负载ALK-PROTAC的阿仑膦酸矿化纳米粒通过破坏线粒体相关反馈逆转ALK+ NSCLC对PROTAC治疗的耐药和反弹效应

Alendronate-mineralized nanoparticles loaded with ALK-PROTAC reverse the resistance and rebound effects of ALK+ NSCLC to PROTAC therapy by disrupting the mitochondria-linked feedback

作者信息Jing Zhang, Liuqing Yang, Zhicheng Yan, Qinghua Wu, Xiaojia Jiao, Meifang Chen, Hua Zhang, Wenbing Dai, Xueqing Wang, Qiang Zhang, Bing He
PMID42999747
发布时间2026-10
DOI10.1016/j.ajps.2026.101205

实验完整度

高

含体外细胞模型、无偏转录组/代谢组、体内皮下移植瘤模型,并做功能与机制验证

主要模型

ALK+ NSCLC H3122细胞系 ALK阴性H1299和A549细胞系 ALCL Karpas 299细胞系 BALB/c裸鼠H3122皮下移植瘤模型

重点核对

AP浓度与处理时间:AP 100 nM,24 h;撤药后0和72 h采集 Aln及纳米粒浓度:Aln 50 µM,Aln NPs/AP NPs/Aln–AP NPs 50 µM,处理48–72 h 体内给药剂量:Aln 5 mg/kg,AP 10 mg/kg,静脉注射;瘤内AP 1.5 mg/kg ALP+模型:H3122(EML4–ALK融合)与Karpas 299(NPM–ALK融合),ALK阴性对照H1299、A549 转染敲低:LNP包载siRNA敲低HK2,knockdown维持5 d

摘要

靶向蛋白降解技术——尤其是蛋白水解靶向嵌合体(PROTAC)——近来已成为癌症治疗中的有力工具。然而,肿瘤细胞是否能够对蛋白水解产生即时响应、进而导致获得性耐药和治疗效果下降,目前尚不清楚。这一关键知识空白促使我们探究其潜在机制并开发预防策略。在此,我们合成了一种靶向间变性淋巴瘤激酶重排非小细胞肺癌(ALK+ NSCLC)的PROTAC分子,称为ALK-PROTAC(AP)。我们证实了AP撤药后存在即时适应性耐药反应,其特征为ALK快速再表达和细胞增殖加速。机制上,这些适应性反应由一系列代谢重塑事件驱动,包括葡萄糖和嘌呤代谢增强,以及活性氧(ROS)和缺氧反应相关基因上调。这些过程与线粒体功能密切相关,从而在AP撤药后增加ALK+ NSCLC细胞的能量产生、上调线粒体抗凋亡蛋白并增强Yes相关蛋白1(YAP1)的转录活性。为克服这一耐药,我们利用双膦酸盐的代谢干扰特性,特别是阿仑膦酸钠(Aln),其通过抑制甲羟戊酸途径诱导线粒体功能障碍和代谢扰动。我们随后开发了包载AP的阿仑膦酸-钙配位纳米粒(Aln–AP NPs)。正如预期,Aln–AP NPs破坏了代谢谱、诱导线粒体功能障碍并消除了AP诱导的抗凋亡蛋白和YAP1上调。该干预在体外和体内均显著延迟了ALK再表达并改善了治疗效果。总体而言,这些发现支持代谢干预作为对抗PROTAC介导蛋白水解即时耐药的有效策略,解决了该领域的关键挑战,拓展了靶向蛋白降解的范围,并为优化治疗疗效提供了新方法。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
ALK+ NSCLC细胞是否会对ALK-PROTAC降解产生即时适应性耐药,以及能否通过代谢干预克服该耐药?
核心机制
AP撤药后,肿瘤细胞通过代谢重塑(增强葡萄糖/嘌呤代谢、ROS和缺氧反应)和线粒体功能适应,增加ATP供应并上调Bcl-xL、Bcl-2、Mcl-1和YAP1,驱动ALKP再表达和增殖反弹;Aln抑制甲羟戊酸途径,破坏线粒体功能和代谢,从而削弱该反馈。
主要证据
在H3122细胞中AP诱导浓度和时间依赖性ALK降解(DC50 28 nM),撤药后72 h ALK恢复;转录组和代谢组显示代谢重塑;Aln及Aln–AP NPs抑制甲羟戊酸途径(mevalonate和IPP积累)、降低ATP、增加ROS并下调抗凋亡蛋白和YAP1;体外协同(CI<1)及H3122皮下移植瘤模型中Aln–AP NPs抑瘤效果优于单药。
研究意义
作者提出代谢干预是对抗PROTAC介导蛋白水解即时耐药的有效策略,可拓展靶向蛋白降解的应用范围,并为优化基于PROTAC的癌症治疗提供新思路。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

合成与表征ALK-PROTAC(AP)

获得靶向ALK的PROTAC分子并确认其结构、纯度和降解活性。

将ceritinib与pomalidomide通过PEG linker偶联合成AP,并用1H NMR、MS、UV-Vis和HPLC进行结构确认和纯度分析;在H3122细胞中检测AP对ALK和pALK的降解。

2

评估AP撤药后的适应性耐药反应

验证AP撤药后ALK是否再表达及细胞增殖是否反弹。

H3122细胞经100 nM AP处理24 h后撤药,在0和72 h检测ALK/pALK表达、细胞增殖、转录组和ATP水平。

3

代谢组学分析Aln对H3122细胞代谢的影响

明确Aln是否阻断甲羟戊酸途径并扰乱线粒体相关代谢。

H3122细胞经Aln或Aln NPs处理后进行非靶向代谢组学分析,检测mevalonate、IPP、DMAPP等代谢物及葡萄糖、TCA循环中间产物。

4

验证Aln对AP诱导耐药相关蛋白和ALK再表达的影响

检验Aln能否抑制AP诱导的抗凋亡蛋白和YAP1上调并延迟ALK再表达。

H3122细胞经Aln联合AP处理或AP撤药后给予Aln,Western blot检测Bcl-xL、Bcl-2、Mcl-1、YAP1、ALK和pALK。

5

制备和表征Aln–AP NPs

构建共载Aln和AP的配位纳米粒并评价其理化性质和细胞摄取。

采用一步法将Aln溶液和脂质溶液滴加入CaCl2溶液制备Aln–AP NPs,检测粒径、PDI、zeta电位、稳定性、包封率和细胞摄取。

6

体外评价Aln–AP NPs的抗肿瘤活性和机制

验证Aln–AP NPs是否协同抑制H3122细胞增殖并破坏线粒体功能。

H3122细胞经Aln NPs、AP NPs或Aln–AP NPs处理后检测细胞活力、ATP、ROS、线粒体超氧化物、脂质过氧化物、线粒体膜电位和线粒体形态。

7

体内评价Aln–AP NPs的抗肿瘤效果

在H3122皮下移植瘤模型中比较Aln–AP NPs与单药及物理混合物的疗效。

BALB/c裸鼠皮下接种H3122细胞建立移植瘤模型,静脉注射Aln NPs、AP NPs、Aln–AP NPs或混合物,监测肿瘤体积和重量,进行TUNEL和H&E染色。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
1,2-二油酰-sn-甘油-3-磷酸Avanti Polar Lipids, Inc.--
胆固醇Sigma Aldrich Corporation--
DLin-MC3-DMAAvt (Shanghai) Pharmaceutical Tech Co., Ltd.--
1,2-二硬脂酰-sn-甘油-3-磷酸胆碱Avt (Shanghai) Pharmaceutical Tech Co., Ltd.--
1,2-二肉豆蔻酰-rac-甘油-3-甲氧基聚乙二醇-2000Avt (Shanghai) Pharmaceutical Tech Co., Ltd.--
小干扰RNAGuangzhou Ribo Biotechnology Co., Ltd.--
聚偏二氟乙烯膜Merck Millipore--
膜蛋白提取试剂盒Beijing Solarbio Science & Technology Co., Ltd.EX1110
兔抗ALK抗体Cell Signaling Technology3633
兔抗磷酸化ALK (Tyr1507)抗体Affinity Biosciences Ltd.AF3489
兔抗CD147抗体Abcam Trading (Shanghai) Co., Ltd.ab108308
兔抗MCT1抗体Abcam Trading (Shanghai) Co., Ltd.ab179832
兔抗HK2抗体Abcam Trading (Shanghai) Co., Ltd.ab209847
兔抗LDH抗体Abcam Trading (Shanghai) Co., Ltd.ab52488
兔抗YAP1抗体Abcam Trading (Shanghai) Co., Ltd.ab52771
兔抗Bcl-xL抗体Abcam Trading (Shanghai) Co., Ltd.ab32370
兔抗Bcl-2抗体Abcam Trading (Shanghai) Co., Ltd.ab182858
兔抗Mcl-1抗体Abcam Trading (Shanghai) Co., Ltd.ab32087
兔抗RhoA抗体Abcam Trading (Shanghai) Co., Ltd.ab187027
兔抗钠钾ATP酶抗体Abcam Trading (Shanghai) Co., Ltd.ab76020
兔抗MCT4抗体Proteintech Group, Inc.22787-1-AP
鼠抗β-微管蛋白抗体Proteintech Group, Inc.66240-1-Ig
兔抗PFKP抗体Proteintech Group, Inc.13389-1-AP
兔抗GLUT3抗体Cloud-Clone Corp.PAB635Hu01
鼠抗GLUT3抗体Cloud-Clone Corp.MAB185Hu22
兔抗PKM2抗体Cloud-Clone Corp.PAA588Hu01
兔抗GAPDH抗体Beyotime Biotech Inc.AF1186
HRP标记山羊抗兔IgG (H + L)Beyotime Biotech Inc.A0208
HRP标记山羊抗鼠IgG (H + L)Beyotime Biotech Inc.A0216
CCK-8试剂盒----
CellTiter-Lumi™ Plus发光细胞活力检测试剂盒----
乳酸含量检测试剂盒----
Annexin V–FITC/PI试剂盒----
细胞周期与凋亡分析试剂盒----
2′,7′-二氯二氢荧光素二乙酸酯----
MitoSOX Red线粒体超氧化物荧光探针----
BODIPY 581/591 C11脂质过氧化探针----
四甲基罗丹明乙酯----
Hoechst 33342----
MitoTracker Deep Red线粒体荧光探针----
LysoTracker Green溶酶体荧光探针----
RPMI 1640培养基----
Dulbecco改良Eagle培养基----
胎牛血清----
基质胶----
RIPA裂解液----
BCA蛋白定量试剂盒----
Tanon-5200 Multi成像系统Tanon--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
AP撤药后适应性耐药检测
AP处理浓度100 nM、处理时间24 h、撤药后采集时间点0和72 h;H3122细胞
阅读提示:Results 3.2及Fig. 2A–2C图注
Aln及纳米粒体外处理
Aln及纳米粒浓度50 µM,处理48–72 h;AP浓度100 nM
阅读提示:Results 3.3–3.5及Fig. 3、Fig. 4、Fig. 6图注
体内抗肿瘤实验
H3122皮下移植瘤模型;Aln 5 mg/kg、AP 10 mg/kg静脉注射;瘤内AP 1.5 mg/kg;每组n=5–6
阅读提示:Results 3.6及Fig. 7图注;Materials and Methods 2.13
纳米粒制备
Aln 4.875 mg、CaCl2 13.32 mg、DOPA 21.72 mg、EPC 22.50 mg、胆固醇2.76 mg、DSPE-PEG2000 9.90 mg、AP 40 µg(体内4.875 mg);滴加速率0.5 ml/min,65 °C搅拌1.5 h
阅读提示:Materials and Methods 2.2
HK2敲低实验
LNP包载siRNA敲低HK2,knockdown维持5 d;siHK2联合AP处理
阅读提示:Results 3.2及Fig. S16、Fig. S17图注