAP活性负责阻断ROS。
验证ExoS和ExoT的ADPRT活性是否干扰PI3K信号通路,并确定Ras是否为ExoS的靶点
感染中性粒细胞后Western blot检测Akt和p40phox磷酸化;检测Ras迁移率变化确认ADP-核糖基化;使用纯化蛋白进行体外ADP-核糖基化实验和PI3Kγ结合实验。
验证阻止Ras Arg41 ADP-核糖基化能否逆转ExoS依赖的ROS阻断并增强细菌杀伤
通过Tat肽将Tat-Ras(R41K)或Tat-Ras导入中性粒细胞,检测ROS产生和细菌存活(庆大霉素保护实验)。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| ROS检测 | 鲁米诺 | Sigma-Aldrich | 123072 |
| 人红细胞超氧化物歧化酶 | Sigma-Aldrich | S9636 | |
| 人红细胞过氧化氢酶 | Millipore | 219008 | |
| 中性粒细胞分离 | Ficoll-Paque Plus密度梯度分离液 | GE Healthcare | 17-1440-03 |
| 葡聚糖 | Sigma-Aldrich | 31392 | |
| 红细胞裂解液 | eBioscience | 00-4333-57 | |
| Western blot | 蛋白酶抑制剂混合物 | Cell Signaling Technology | 5871 |
| 细胞裂解液 | Cell Signaling Technology | 9803 | |
| 免疫荧光染色 | DAPI溶液 | Pierce | 62248 |
| PI3Kγ结合实验 | 人PI3Kγ活性全长重组蛋白 | SignalChem | P29-10H |
| ADP-核糖基化反应 | 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 | Sigma-Aldrich | N1636 |
| 人14-3-3ζ组氨酸标签蛋白 | Sigma-Aldrich | Z3402 | |
| 细菌生物素化 | 磺基-NHS-LC-生物素 | ThermoFisher | 21327 |
| PI3K抑制 | PI3K抑制剂AS-605240 | Selleckchem | S1410 |
| PI3K抑制剂GDC-0941 | Selleckchem | S1065 | |
| Ras活性检测 | 活性Ras检测试剂盒 | Cell Signaling Technology | 8821 |
| Western blot | Akt兔多克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 9272 |
| 磷酸化Akt兔多克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 9275 | |
| p40phox抗体 | Santa Cruz Biotechnology | Sc-48388 | |
| 磷酸化p40phox兔多克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 4311 | |
| Ras兔多克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 3965 | |
| GRB2兔多克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 3972 | |
| 流式细胞术 | 链霉亲和素-APC | eBioscience | 17-4317-82 |
| 免疫荧光染色 | Alexa Fluor 488山羊抗大鼠IgG二抗 | Life Technologies | A-11006 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠角膜感染模型 | 小鼠品系(C57BL/6和gp91phox−/−)、细菌剂量(1×10^5 CFU)、感染后检测时间(24小时)、样本量(每组5-9只) 阅读提示:STAR Methods中“In vivo model of corneal infection”及Figure 1图注 |
| 中性粒细胞ROS检测 | 中性粒细胞来源(健康供者外周血)、感染复数(MOI 30)、检测时间(90分钟)、化学发光底物(鲁米诺500 μM) 阅读提示:STAR Methods中“ROS measurement”及Figure 2图注 |
| Western blot检测信号通路磷酸化 | 感染后检测时间点(15、30、60分钟)、抗体货号及稀释比例(文中未明确说明稀释比例)、重复次数(3-5次) 阅读提示:STAR Methods中“Western Blot analysis”及Figure 3图注 |
| Tat-Ras(R41K)递送及功能回补 | Tat-Ras(R41K)浓度范围(0.01-3 μM)、预处理时间(30分钟)、感染复数(MOI 30)、庆大霉素浓度(400 μg/ml)及处理时间(30分钟) 阅读提示:STAR Methods中“Proteinase K protection assay”和“In vitro neutrophil survival assay”及Figure 4图注 |
| 体外ADP-核糖基化及PI3Kγ结合实验 | ExoS浓度(0.8 μM)、NAD浓度(200 μM)、14-3-3ζ浓度(3.2 μM)、孵育时间(6.5小时)、PI3Kγ浓度(0.08 μM) 阅读提示:STAR Methods中“In vitro ADP-ribosylation of Ras”和“Cell-free PI3Kγ affinity assay” |